幾乎所有的雜草都能在苗圃裡生長，如禾本科雜草馬唐、稗草、狗尾草、牛筋草、狗牙根、白茅；闊葉雜草黃花蒿、播娘蒿、馬齒莧、萹蓄、地錦、小飛蓬、小葉旋花、酢漿草；莎草科雜草香附子、水蜈蚣、碎米莎草、牛毛氈等。
防除特點
苗木的種類非常多，往往是不同種類的苗木交替栽植，而不同苗木的種類可選用的除草方法、藥劑種類也不一樣，如針葉類苗木防除闊葉雜草可使用乙氧氟草醚，但該藥劑對其他苗木則藥害嚴重。
扦插苗、實生苗、移栽苗對藥劑的耐藥性均不相同，扦插苗、剛移栽苗、小苗不宜用藥，等能用藥時雜草已經瘋長了。
苗木跟草坪等其他地被植物不同，其高矮、栽植的行間距差異很大，很難採取統一的藥劑、施藥方式進行防除。
由於苗圃闊葉雜草及香附子等均屬於雙子葉植物，大部分選擇性藥劑在除雜草的同時對苗木也有危害，所以防治是個難題。
防除技術
無論哪種防除方法都要做到及時、得法。
農業防治 9月中旬至10月中旬，很多雜草將要結籽，苗木準備落葉越冬，對於行間距較大的苗圃可使用小型機械旋耕，既可除草，又能增加土壤營養。
人工防除 及時發現零星或大植株雜草人工拔除；行間距較小而雜草發生量較少的可中耕除草。
物理防除 在冬季或是春季，使用除草膜（深色地膜）對裸露地面進行覆蓋，既可保溼、提高地溫，又能抑制雜草萌發。
生物防除 禾長蠕孢稗草專化型真菌防除稗草；較高苗圃地可以和養殖結合起來，一般一畝地20只雞即可起到除草效果。
化學除草 針對苗木不同種類、不同種植方式如苗床、移栽、營養缽、露天等選擇合適的化學藥劑進行快速防除；封閉+莖葉處理；選擇+滅生；內吸傳導+觸殺。
化學除草技術原則
苗木種類眾多，種植方式及大小不同，沒有什麼藥劑是通用的；不同的化學藥劑對苗木的生長週期、株高甚至是品種都有不同的要求。
防除原則 以封閉為主，莖葉處理為輔，封殺結合；莖葉處理一定要早，除小草；無論除草劑多麼安全，在苗圃裡除闊葉雜草，都要儘可能地避開新葉和嫩芽。
栽植前土壤處理 如果在整地前已經有雜草生長，可使用淇林草枯郎滅生性除草劑50倍至100倍液進行噴霧，即每畝用量300毫升至600毫升，可防除絕大多數雜草。5天至7天后雜草逐漸死亡，進行翻地整理，3天至5天后即可進行播種或鋪種草皮。
移栽後早期（一個生長週期以內） 如果雜草未發生可使用淇林圃坪封40毫升至50毫升或淇林淇勝25克兌水15公斤對地面進行噴霧150平方米進行封閉，圃坪封還可用於多數播種地、苗床等，可以控制雜草60天至90天不萌發，淇勝持效期可達180天以上。
苗木和綠籬移栽成活株高達30釐米以上，如果多種雜草混生，在雜草幼嫩時選無風無雨天氣每畝使用淇林萊駿200毫升兌水30公斤至45公斤進行噴霧，可防除多數雜草，還可封閉雜草60天至90天。
如果發生禾本科雜草，5葉至7葉期可用淇林禾草淨25毫升至30毫升兌水15公斤全田噴霧；雜草較大或是防除多年生禾本科雜草時用藥量加倍。
移栽後後期（一個完整的生長週期以後） 禾本科雜草。苗木整個生長季節均可使用淇林禾草淨25毫升至30毫升（5葉以下小草）或50毫升至60毫升（草齡較大或是多年生雜草）兌水15公斤噴施330平方米。
闊葉和莎草。可使用淇林三莎清4克兌水15公斤定向噴施半畝地；也可在雜草幼嫩時選無風無雨天氣每畝使用淇林萊駿200毫升兌水30公斤至45公斤進行噴霧，可防除多數雜草，還可封閉雜草60天至90天。
多種雜草混生。在雜草幼嫩時選無風無雨天氣每畝使用淇林萊駿200毫升兌水30公斤至45公斤進行噴霧，可防除多數雜草，還可以封閉雜草60天至90天；還可使用淇林禾草淨25毫升至30毫升加淇林三莎清4克兌水15公斤定向噴施330平方米。
喬木。行間距較大，植株胸徑達5釐米以上，可使用淇林草枯郎150毫升至300毫升兌水15公斤定向噴施330平方米。
雜草萌發前或防除後。為節省成本和增長雜草防除時間，建議使用淇林圃坪封畝用量150毫升或淇林淇勝100克兌水45公斤至60公斤噴霧，可持效60天至180天。
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