研究人員首先從參與者肚臍中提取樣本，而後放入小瓶培養，最後提取DNA 此項研究由美國北卡羅來納州大學的肚臍生物多樣性項目組進行，共發現662種此前未知的細菌。
研究過程中，一組微生物學家從95名參與者的肚臍中提取拭子樣本，而後得出這一驚人發現。這一發現可能促使人們花更多時間，清洗自己的肚臍。研究中，科學家共發現大約1400種細菌，其中有80%的身份得到證實，它們來自40種常見的細菌種群，主要是無害的皮膚寄生細菌。肚臍內的細菌數量因參與者清洗肚臍的頻率存在差異。 《新科學家》雜誌記者彼得·阿爾德胡斯是其中一名參與者，由於定期清洗肚臍，研究人員並未在其肚臍中發現細菌殖民地。相比之下，科學作家卡爾·澤默的肚臍中則寄生著至少53種不同的細菌，其中一些的源頭令人吃驚。得知這一發現之後，澤默這樣寫道："在我肚臍中發現的細菌，有些此前只在海洋中發現，例如Marimonas。此外，我的肚臍中還發現一種名為'Georgenia'的細菌。在我之前，科學家只在日本的土壤中發現這種細菌。"
研究小組要求參與者將拭子放入肚臍，而後旋轉3次。在此之後，他們將拭子放進小瓶，讓細菌在小瓶中生長。一旦細菌生長到一定程度，研究人員便進行拍攝，並提取DNA樣本，與已知細菌進行比較。
在他們的網站上，研究人員描述了此次肚臍研究。他們指出之所以研究肚臍是因為每個人都有肚臍，它曾經連接著我們的過去。研究人員說："日常生活中，我們很少注意到肚臍的存在，也很少有人經常清洗細菌，這為細菌的生存提供了絕好機會。"項目領導人基利·胡爾卡表示："我們可能是唯一一群對人類肚臍進行如此大規模研究的人。"
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