解密的《達芬奇密碼》能夠以虛構的情節達到有理有據的驚世駭俗還是讓人歎為觀止的。它想告訴人們，誤解是多麼可怕和神秘的事，那麼《達芬奇密碼》是澄清了誤解還是加深了誤解？人們對歷史對傳說都有很多誤解，這是蘭登在電影一開始就告訴我們的，而這種誤解也存在於人類的最高精神追求中——宗教信仰。
耶穌基督的信仰在西方文化中的影響力不言而喻，對於信的人或不信的人，《達芬奇密碼》誰也不討好，或者說它兩邊都得罪。因為它涉及了耶穌的神性和人性之爭，是關乎耶穌基督信仰的分歧，基督教不同宗派，宗教信仰的不同走向。但在歷史上，尼西亞會議用投票的方式確立了耶穌不容置疑的神性，而《達芬奇密碼》卻用虛實結合的故事講述了一個有妻子有女兒的凡人耶穌是如何被隱藏的。
因為《達芬奇密碼》是虛實結合的懸疑故事，那麼首先來分一分劇中哪些元素是真正存在於我們的世界的。
劇中最重要的線索——玫瑰線，是真實存在的，它有個通俗的叫法是“本初子午線”，是地球上一條從北極到南極的直線，這條線穿越法國巴黎的街道，也恰好穿過了真實存在聖許畢斯教堂。聖許畢斯教堂因為《達芬奇密碼》而受到遊客歡迎，甚至有人認為能從這裡找到傳說中的基督教聖物。但這個具有三百年曆史的教堂是真的，聖物當然沒有。
跟聖許畢斯教堂一樣，聖殿教堂也真實存在的。聖殿教堂在倫敦，它是12世紀聖殿騎士團在英國的總部，圓頂仿造了耶路撒冷聖墓紀念堂，而最著名的景觀是九座真人大小的騎士雕像。聖許畢斯教堂是蘇菲祖父迷惑西拉的地點，所以那裡什麼都沒有，但是聖殿教堂不一樣，它裡面的聖殿騎士就跟故事有很多相關性。
聖殿教堂有隱秘的地下室，可能是用作秘密入會儀式的舉行地點，也可能是聖殿騎士團的地下金庫，甚至是隱秘的囚室。現實中聖殿教堂已經交給律師打理，很多秘密也就不為人知，電影對聖殿教堂的揭秘也是點到即止。
隨著電影劇情的推動，蘭登和蘇菲來到了靜謐的羅斯林教堂，一個更加神秘和詭異的教堂，它也有玫瑰線穿過。羅斯林教堂內部充斥著各種符號，從裡面可以讀到共濟會，猶太教，基督教，聖殿騎士，伊斯蘭母題，異教綠人，北歐凱爾特神話，巨龍，撒旦教等看似雜亂卻各有對應的符號。
而更為奇妙的是，在神話和傳說中，它還典藏了跟法國聖克萊爾家族相關的歷史和密碼。這裡還埋葬了聖克萊爾家族的一位主教，威廉，但只埋葬了他的頭骨和腿骨。據說每當聖克萊爾家族有人去世，羅斯林教堂的石頭就會發出光輝。羅斯林教堂當然是真的，而且歷史上也跟聖殿騎士團有著千絲萬縷的關係。《達芬奇密碼》就直接揭示了聖克萊爾家族其實是帶有耶穌和抹大拉的瑪麗亞王室之血的後代，而蘇菲是這個家族的最後一名成員，她來到教堂，教堂裡的人一眼就認出了她，然後叫來了其他家族成員。
蘇菲回家了，因為她就是聖盃。
聖盃，存不存在沒有人知道，但是這是基督教的傳說，簡單的想法都認為聖盃就是一個杯子，是耶穌最後的晚餐上用來盛葡萄酒的那個杯子，但是布朗別出心裁從符號學出發，告訴人們聖盃真正的含義是“女性的子宮”，聖盃就是代表聖神的女性。
在異教神話中，女神崇拜非常普遍，比如維納斯崇拜，比如伊西斯崇拜，《達芬奇密碼》中表示，基督教最初時期也崇拜女性，這個女性不是聖母瑪利亞，而是耶穌的妻子抹大拉的瑪麗亞——這當然是布朗的驚人之筆。
原來，耶穌有一位擁有法國王室血統的妻子抹大拉的瑪麗亞，她在耶穌死前懷孕，在耶穌死後由聖殿騎士團護送逃亡，生下女兒沙拉。抹大拉的瑪麗亞死後葬在羅斯林教堂，耶穌的頭據聞也是葬在那裡。天主教教宗為了抬高耶穌的神性，極力毀滅耶穌作為凡人娶妻生女的“歷史”，因為在耶穌臨死前，原本要把領袖地位傳給抹大拉的瑪利亞而不是聖徒彼得。聖殿騎士團一直在暗暗保護耶穌的這個秘密以及他的後人。
聖殿騎士團，也是歷史上存在的，曾經參加過十字軍東征，據說找到了聖物之後就隱匿起來。在《達芬奇密碼》中，聖殿騎士團就是錫安會，也叫秘密兄弟會，是耶穌最忠實的追隨者，大名鼎鼎的達芬奇，牛頓都是它的成員。聖殿騎士團一直和教廷高層組織影子會開戰，因為影子會把耶穌的信仰變成世俗教會，壟斷了跟神的直接交流，毀滅耶穌相關的“真實歷史”。世俗教會還以耶穌之名大肆迫害女性，特別是有獨立思想的女性被斥為女巫，掀起過中世紀慘無人道的女巫獵殺行動。
影子會是一個傳說，或者是故意讓世人認為不存在的組織，但是主業會是真的存在，是天主教一個比較保守的教派，隸屬於梵蒂岡教會。
《達芬奇密碼》必然引起天主教宗教人士的不適，因為它講了很多符號，符號隱藏的信息對天主教塑造的耶穌至高至純的神性有著顛覆性解讀。但是這僅限於文學著作，大家大可不必當真。
首先要講的就是神聖女性符號，電影開頭蘭登舉例的五芒星符號，含義是神聖女性，是女神崇拜維納斯的象徵。相對基督教來說，維納斯崇拜是異教的邪惡象徵，但是，布朗認為耶穌時期的基督教，也充滿了這種神聖女性崇拜。
在《最後的晚餐》中，達芬奇作為聖殿騎士團成員，作為耶穌的忠實信徒，把耶穌時期的宗教思想畫進了自己的作品中。這幅作品中，被解讀成，耶穌右手邊的是女性，即耶穌的愛人抹大拉的瑪麗亞。耶穌和瑪麗亞的臀部組成一個V形，這是一個古老的女性符號“聖爵”，也就是俗稱的聖盃，象徵女性的子宮，也指向某一位女子是值得崇拜的“神聖女性”。在這幅畫作中，這位神聖女性當然就是抹大拉的瑪麗亞。
為什麼抹大拉的瑪麗亞的如此重要？因為《達芬奇密碼》中顯示，異教認為，男女結合能夠體驗到神聖，通過女人可以達到天國。而電影中，耶穌的忠實信徒聖殿騎士團會定期舉行這種通往天國的秘密儀式，蘇菲就是因為無意中撞見祖父在家舉行這種儀式而離家出走，不再與祖父聯繫。
那麼，電影中未能直接言明的就是：耶穌和抹大拉的瑪麗亞也是通過這種儀式體驗神聖，所以瑪麗亞被選為接替耶穌的領袖，並被尊為神聖女性。在電影中提到，十四世紀的時候，聖殿騎士團被梵蒂岡教宗宣佈為拜撒旦教，並在1307年的10月13日，星期五的那一天，聖殿騎士團被團滅，殘存的聖殿騎士隱居起來。但是這個組織一直都沒有停止活動，把保護耶穌聖物和後代以及延續信仰當成了他們終身的目標。
作為跟神聖女性符號對應的就是代表男性的符號＾，表示刀刃，也表示侵略性和男子氣概，所以現代軍服上都還可以覓得其蹤跡。
五芒星符號意象非常豐富，屬於神秘文化裡非常流行的符號。它可以象徵天地萬物的金木水火土，也可作凱爾特人的冥界女神摩根的象徵，它是五回交錯的誕生，是魔法咒符，也是醫治傷病的符號。巴比倫人崇拜它，因為它可以保鮮食物；猶太教崇拜它，因為它藏著神的隱秘名字，它還可以叫做“所羅門的印章”；它還是封印了天使梅丹佐的符號；而埃及人乾脆稱它為大地女神的象徵，也是冥界子宮的符號。
所以象徵愛情的維納斯用它來作標記一點也不奇怪，它傳達出一種非常古老而神秘的宗教氣息，跟最原始的生殖崇拜密切相關。中世紀鍊金術繪製的人體模型，就是五芒星圓內人站成大字型，這種姿勢叫做“小宇宙”，人體小宇宙，也就是生命，由五星支配。
但是如果把五芒星倒過來，也就是逆五芒星，就變成地獄，也就是撒旦教的標誌。
玫瑰是《達芬奇密碼》中出現多次的意象道具，其實它沒有那麼複雜，代表的依舊是我們熟悉的愛情。藏密筒上雕刻玫瑰圖案，裡面藏著抹大拉的瑪麗亞骨骸埋葬地點，而曾經停留過瑪麗亞骨骸的地方也有一支玫瑰，所有的指向都是愛情。因為羅馬教廷為了建立無上的宗教權威，抹殺了歷史上真實的耶穌，把耶穌塑造成一個只具有神性的存在。
但是，在福音書中出現的抹大拉的瑪麗亞相關描述讓人浮想聯翩，這個神秘的女性真的只是被耶穌拯救的十足婦女嗎？如果她不重要，為何她是第一個向世人報告耶穌復活的人？布朗是異想天開的作者，他從耶穌對女性的態度出發，尋找一個跟古老宗教相關的神聖女性符號，然後找到了耶穌身邊的獨特女性抹大拉的瑪麗亞，運用歷史現實主義的觀點，編纂了一個讓人信以為真的懸疑宗教故事。
耶穌是神還是人，已經不重要，即使這個問題爭論兩千年也沒有定論。蘭登說：根據歷史，耶穌是一個偉人，他啟發了人心。而蘭登自己在七歲那年在水井中面臨絕望和死亡，也是呼喚耶穌給予他活下去的勇氣。所以《達芬奇密碼》並不是反耶穌信仰，相反，它提供了一個理性信仰的思路：耶穌是啟發人心的偉人，去信仰這樣一個人，又有什麼問題呢？
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