小鼠胚胎幹細胞(ESC)來源於囊胚時期的內細胞團,因其發育成胚胎所有三胚層細胞的能力而被視為多潛能性細胞,但其幾乎不對胚胎外組織的形成有任何貢獻。而全能性細胞,如一細胞合子(Zygote)及二細胞時期(2-Cell)的單個卵裂球,既能發育形成胚胎組織,又可以發育成胚胎外組織。體外培養的小鼠胚胎幹細胞中,有極小部分(1%-5%)細胞具有擴展的多能性,即這類細胞既可以向胚胎組織分化(嵌合入小鼠組織器官),也具有向胚外組織分化的潛能(嵌合入胎盤)。此類細胞也被稱為
2C樣細胞(2CLC, 2-Cell like cell)。前期的研究發現,2CLC中存在高水平的MERVL轉錄。此外,包括Zscan4基因家族在內的大量二細胞特異性基因,也被顯著地激活。然而,目前對2C狀態調節的理解在很大程度上,聚焦於鑑定和表徵ESC富集的編碼或非編碼分子,這些分子將ESC的細胞命運潛能限制為多能性狀態,而非將其激活為2C狀態。例如,先前的研究已經揭示了許多限制小鼠ESC中的2C狀態的關鍵因子,包括LSD1, CAF-1,KAP1,G9A,miR-34a,PRC1.6,EP400-TIP60複合物和PIAS4 SUMO E3連接酶等。與之相反的是,Dux是第一個被鑑定為在ESC中,可正向調節並激活2C狀態的轉錄因子(Cell Research丨高紹榮團隊全面描繪DUX在小鼠胚胎基因組激活中的作用;專家點評Nature Genetics | 張毅團隊證明體內DUX並非小鼠胚胎基因組激活的關鍵因子)。但是,Dux下游如何調節2C狀態的詳細分子事件還未被闡述。2020年2月6日,同濟大學高紹榮教授課題組聯合美國西奈山醫學院(現哥倫比亞大學歐文醫學中心)王建龍(Jianlong Wang)教授課題組在 Cell Stem Cell 雜誌在線發表了題為“DUX-miR-344-ZMYM2-Mediated Activation of MERVL LTRs Induces a Totipotent 2C-like State” 的研究論文。揭示了DUX-miR-344-ZMYM2介導的MERVL激活在全能性樣細胞產生過程中的作用。
在本項研究中,研究人員構建了Zscan4-GFP;2C::tdTomato雙報告系統來標記2CLC細胞系。通過對2CLC雙陽性(DR+/+)細胞中的核小體全局分佈及基因表達分析,確立了非編碼RNA miR-344在2CLC形成中的正向調節作用。為進一步進行分子機制研究,研究人員利用CRISPR-dCas9系統,構建了MERVL與miR-344分別激活的細胞系,結合測序分析及體內嵌合體實驗,證明了2C的開放染色質使轉錄因子(如Dux)更容易激活miR-344,而miR-344又通過多層級參與激活了MERVL。
首先,miR-344經轉錄後抑制ZMYM2和LSD1,而ZMYM2的去除導致LSD1在MERVL和2C特異性基因上的結合丟失。其次,LSD1可以作為賴氨酸特異性去甲基酶使H3K4me1和H3K4me2發生去甲基化,造成轉錄失活。因此,miR-344對LSD1的轉錄後抑制,導致MERVL和2C特異性基因的激活。第三,Dux還可以直接激活MERVL和相關的2C基因的表達。與DUX過表達一致的是,在早期胚胎髮育中siZmym2的注射可造成部分卵裂球的發育阻滯,此類胚胎的免疫染色顯示ZSCAN4和MERVL在囊胚階段的異常激活。最後,ZMYM2可以直接結合並抑制Gata2,Gata2是一種在激活MERVL/MT2和2C基因過程中發揮作用的關鍵轉錄因子。
總結
因此,研究確立了miR-344是2CLC擴展多能性和植入前發育的第一個非編碼正向調控因子,通過DUX→miR-344-|Zmym2/Lsd1-|MERVL通路來調控2CLC的全能性,增加了全能性分子控制及其向多能性轉變研究的豐富性。
美國西奈山醫學院王建龍課題組楊藩博士,黃欣博士,以及同濟大學高紹榮教授課題組博士研究生臧茹歌,為本文的共同第一作者。同濟大學生命科學與技術學院陳嘉瑜副教授也參與該研究。高紹榮教授與王建龍教授為本文的共同通訊作者。
原文鏈接:
https://doi.org/10.1016/j.stem.2020.01.004
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