宇智波一族，原是木葉中最強大的家族之一，家紋為火扇，意為手持火焰之扇控制火焰能力極為突出的人。族員大多擅長火遁忍術。部分家系的族員具有血繼限界寫輪眼，在戰鬥中賦予他們強大的洞察力和一些獨特的瞳術。
宇智波的族徽
幼年時期的佐助在哥哥宇智波鼬的天才光環下長大，父親對佐助要求嚴格，但有時因為鼬而忽視了佐助；母親對佐助的照顧無微不至，教育多以循循善誘為主。儘管有競爭，但兄弟之間感情深厚，鼬會去接佐助放學，並耐心教導佐助忍術。佐助則以鼬為榜樣，在忍者學校取得第一名，在生活中喜歡與鼬一起修煉。
宇智波鼬
一天，佐助因為練習手裡劍而回家很晚，等他到達家裡後，卻發現父母倒在血泊之中，而哥哥鼬則站在父母屍體旁邊。鼬告訴佐助，是他殺光了全族，以此來測試自己的“器量”。鼬向佐助揭示了家族被隱藏的秘密地點，並建議佐助去那裡瞭解宇智波真正的歷史和寫輪眼的真相。同時鼬告訴佐助，要喚醒萬花筒寫輪眼就必須殺掉自己最親近的人，並讓佐助有了同樣的眼睛再來找自己。 佐助受到巨大刺激，開啟了寫輪眼，而後昏迷。從此佐助便以“殺死那個男人”為目標，不斷奮鬥。
綱手
出於對佐助天賦的欣賞，大蛇丸給佐助種下了天之咒印。為了防止佐助經受不起力量的誘惑而使用咒印，卡卡西在接下來的一個月時間裡單獨陪佐助修練。佐助在和卡卡西的訓練期間，學會了卡卡西的成名絕技--千鳥。在得知卡卡西被突然出現在木葉的鼬擊敗後，佐助去探望卡卡西並打聽消息。佐助從看望卡卡西的人那裡得知鼬回到木葉的目的是要尋找鳴人，他立刻前往鳴人處。在與鼬正式碰面後，佐助立刻使出千鳥對付鼬，卻被鼬隨手破解並折斷了手腕。雖然佐助不依不饒，但鼬似乎並不想搭理他。鼬用月讀毫不留情地擊潰了佐助並再三強調他的力量太弱。佐助精神渙散昏迷，被自來也救走，後被邁特凱揹回木葉的醫院養傷。綱手回到木葉成為五代目火影后，治癒了佐助。佐助認識到大蛇丸給予的咒印力量後，決定跟隨音忍離開了木葉，追隨大蛇丸以換取力量。
大蛇丸
在第一部到第二部的兩年半時間裡，佐助的能力產生了飛躍，他使用草薙劍作為武器，並對雷遁忍術進行了各種新的開發。由於大蛇丸的影響和自身的努力，佐助完全掌握了控制咒印的力量，瞳力也變得深不可測，甚至可以通過寫輪眼與鳴人體內的九尾對話。九尾妖狐對佐助的出現感到很吃驚，他說佐助的查克拉簡直和以前的宇智波斑一模一樣，佐助對九尾所說的事情不感興趣，並開始壓制九尾的查克拉。
佐助的實力早已今非昔比，在交戰過程中，先後破解了鼬最強的精神攻擊“月讀”與最強的物理攻擊“天照”，但也因此耗費了大量的查克拉。最終，佐助決心用自己一手準備的終極絕招來決勝負。此時佐助與鼬都已到了極限，佐助連寫輪眼都使不出來了，鼬的雙眼已經幾近失明，而且不斷吐血，須佐能乎也差點消失。面對鼬強大的“須佐能乎”，佐助唯有不斷以草薙劍和引爆符進行攻擊，但都被鼬的須佐能乎所持的“八咫鏡”彈開。鼬步步迫近，佐助則節節後退。最後，鼬微笑著在佐助的額頭前輕輕點了一下，說道：“原諒我，佐助，這是最後一次了。”接著就此倒下。天空漸漸變暗，陣雨迷濛，天彷彿在哭泣一般，而天照之火仍在不滅地燃燒著。當佐助看見旁邊的鼬再也不動後，他明白鼬已經死亡，淒涼地笑了一下之後倒在了鼬的旁邊，兄弟二人並列躺在地上，彷彿永遠隔絕的存在。
“面具男”找到並救起已經暈倒的佐助，他對佐助宣稱自己就是“宇智波斑”，同時告訴了他家族與木葉曾經的恩怨，以及鼬的真實身份。原來，鼬是木葉的雙重間諜，當年一族意圖謀反，為了防止戰爭的爆發鼬才選擇親手滅掉家族。而鼬其實一直都在暗中保護佐助，當年他以不殺佐助作為同木葉高層談判的條件，並將佐助託付給三代目，因為在鼬的心中，佐助比木葉更加重要。佐助得知真相之後開始慢慢回憶起鼬的過往，漸漸相信了“面具男”所說的一切，憤怒與悲傷使得他開啟了萬花筒寫輪眼。他將“蛇”改名為“鷹”，並決定刺殺逼死鼬的幕後黑手──志村團藏等三位木葉高層，以及摧毀對家族實行滅族政策的木葉。
宇智波帶土
佐助打敗團藏後，櫻、卡卡西、鳴人先後趕來，第七班重聚。佐助成功移植了鼬的眼睛，瞳力的融合使得雙眼升級為“永恆萬花筒寫輪眼”。
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