目前鄉鎮衛生院醫生工資包括：基本工資和績效工資兩大部分。下面先來談談基本工資，基本工資（鄉鎮衛生院屬於全額撥款一類事業單位，也就是財政工資）包括：薪級工資+崗位工資+邊遠地區補貼，全國鄉鎮衛生院的醫生是處於同一水平線。初級職稱在2200--2500元左右，中級職稱在3200--3700元左右，副高級職稱在4200--5500元左右。其中同級別職稱由於工作年限的長短，基本工資會有所差距。
除外基本工資以後，我們來談談績效工資（也就是以前常說的獎金）。這個要根據不同地區、不同服務能力的鄉鎮衛生院來討論。我曾經到過沿海發達地區一家衛生院，醫療業務能力基本達到二甲醫院水平，全院職工380，臨床科室12個，全年業務收入9000萬元。績效管理上實行院科兩級考核，他們院長和我談到，醫院的副高級職稱實行年薪制，已經達到30萬元/年。想想看，這樣的鄉鎮衛生院，很大程度上是通過優厚的待遇留住了人才。
在中西部地區，鄉鎮醫療業務能力普遍較低。很多衛生院為了應對基本公共衛生服務考核，將大量的人力資源投入進去，醫療業務的發展受到制約，很多鄉鎮衛生院的業務收入，僅能維持水、電、油等辦公開支，績效工資來源是靠基本公共衛生服務、預防接種勞務費來獲得，人均績效大概在1200--1500左右，和前面提到的衛生院差距是很明顯的，所以也造成了鄉鎮衛生院人才流失的原因之一。
但是我相信，隨著新醫改政策的推進、分級診療的逐步完善。鄉鎮衛生院會迎來新的發展機遇，衛生院醫生的工資一定會穩步提升的。
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