有點把引水入疆的目標搞偏了，引水入疆的目的不是為了改變氣候，也難以改變氣候。如果以此來作為引水入疆目標話，那麼會引起資源配的錯配，浪費來之不易的水資源，所以引水的第一目的就應該是搞農業，種瓜果。例如美國成功的“北水南調”工程，工程主幹線長約1060公里，包括33座儲水設施、21個水庫/湖泊和若干發電站，調水50多億立方，乾旱河谷地區灌溉面積達2000多萬畝的良田，以洛杉磯為中心受益人口高達2300萬。如果這50多億立方的水拿來人造湖泊，靠所謂水汽蒸發來改善氣候，在廣闊加州乾旱的南部無疑是杯水車薪。
事實上新疆沙漠區河流水資源基本就是用於工農業生產的，例如塔里木河流域、準噶爾盆地內流區水資源開發利用率分別高達 91%、92%。這樣的後果是導致以塔里木河為主要的入湖水量的湖群差點全部消失，例如臺特瑪湖，羅布泊等。近年來，塔里木河流域加強了水資源管理和利用，塔里木河尾閭才以到達臺特瑪湖，這個湖泊得以恢復點生機。
此外，如果水資源豐富起來，新疆是可以快速發展農業的，下圖塔里木河流域耕地分佈圖，會發現耕地有大部分是在天山山前平原一帶。這得益於天山冰川融水豐富，特別是近年來，由於全球變暖冰川融化加速，水量增加、阿克蘇地區山前平原得以快速的發展。2000 年-2018年阿克蘇河流域植被覆蓋面積由10976.13k㎡增加到13065.00k㎡， 增長19.03%。但同時帶來的是耗水量增加，有人擔心這是不可持續的，因為隨著冰川的消失，水量並不能持續增加。
以上說明新疆沙漠區還是首先解決人的問題，未來引水入疆也應以人為主，不然誰給調水的成本買單呢？
同時引水入疆也要以解決我國大西北缺水問題統籌考慮，例如鄧銘江院士就提出“水三線”概念統籌解決西北缺水問題。“胡煥庸線”是我國人口中國社會經濟、生態景觀、氣象降水等方面的天然分界線，“陽關線”是中國極度乾旱區 （年均降水小於100 mm） 與乾旱區的地理分界線，“奇策線”把新疆分為西北和東南兩塊，新疆西北有著水資源 佔全疆93%、人口占87%、GDP佔89%、灌溉面積佔87%的顯著特點。
通過調水解決西北缺水問題，顯然要一步步跨越這三條線。而目前南水北調中線、東線工程還在胡煥庸線內，引漢濟渭工程正跨越胡煥庸線，未來的南水北調西線工程才真正跨越胡煥庸線。跨越陽關線可能要更多時間了。
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