在波波維奇的執教生涯當中，如果要評選一個最讓波波維奇頭疼的球員，恐怕非科比莫屬。如果不是科比的阻擊，恐怕波波維奇的冠軍數絕對不止5個。當年的OK組合，馬刺由於有鄧肯的緣故，並不懼怕奧尼爾的內線攻擊，卻總是對科比的無解中投無可奈何。這也導致波波維奇在後期極度看中中投的能力。
98-99賽季：西部半決賽。
當時的科比還是一個20出頭的毛頭小夥，兩隻球隊的主角還是鄧肯和奧尼爾。馬刺這一年拿下了隊史的第一座總冠軍，鄧肯也收穫了職業生涯第一個FMVP，期間西部半決賽與湖人交手，馬刺直接橫掃了湖人，奧尼爾算是一點便宜都沒有在鄧肯身上佔到。四場比賽鄧肯場均29分10.8籃板2蓋帽，奧尼爾場均23.8分13籃板，當時馬刺是輕鬆的過關，四場比賽也只有第二場贏得較為艱難。不過系列賽場均砍下21.3分6.5籃板3.5助攻的毛頭小子科比開始讓波波維奇注意了，第二戰他的28分差點掀翻了馬刺，這是科比季後賽第一次與馬刺交手，科比逐漸成長為聯盟外線大殺器。
2000/2001賽季，西部決賽
首戰面對馬刺，下半場砍下28分，全場砍下45分10籃板的兩雙數據，讓馬刺失去主場優勢。第二場28分7籃板的數據，主導了湖人第四節的反擊，讓鄧肯的40分10籃板成了徒勞。連輸兩個主場徹底讓這個系列賽失去懸念。，三場比賽拿到了36分9籃板8助攻的準三雙數據。他場均得分達到了33.3分，馬刺可以在內線很好的限制奧尼爾，卻限制不了科比。
2001/2002賽季：西部半決賽
這一年的走勢與前一年如出一轍，鄧肯率領的馬刺內線依舊在場面上壓制著奧尼爾，鄧肯29分17籃板的數據也蓋過了奧尼爾21分12籃板的數據。但科比卻卻依舊無可限制，他場均拿下26.2+5.4+4.8的數據，幫助湖人4比1戰勝了馬刺。
2002/2003賽季，西部半決賽
科比的表現依舊神勇，場均拿到了32.5分，5籃板及3.7次助攻，而湖人除了科比和奧尼爾之外再無穩定得分點。馬刺這邊除了鄧肯28分12籃板的穩定發揮外，帕克，吉諾比利，鮑文等外線射手均有不錯的發揮，但馬刺的多點開花讓他們還是以4比2完成了復仇。關鍵的天王山之戰，科比得到36分，差一點率領湖人在第四節完成反擊，最後只是以2分輸掉。
2003/2004賽季，西部半決賽
馬刺依舊無法限制住科比，他在這場系列賽中場均貢獻26.3分，6.3籃板外加5.8次助攻，奧尼爾也首次在同馬刺的季後賽中，數據壓倒鄧肯，系列賽場均22.5分14.5籃板，鄧肯只有20.7分12.2籃板。天王山之戰，費舍爾0.4秒的進球讓鄧肯的準絕殺徒勞無功。在最後一場當中，科比在第四節砍下12分，抵擋住了馬刺的反撲，最終OK組合擊敗了了GDP組合中的成員，馬刺也是隻能無奈目送湖人進入西部決賽。
2007/2008賽季，西部決賽
這也是科比職業生涯季後賽中最後一次遇到馬刺。07年馬刺奪冠，在隨後一個賽季中，湖人打劫式的交易來了加索爾，這也極大的增強了了湖人內線實力。兩隊在西部決賽相遇，科比整個系列賽砍下29.2分5.6籃板3.8助攻，命中率達到可怕的53.3%，更為可怕的是場均罰球只有2.2次。這說明科比用無解的中投生生投死了馬刺，湖人最終4比1帶走了勝利，拿到了總決賽的門票。這個系列賽也改變了兩隊以後的走勢，湖人開啟了連續三年總決賽之旅，而馬刺則放棄了以內線為主的打法，開始提速，也開始了為期三年的轉型之路。
