日本動畫製作公司一般有兩種，一種叫“企畫公司”，就是籌劃製作，另一種叫“製作公司”，就是實際動手畫。一般是分由兩個公司完成，也有一個公司分兼二職的情況。一般而言，劇本、日程、分鏡、設定、原畫和監督（導演）由企畫公司完成，而製作公司完成描線、上色、特效、校對、攝影、沖印、編輯和配音等工作。
日本動畫的監督（導演）一般不像中國的導演那麼操勞（從頭至尾都在盯著），他除了拍板和協調外，只要全心全意排好第一話和最後一話就可以了，其它細節交給演出（副導演）來解決，而審查、原案、分鏡頭等等都有專人負責，用不著他操心。
製作過程
前期
顧名思義，這是動畫誕生最開始階段。這部分工作主要有策劃、劇本創作、造型設計、場景設計和分鏡頭畫面臺本設計。
中期
這應該是許多人感興趣的部分，因為這其中包括攝影表填寫、原畫、動畫及背景繪製等。這一部分工作比較繁重，所以企畫公司一般不參與制作，只負責監督而已。經常關心動畫STAFF名單就會發現，人物設定、場景設定、分鏡頭一般都是些出名人物，而到原畫、動畫、上色等工作時就“譁”地出現一大片陌生名字，還有不少乾脆是“XX公司”。像人設、監督這種重要工作，一般以個人名義來進行。
說到動畫——這裡指動畫拍攝過程，屬於極為繁重的工作，所以由專門的“動畫”公司負責。國內許多加工動畫的公司就在幫日本公司做這部分工作。那些十分精美的畫面大多出自中國人之手（所以說，中國並不缺畫師）。企畫公司會對原畫和動畫等工作給出書面詳細要求，接下來，就要看動畫公司的實力了。不過大家不要想當然，雖然那些畫面精良的日本動畫大多由中國加工公司製作，雖然動畫是最底層的工作，但報酬就是比國產動畫高，所以許多為國外加工動畫的中國動畫公司都不接國產動畫工作。
後期
漫長的過程過去，後期工作便是拍攝（或掃描）、上色、合成、編輯鏡頭和配音字幕等等。說到配音，本應說說日本的聲優（配音演員）制度，但在日本，聲優業早已獨立形成產業，
也擁有許多專門的消費者，況且和動畫製作幾乎已成兩方面（聲優不單為動畫配音，還常常做電影配音、電臺主持、廣播劇、演唱歌曲等工作），故不再詳述。
名聲優
至此，動畫基本流程介紹完畢。
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