愚昧對科學的絞殺無時不在、無處不在，只不過在不同的時代和不同的國家，愚昧的武器各有特色。在中國，古代以鬼神迷信封建禮教為主，現代是中醫外加各種非主流的東西方迷信；而在美國則是以基督教為主，外加各種非主流的東西方迷信。
基督教的身份不是醫學，自然不會販賣草藥，而是以祈禱的方式對現代醫學實踐和發展進行干涉。有一些極端的“信仰治療師”也跟國內的保健品騙子們一樣，勸糖尿病患者停用胰島素、阻止腫瘤病人接受放化療、為妖魔化疫苗的“風尚”煽風點火。
在中醫影響下，中國醫生基本成了中醫——開中藥並信其療效；基督教的泛濫也對部分西方醫生造成了一定影響，比如少數美國醫生也相信祈禱可以治病，乃至有個別人甚至試圖通過臨床試驗為祈禱治病“正名”，他們的試驗結果很容易就成為“信仰治療師”們的番天印。其實中醫也一樣，因為害怕科學驗證，普遍患有西方迫害妄想症；然而一旦有外國人（多數是外籍華人）看中醫或服中藥，馬上會被用來證明中醫之偉大。
同理可以預料，教徒對臨床試驗的態度是會根據結果而改變的。他們只採信那些祈禱治病有效的試驗結果，而對不支持祈禱療效的臨床試驗，則視而不見或用各種藉口加以否定。偽中立者們則會以“尚存爭議”、“不能斷然否定”來拉偏架。
祈禱治病跟患者借宗教信仰緩解焦慮、通過宗教團體的社會支持提高生活質量不是一回事。祈禱治病的理論基礎是通過祈禱引起上帝的關注，然後藉助上帝的悲憫與神力逆轉疾病。理性的人自然不會相信祈禱治病之類的鬼扯，不過科學家們通過理性思維和科學試驗來否定這些鬼扯卻很有意思。
雖然對祈禱功效的質疑古已有之，但第一個通過數據統計進行質疑的是維多利亞時代的科學家弗朗西斯·高爾頓（Francis Golton）。他在1872年做了兩個調查：一，根據量效關係假設接受祈禱最多的人應該最長壽，在英國自然是英國皇家成員接受祈禱最多；二，對同一塊地的不同株植物隨機祈禱，看祈禱是否有助於植物生長。當然，最後結果顯示，上帝對這些祈禱都沒有給予關注。
而祈禱治病鼓吹者最喜歡引用的兩項臨床試驗：一，1988年，蘭德爾福·伯德觀察了聖弗朗西斯科總醫院心臟病重症監護室的393名病人，發現祈禱對26個健康相關指標中的6個有積極作用。二，1999年，威廉姆·哈里斯在前者基礎上用了更加細化和連續的評價指標，也發現祈禱對病人的健康有好處。然而這些結果被批評者認為是統計學遊戲。比如在26個指標中發現6個有積極價值，被哥倫比亞大學行為醫學教授理查德·斯隆批做“德克薩斯神槍手謬論”，意思是先開槍後畫靶子。從統計學角度來說，一次觀察這麼多指標，有一兩個指標顯示相關很可能是偶然事件，就像朝著靶子亂打一氣總有一些彈孔靠近靶心。同樣的謬論還出現在文學和歷史學中，比如曾在國內風靡的諾查丹瑪斯大預言，就是在刨除前後語境和歷史背景的基礎上，將歷史上的任一重大事件拿到預言中去尋找有聯繫的隻字片語。
支持祈禱的試驗不僅存在方法上的錯誤，有些甚至直接造假。2001年的《生殖醫學》雜誌發表了關於祈禱對試管嬰兒影響的研究，據說祈禱能夠讓試管嬰兒成功率翻一番。研究單位儘管是著名的哥倫比亞大學，哥倫比亞大學官方也在大力宣傳，但卻受到了強烈的質疑——設計、統計和結果都被認為存在瑕疵，甚至是否真的組織了祈禱都被懷疑。三位作者中的一位承認，自己是在試驗結束後半年到一年才知道這項試驗的，而且只是提供了編輯工作。最後，這名作者和哥倫比亞的名字被要求從研究中撤掉，支持祈禱的研究成為一樁學術醜聞。
要從科學角度推翻上帝神蹟的說法，還得用科學的方法。按照臨床試驗的金標準——隨機對照試驗，哈佛教授赫伯特·本森在2006年進行了著名的STEP研究（A study of the Therapeutic Effects of Intercessory Prayer，代祈禱治療效果的研究）。因為這項研究受到了致力於科學與宗教對話的約翰鄧普基金會的支持，所以也被廣泛稱為“鄧普基金會研究”。來自6家醫院的1,800餘名接受心臟搭橋手術的病人，在手術前隨機分為三組。兩組病人不知道是否有人為自己祈禱（實際上一組有人祈禱，一組無人祈禱），第三組則被明確告知會有人為他們祈禱，也確實安排了人進行祈禱。祈禱由專職代祈禱人員按照其方式施行，但為了讓上帝明確做什麼，祈禱中必須有明確的目的和具體的病人名字，比如“手術順利”“快速恢復”“無併發症”等等。
最終結果是：前兩組不出預料地沒有明顯差距，但祈禱似乎真的對第三組產生了作用。不過，這效果卻不是祈禱擁護者所希望的：第三組的併發症發生率顯著高於前兩組。對於這樣的結果，可能有一些合理的解釋，比如被告知祈禱可能會給病人造成心理壓力——“莫非我的病情很嚴重，都需要安排專人祈禱了？”然而，教徒的反應更有意思，有的教徒就辯稱這樣的安排冒犯了上帝，所以上帝故意讓最後一組結果不好。
這個試驗的前後是如此有戲劇性，被著名科普作家理查德·道金斯寫進了《上帝迷思（the God Delusion）》裡面。
分析關於祈禱的臨床試驗的總體結果表明：越是設計紕漏百出的試驗，越是支持祈禱的效果；越是設計嚴謹的試驗，越是不支持乃至否定祈禱的效果。雖然如此，大概對那些虔誠的信徒不會有任何影響，因為拒絕科學理性對大腦的損傷是不可逆的。部分中國人對中醫的信仰也與此類似。
不管愚昧看起來多麼神秘、繁雜和博大精深，和科學理性比起來總是顯得幼稚可笑。堅持愚昧的人，不管你身份高低人數多寡，都免不了被科學碾壓。
本文首發科學貓頭鷹。
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