首先從機械原理的角度講，電噴的噴油嘴設置在進氣歧管內，燃油完成噴射並在進氣歧管內和空氣混合，隨著氣門的打開和活塞的向下運動，油氣混合物進入汽缸。這種結構特性決定了燃油可以直接噴射在氣門上，一定程度可以對氣門上的積炭產生清潔的作用，所以同等工況下，採用電噴的發動機更不易產生氣門積炭。其次，由於燃油和空氣在進氣歧管內就開始混合，所以使得霧化汽油顆粒與空氣間混合更為充分均勻。再次，噴油嘴設置在燃燒室之外，後期維修保養更為方便簡單，不用考慮燃燒室內高溫高壓對噴油嘴的影響，利於成本控制。
電噴結構的缺點當然有。首先是特定工況，急加速時，節氣門開度變大，噴油量增加。瞬時過多的燃油會附著在進氣歧管內壁，無法和空氣充分混合並進入燃燒室，造成燃油的浪費，燃燒效率降低。其次，幾乎所有采用電噴供油結構的發動機無法實現高壓縮比，
因為進入汽缸的是空燃比固定的油氣混合物而非純淨的空氣，過高壓縮比會在活塞到達上止點完成壓縮行程點火之前被壓燃，併產生爆震。再次，單純電噴供油（進氣歧管供油）方式的內燃機無法實現稀薄燃燒這種更為高級的燃燒方式。
反觀直噴供油系統，噴油嘴設置在氣缸內，燃油在活塞壓縮過程中完成噴射並在燃燒室內與空氣混合，由於結構特點，對應優勢有四：1、燃油直接噴射進氣缸內部，避免了燃油附著在進氣歧管內壁，減少浪費；2、壓縮比高，在活塞壓縮行程過程中，多次噴油，並逐漸達到理想空燃比，有效防止爆燃產生；3、直噴供油方式可以實現稀薄燃燒這種更為高級的燃燒方式；4、直接噴射進氣缸的燃油對氣缸內壁的冷卻起到一定作用。
