机构改革过程中，涉改单位的组织人员是暂时冻结的，不管是领导干部任免，还是一般干部调动，甚至是招考，都是暂时性冻结的。在机构改革期间，违规调整干部、调动人员，不仅得不能上级组织部门的认可和备案，还会被追究责任，进行党纪处罚。
随着党政机构改革，领导职数会随编制数额严格限制，不得越雷池一步。市县基层不得成立6名编制以下的机构，不得超职数配备领导，若有超配，或者违规核定领导职数问题，必须于2019年6月底前全面整改完成。按照编制与领导职数的对应关系，人员编制在50名以下的，单位核定一正两副3名领导职数；人员编制在51—200名的，核定一正三副4名领导职数；人员编制在201—500名的，核定一正四副5名领导职数；人员编制在501—1000名的，核定一正五副6名领导职数；人员编制在1001名以上的，核定一正六副7名领导职数。领导职数只可以按规定核定，可以少核，但严禁超核。
机构改革的另一个原则要求是精简机构，省级党政机构按60个设置，市县按规模依次减少，大县37个，中县35个，小县33个，几乎只有省级党政机构数额的一半。机构数额减少，领导职数同样被压缩。而事业单位改革，以辽宁省7月底结束的试点改革情况来看，省直、市直事业机构减少50%以上，县区事业单位减少90%以上。机构减少多少，领导职数同样按比例减少至少3倍以上。例如原来某县事业单位200个，事业单位领导800人，机构改革后单位数额只有20个，事业单位领导减少到100个左右。
原来的领导人员，随职位和管理岗位减少，不能担任实职，或者担任非领导职务，或者免除职务，只享受原有级别待遇。在改革后一段时期内，行政、事业单位职务晋升机会大大减少，只是解决改革遗留问题，都需要一个漫长的过程。
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