目前關於核質大DNA病毒(NCLDV)的瞭解主要來自與原生生物和藻類共培養的病毒分離株。近日,
美國能源部聯合基因組研究所Tanja Woyke、Frederik Schulz等研究人員,在迅速增加的公開訪問元基因組數據基礎上,從全球採樣點重建了2074個NCLDV基因組。這使得系統發育多樣性提高了11倍,功能多樣性也提高了10倍。分析58023種大型和巨型病毒元基因組的主要衣殼蛋白揭示了其全球分佈格局,並強調了它們的普遍性質。被發現的病毒基因組編碼了大量的蛋白質,這些蛋白質在光合作用和多種底物轉運過程中具有可能的作用,從而揭示了宿主重編程可能作為NCLDV的常見策略。此外,水平基因轉移推論將病毒譜系連接到各種真核宿主。研究人員預計,由此揭示的全球範圍內的NCLDV巨大多樣性將使巨型病毒成為地球生物群系的關鍵生態系統參與者,並與大多數主要的真核生物譜系存在關聯。Frederik Schulz, Simon Roux, David Paez-Espino, et al. Giant virus diversity and host interactions through global metagenomics. Nature, 2020.
DOI: 10.1038/s41586-020-1957-x
https://www.nature.com/articles/s41586-020-1957-x
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