對於一個網站來說，它有它的網站結構，網站結構，對於網站結構來說，它一般保護兩種，一種是物理結構，另一種是邏輯結構。
對於物理結構來說，指的是網站目錄及所包含文件所存儲的真實位置所表現出來的結構，它有兩種表現形式，扁平式物理結構和樹形物理結構。
對於小型網站來說，所有的網頁結構都放在網站根目錄下，這種結構就是扁平式物理結構，採用扁平式物理結構網站。
偏平的物理結構網站來說，對於搜索引擎來說，是比較理想的，只要訪問一次，都能把所有的頁面訪問到，但是如果網站的葉面太多的花，網頁文件都防止根目錄下，在後期的查找，維護，都是非常麻煩的，所以扁平式結構只適合少量頁面的小型，微型站點。但是這樣的網站比較少。所以應用這種結構的網站數量很少。
對於現象規模稍微大一些的網站來說，都是需要2-3層甚至更多子目錄才能保證網頁的正常存儲，這種層級目錄叫做物理結構，根目錄下再細分多個頻道或目錄，採用樹形結構的好處就是在維護的時候，比較容易，但是對於搜索引擎來說，比較困難。現在互聯網上的網站，內容都是比較豐富的，大多采用樹形物理結構。
網站的邏輯結構。
邏輯結構優化
與網站的物理結構不同，網站的邏輯結構也稱為鏈接結構，主要是指有網頁內部鏈接所形成的邏輯結構，或者稱為鏈接結構。邏輯結構和物理結構的區別在於，邏輯結構由網站頁面的相互連接關係決定，而物理結構由網站頁面的物理存放地址決定。
在網站的邏輯結構中，通常採用“鏈接深度”來描述頁面之間的邏輯關係。“鏈接深度”指從源頁面到達目標頁面所經過的路徑數量，比如某網站的網頁A中，存在一個指向目標頁面B的鏈接，則從頁面A到頁面B的鏈接深度就是1。
和物理結構類似，網站的邏輯結構同樣可以分為扁平式和樹形兩種：
—扁平式邏輯結構：扁平式邏輯結構的網站，實際上就是網站中任意兩個頁面之間都可以相互連接，也就是說，網站中任意一個頁面都包含其他所有頁面的鏈接，網頁之間的鏈接深度都是1。網絡上，很少有單純採用扁平式邏輯結構作為整站結構的網站。
—樹形邏輯結構：是指用分類、頻道等頁面，對同類屬性的頁面進行鏈接地址組織的網站結構。在樹形邏輯結構網站中，鏈接深度大多大於1。
網站策劃是一個專業性極強的工作，包括瞭解客戶需求，瞭解客戶自身情況評估、網站功能分析、網站結構設計、頁面佈局分析、內容與應用目標分析，撰寫“網站策劃分析報告
選擇網站的結構對於網站的優化有很重要的作用，如果網站的機構連接深度比較深，對於搜索引擎來說，是非常不利的。
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