02.28 也可能不是穿山甲?新冠病毒動物來源撲朔迷離

本文由《Nature 自然科研》授權轉載,歡迎訪問關注。

原文作者:David Cyranoski

穿山甲是當前主要的懷疑對象,但一連串的遺傳學分析尚不能找到決定性證據。

隨著新冠病毒在全球肆虐,科學家正在抓緊確定新冠病毒的來源。三週前,中國科學家根據遺傳學分析指出,以螞蟻為食的穿山甲是主要的懷疑對象。然而,在對這項研究和上週發表的另外三項穿山甲冠狀病毒基因組研究的數據進行審視後,科學家認為,雖然穿山甲依然非常可疑,但我們離謎底揭曉還很遠

也可能不是穿山甲?新冠病毒动物来源扑朔迷离

穿山甲經常被走私到中國——中國對穿山甲肉和鱗片有需求。來源:Shutterstock

公共衛生官員希望能儘快鎖定新冠病毒來源,以幫助他們預防新的暴發。科學家假設和其他冠狀病毒一樣,這種病原體是通過一種動物傳給人的;比如,2002年的SARS致病病毒被認為是通過果子狸傳到了人身上。在此次疫情的早期感染者中,有幾十人都來自武漢一活禽市場;不過,對該市場發現的冠狀病毒樣本的檢測尚不能確定具體來源。

三個不同的中國團隊都在追溯新冠病毒的來源,一個來自中國疾控中心,還有一個來自中國科學院。

溝通失誤

在2月7日舉行的新聞發佈會上,華南農業大學的研究人員提出,穿山甲是新冠病毒的動物來源。穿山甲的肉和鱗片在中國很受青睞,尤其是鱗片可以入傳統藥材。穿山甲交易在世界範圍內遭禁,中國也不允許售賣穿山甲,但仍有穿山甲從一些東南亞和非洲國家走私到中國境內。華南農業大學的研究人員表示,他們在走私的穿山甲中發現了一種冠狀病毒,它與人群中傳播的新冠病毒的遺傳匹配度達到了99%。

不過,這一結果並不是指整個基因組。該研究2月20日發佈在了生物醫學預印本服務器bioRxiv上1作者表示,分析實際上只針對一個特定的位點,即受體結合域(RBD)。這篇論文的共同作者之一、華南農業大學寄生蟲學家肖立華解釋道,新聞發佈會的報道源於“這項研究的生物信息團隊和實驗團隊之間一次令人尷尬的溝通失誤”。全基因組對比發現,穿山甲和人體內這種病毒的DNA相似度為90.3%。

受體結合域對冠狀病毒至關重要,它可以讓冠狀病毒抓住細胞並進入其中。即使兩種病毒的受體結合域有99%的相似性,也不足以說明兩者之間的聯繫,杜克-新加坡國立大學醫學院病毒學家王林發如此表示,王林發也是發現SARS病毒來源的團隊成員之一。

相似度還不夠

上週,三項類似的對照研究也發佈在bioRxiv上。2月18日發佈的一篇論文來自一個國際研究團隊,他們發現2,取自非法走私穿山甲的冷凍細胞樣本的冠狀病毒,與人體內這種病毒的DNA相似性達85.5%-92.4%。

2月20日發佈的另外兩篇論文來自中國團隊,研究的同樣是走私穿山甲體內的冠狀病毒。各自研究的病毒與COVID-19致病病毒的相似性分別為90.23%3和91.02%4

加拿大麥克馬斯特大學的冠狀病毒研究人員Arinjay Banerjee說,遺傳相似性需要比這些研究得到數字更高,才能鑑定出宿主。他指出,SARS病毒與果子狸體內冠狀病毒的基因組有著99.8%的相似性,這正是為什麼果子狸被認為是SARS病毒的動物來源。Banerjee說,如果穿山甲真的是此次疫情暴發的動物來源,那也不是這些研究中的穿山甲。

關鍵差異

迄今為止,與人冠狀病毒匹配度最高的來自中國雲南省發現的一種蝙蝠。2月3日發表的一項研究5發現,這種蝙蝠冠狀病毒與COVID-19致病病毒的遺傳物質相似性為96%。蝙蝠直接把病毒傳給人的可能性不是沒有,但這兩種病毒的受體結合域位點之間存在關鍵差異。研究人員認為,有差異說明這種具體的蝙蝠冠狀病毒不會直接感染人類,而是可能通過中間宿主傳給了人。

中科院動物研究所生態學家蔣志剛認為,這些論文回答了一些問題,但也提出了更多的問題。他問道,如果穿山甲是新冠病毒的來源,而且它們來自別的國家,那為何來源地沒有人報告受感染?

武漢江漢大學的動物行為研究人員Sara Platto擔心,所有關於穿山甲是新冠病毒動物來源的猜測,可能會讓穿山甲遭到捕殺。SARS暴發後,果子狸被大量殺害。“問題不在動物身上,問題出在我們與它們的接觸上。”Platto說。

參考文獻:

1.Xiao, K. et al.Preprint on bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.02.17.951335 (2020).

2.Lam, T. T.-Y. et al.Preprint on bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.02.13.945485 (2020).

3.Liu, P. et al.Preprint on bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.02.18.954628 (2020).

4.Zhang, T., Wu, Q. & Zhang, Z. Preprint on bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.02.19.950253 (2020).

5.Zhou, P. et al.Naturehttps://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7 (2020).

原文以Mystery deepens over animal source of coronavirus為標題發表在2020年2月26日的《自然》新聞上

© nature

Nature|doi:10.1038/d41586-020-00548-w

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