《海賊王》篇幅太長了，作者起初打算在阿拉拜斯坦篇就完結的，可火了就繼續畫了，一直連載到今天，很多設定出現前後矛盾的現象，或者不得已添加一些新的設定，都是沒有辦法的。當中有很多被捨棄的設定。
首先說記錄指針，最初的時候介紹說因為偉大航路的特殊磁場，每到一個島嶼必須待上數天才能記錄位置，草帽一夥就每到一個新島嶼都停下逛逛，給冒險提供先決條件。但現在甚平突然就拿出一個三指針的記錄指針，就說這個不用停留直接就能辨方向，有這麼好的東西以前卻從沒聽說過，在此之前所有登場的海賊們用的都是老式的記錄指針。我只能理解為新世界篇章要加快進程了，托特蘭34個島鏈，按以前的話恐怕得記錄好幾個月都離不開這。為了適應劇情不得不改變一些東西，讀者們也願意接受。
賞金獵人也是初期頻繁出現的一類人群，索隆初登場時身份就是賞金獵人，索隆的兩個小弟強尼和約瑟夫也是，羅格鎮還有一個超級厲害的賞金獵人，曾是海軍第一槍手，到了威士忌山峰，更是出現一個全由賞金獵人偽裝成平民，專門對付海賊的小鎮。而後的劇情中賞金獵人突然就銷聲匿跡似的，直到香波地群島才有零散的弱不禁風的賞金獵人打打醬油。也許是尾田的想法變了，主要講海賊的故事，有海軍做對手就可以了，添加更多的敵對勢力會使故事變散。
水之都曾經引入過道力值的這一數字衡量實力的體系，篇章一過就被捨棄了，倒是挺明確的，不信看看《龍珠》戰鬥力值這個東西會越顯示越高，前期登場的BOSS就什麼都不是了，因為數值已經限定了他們，正因為尾田沒用這個，才能在頂上戰爭時讓克洛克達爾在各大高手面前秀一把。
空島的貝類，離開空島後使用率越來越低了，只有烏索普還偶爾拿出來用，在劇場版強者世界中娜美錄音用了一下，這東西在青海就沒普及，除了戰鬥用的排擊貝和火焰貝，很多生活中用的貝都可以用科技代替，還更方便，音貝和映像貝不如電話蟲。
尾田在捨棄某些設定的同時也在添加許多新的設定，比如說霸氣，果實覺醒等，所以看《海賊王》儘量從頭看，半截開始看會稀裡糊塗。
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