崖州湾规划区范围（依据多规合一开发边界）东起南山，西至梅山，北靠马鞍岭，南临南海海域，规划范围约69.25平方公里。本次规划在全区346平方公里内考虑生态保育、全域旅游、城乡一体等相应的规划内容。
1.发展愿景
坚持“世界眼光、国际标准、中国特色、高点定位”，规划将崖州湾建设成为陆海统筹、开放创新、产业繁荣、文化自信、绿色节能的崖州湾“南海新区”，争创生态文明建设的新区范例。
2.功能定位
总体发展定位确定为“三城、三地、一古镇”。“三城”指深海科技城、南繁科技城和大学城；“三地”指国家级的南海文化圣地、国家级的南海渔业基地和新兴海洋产业基地；“一古镇”指中国历史文化名镇；并承担区域港口物流等城市服务职能，实现港城融合、产城融合、城乡融合发展。
深海科技城
深海科技城依托南山港布局在高速公路以南的滨海地段。以深海海洋科技产业为核心，以产业集群、人才集聚、土地使用节约、经济效益明显为总要求，集聚深海领域的科研、教育、产业等资源的现代化深海科技新城。
规划三大功能区，南、北侧布局商务服务及生活配套区；西侧临近港口布局海洋实验及港口服务区；东侧布局涉海科技及公共孵化平台。
南繁科技城
南繁科技城布局在高速公路北侧，临近南滨农场场部。以建设和培育南繁国家实验室为核心，建成集科研、生产、销售、科技交流、成果转化为一体的服务全国的“南繁硅谷”。
南繁科技城以南繁科技产业及科研教育为核心规划三大功能区，重点安排“一城一室八中心”：
北部为南繁国家实验室与科技创新平台（研发板块），主要布局南繁国家实验室及关键技术中心、国际学术交流及培训中心等；中部为南繁商务服务及科研生活保障区（公共板块），主要布局南繁管理机构办公中心、数据中心、知识产权和信息服务中心、国家南繁博物馆、生活配套、教育配套等；南部为南繁贸易检验检疫及科技交流与展示区（产业板块），主要布局国际种子交易中心、总部基地、国际种业进出口检验检疫中心、会展中心等。在红塘湾临空经济区布局全球动植物隔离检疫区。
大学城
大学城布局在深海科技城以西，宁远河以东的滨海地段。聚集深海科技相关的教育创新资源，打造深海科技创新人才培养基地。
大学城规划以涉海科教产业为核心，结合大学城主干道形成十字轴线布局公共配套区及研究生院；十字轴线东南侧布局一个完整大学园区；十字轴线东北侧布局生活配套区；十字轴线西南侧布局学术论坛中心。
国家级的南海文化圣地
以南山佛教文化为核心，以佛教文化观光、佛教文化体验、佛教衍生旅游为主要功能的南海文化圣地。
国家级的南海渔业基地
以南海海洋渔业为核心，以海洋捕捞、水产养殖、风情渔村、渔港综合服务为主要功能的南海渔业基地。
新兴海洋产业基地
以新兴海洋产业为核心，以海洋旅游为支撑的特色融合发展地。
中国历史文化名镇
以崖州千年古城为核心，以观光旅游、文化旅游、智慧旅游为主要功能的中国历史文化名镇。
3.规划结构
以“双脉串联、群山通海”为生态骨架，形成“三城、三地、一古镇”的组团空间与“功能齐全、特色鲜明”的美丽乡村网络。
双脉串联、群山通海
以崖州古城、南山和梅山为支点的南海历史文化脉络；串联崖州湾城镇与腹地乡村的生态文明城乡脉络;串联崖州湾北侧山体与南侧海域的山海相连主题带。
三城、三地、一古镇
三城：“深海科技城、南繁科技城、大学城”三城融合共生的新城核心片区。
三地：产城融合服务区、南山组团、渔港-保港组团。
一古镇：中国历史文化名镇——崖州古城。