哈哈，這個問題有意思了，《火影忍者》大戰結束以後為啥木葉村沒有除掉大蛇丸？個人認為原因在於木葉村和大蛇丸互相之間還有利益訴求，加上大蛇丸本身的特點以及劇情需要讓大蛇丸能夠繼續活下去，下面具體說明一下。
大蛇丸為第四次忍界大戰的最終勝利做出了貢獻有戰功，讓大蛇丸有活下去的資本。
火影后期岸本為了讓大蛇丸洗白設計了很多橋段，雖然從大蛇丸的角度來看其最後階段使用穢土轉生召喚出歷代火影的最終目標是讓自己實現永生的夢想（如果斑的無限月讀成功，大蛇丸就不能利用不屍轉生和咒印延長自己的壽命，而是無限期的陷入幻術世界中了），但是確實在後續的戰鬥過程中有效減少了忍界聯軍的傷亡情況，為各個忍者村保留了大量的有生力量。
因此客觀來說大蛇丸雖然是一個極致的利己主義者不過確實是有足夠的戰功的，如果沒有大蛇丸破解屍鬼封盡召喚歷代火影，忍界大戰中聯軍在高端戰鬥力方面和反派勢力差距太明顯了。因為原本各村子的五影已經被宇智波斑虐的死去活來，後面還有一個六道帶土，如果沒有歷代火影的牽制後面鳴人和佐助可能沒有得到六道仙人的力量饋贈就已經昇天了。所以和前期大蛇丸對木葉犯下的罪行功過相抵，最後才能保住小命。
大蛇丸利用穢土轉生召喚出歷代火影確實在第四次忍界大戰後期在一定程度上彌補了忍者聯軍和反派勢力之間的實力差距。高端戰鬥力方面忍者聯軍是先天存在劣勢的，沒有歷代火影的話可能根本撐不到鳴人和佐助得到六道仙人的力量進化成最強形態。
木葉村和大蛇丸之間有利益訴求，木葉村想要依託大蛇丸的研究對付大筒木一族，而大蛇丸也需要在一個相對穩定的環境生存。
在火影忍者第四次忍界大戰結束後，各個村子的實力都有所減弱，而大筒木一族的問題也浮現出來，木葉村自從二代火影死後在科研方面排除大蛇丸並沒有很好的後輩力量。因此木葉村才有意留下了大蛇丸，雙方算是互惠互利，一方面木葉村想要依靠大蛇丸的研發能力尋找對抗大筒木一族的方法，畢竟只要大筒木一族還有族人存在憑藉其在力量方面的優勢木葉村得常規戰鬥能力是很難和大筒木一族抗衡的，因此需要大蛇丸針對性的開發一些特殊的東西出來對抗大筒木一族。
另一方面大蛇丸也需要一個可以依靠的勢力為自己的研究提供物質基礎，大蛇丸本來就是從木葉村出來的忍者，因此二者之間的關係更加密切一些。而且火影忍者的世界依舊處於利益優先的格局，只要大蛇丸能夠為木葉村帶來足夠的利益和利用價值，大蛇丸是不會被木葉村幹掉的。
大蛇丸和木葉村應該是互相利用的關係，彼此都有需要依靠對方的訴求，木葉村需要大蛇丸研究對抗大筒木一族的方法，同時大蛇丸也需要木葉村提供一個給自己相對自由的研究環境。
大蛇丸的特殊能力沒有無限月讀影響的話木葉村是很難徹底殺死大蛇丸的，加上後續博人傳的劇情需要因此讓大蛇丸活了下來。
個人認為木葉村之所以不幹掉大蛇丸主要是大蛇丸的技能配置過於詭異，否則以大蛇丸對木葉村做的事情死罪可免活罪難逃。但是大蛇丸依舊活蹦亂跳的屁事沒有，是因為第七代火影寬宏大量麼？實際上是以木葉的手段沒有辦法保證能夠徹底消滅大蛇丸又能得到大蛇丸的各種研究成果。
除了無限月讀這種超強幻術以外大蛇丸的不屍轉生和咒印木葉村並沒有太好的辦法限制，咒印雖然需要藉助外部力量但是難說大蛇丸還留有其他後手不是。一旦木葉村和大蛇丸徹底撕破臉，木葉村有可能一直被大蛇丸糾纏下去，甚至有可能在實力衰弱的時候被大蛇丸從背後捅刀子。木葉村對於大蛇丸這種自己無法完全把控的力量只能採取懷柔政策，求同存異，避免兩敗俱傷的情況發生。
另外岸本在火影正篇完結的時候應該已經在考慮博人傳的內容了，而大蛇丸也是博人傳中鏈接劇情發展的一個關鍵人物。博人傳中的主角三人組成員中就有大蛇丸的研究成果，因此個人認為大蛇丸之所以在忍界大戰結束後沒有被木葉村幹掉，應該也和後續博人傳的內容需求有關係。
雖然大蛇丸在博人傳中戲份不多，但是如果沒有大蛇丸的話在邏輯合理性方面回存在很多問題，大蛇丸的養子如果沒有和大蛇丸之間的關係是不可能進入木葉村的忍者相信學習的，也不可能和鳴人的兒子建立關係和組隊。因此大蛇丸的繼續存活是為了博人傳的世界觀中主要角色之間的關係能夠更加合理。
最後總結一下，個人認為木葉村不幹掉大蛇丸的原因有以下幾個方面：①大蛇丸和木葉村之間有利益合作關係，而且一大蛇丸的能力木葉村沒有把握徹底消滅大蛇丸。②大蛇丸對於第四次忍界大戰順利結束有戰功③為了後續博人傳的劇情能夠順利展開，分析不到位地方請見諒，各位有其他想法歡迎留言討論。
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