與陳介祺、羅振玉、吳大澂、陳漢第等相比，黃賓虹收藏古璽印起步較晚，卻也是十分痴迷，“要是聽得某人所得古璽或是某地出土的古璽，則必多方設法去鑑賞，找拓本，藉以精審，以考訂識別，要是有人能夠價讓，他即用相當的價值購入，做研究資料。”
黃賓虹最早的古璽印收藏應該是他22歲時購入的“年計君璽”；23歲時，又“得汪訒庵所藏漢印”。大約1891年後，黃賓虹開始大量搜求古印，至1920年，所收藏的古璽、官私印等已達二千餘鈕，數量與質量，都絲毫不輸前賢。1948年夏，黃賓虹由北平赴杭州任教於杭州藝專，隨身帶回古印千餘方，這些古璽印與他收藏的其他文物書畫在他臨終前全部捐獻給國家。
戰國·楚 平阿
戰國·楚 安裡之璽
戰國·楚 流飤之璽
戰國·楚 郭公里璽
戰國·楚 雷侯雍璽
戰國·楚 蔡得
戰國·楚 五囗
戰國·楚 牛囗
戰國·楚 金多才
戰國·楚 周昜信璽
戰國·燕 妐城都枋郯左
戰國·燕 （氵禾）囗都司徒
戰國·燕 廩節
戰國·燕 外司爐鍴
戰國·燕 長生虻
戰國·燕 畋生右馬
戰國·齊 右聞司馬璽
戰國·齊 陶璽
戰國·齊 （會攵）市師璽
戰國·齊 十四年十一月師紹
戰國·齊 悊（哲）言
戰國·齊 公孫囗
戰國·齊 藤右車璽
戰國·晉 左邑餘子嗇夫
戰國·晉 盧居司寇
戰國·晉 平陰
秦 邦司馬印
秦 西宮中官
秦 左丞
秦 西鄉
秦 戴黑
秦 文齊
秦 張池
秦 白沽
秦 韓釘
秦 女突
秦 王兼
秦 曹睢
秦 李亥
秦 景除
漢 發弩
漢 濟南侯印
漢 西河馬丞
漢 奉車都尉
漢 新安鐵丞
漢 廣武
漢 孟鴻
漢 孟必子
漢 孫況
漢 黃軻私印
漢 賈放
漢 郭噲
漢 田息
漢 李堪
漢 字季立
漢 王賞
漢 王安漢
漢 恆崇私印
曹魏 騎督之印
曹魏 殿中司馬
南北朝 宣威將軍印
晉 晉烏丸率善邑長
在收集古璽印的同時，黃賓虹還大量原鈐集古印譜：1907年至1940年的三十餘年間，共輯成《濱虹藏印》（1907）《濱虹集古印存》四冊（1909年）《濱虹草堂集古璽印續集》（1910年）《濱虹集印》二冊（1917年）《增輯古印一隅》（1923年）《濱虹草堂藏古璽印》初集八冊（1926年）《濱虹草堂藏古璽印》二集八冊（1929）《濱虹草堂藏古璽印》五冊（1940年）《濱虹草堂集古印譜》（1940年）等十餘種。