首先，兩所大學都是著名的985大學，一個位於長沙，一個位於南京，而且都是以工科為特色的名校。最近今年，兩所大學的發展勢頭都非常好，是每年學生在高考和考研中都非常青睞的大學之一。
東南大學是原來的南京工學院，是從國立南京大學工學院獨立出來的，也是著名的“四大工學院”之一，也是“建築老八校”之一，是211工程大學、985工程大學及雙一流大學之世界一流大學A類大學。東南大學的工科實力很強大的，在建築學、土木工程、電子科學與技術 、交通運輸工程、電氣工程及自動化、生物醫學工程、信息與通信工程等專業學科有優勢。
東南大學，在教育部第四輪學科評估中，最高評級為A+級，建築學、土木工程、交通運輸工程、生物醫學工程、藝術學理論。A級，電子科學與技術。A-級，儀器科學與技術、信息與通信工程、控制科學與工程、城鄉規劃學、風景園林學、管理科學與工程。
B+級，哲學、應用經濟學、機械工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、計算機科學與技術、化學工程與技術、環境科學與工程、軟件工程。B級，光學工程、材料科學與工程、工商管理、設計學。B-級，力學、公共管理。
C 級，測繪科學與技術。
中南大學
中南大學源於中南礦冶學院也就是後來的中南工業大學，在新世紀合併了湖南醫科大學也就最著名的湘雅醫學院而名聲大幅提升。中南大學是211工程大學、985工程大學也是雙一流大學之世界一流大學A類大學，王牌專業有護理學、礦業工程、冶金工程，另外材料科學與工程、機械工程、交通運輸工程、土木工程、管理科學與工程也是國家一級學科。
學校設有30個二級學院，106個本科專業；現有一級學科國家重點學科6個，二級學科國家重點學科12個，國家重點（培育）學科1個，國家臨床重點專科59個；博士學位授權一級學科35個，碩士學位授權一級學科46個，博士專業學位授權類別6個，碩士專業學位授權類別30個，博士後科研流動站30個。
中南大學，在教育部第四輪學科評估中，冶金工程、礦業工程、護理學獲評A+級，馬克思主義理論、機械工程、材料科學與工程、控制科學與工程、計算機科學與技術、土木工程、安全科學與工程、臨床醫學、管理科學與工程獲評A-級，法學、工商管理、數學、統計學、生物學、測繪科學與工程、基礎醫學、化學工程與技術、地質資源與工程、交通運輸工程、藥學獲評B+級，公共管理、物理學、化學獲評B級，社會學、哲學、心理學、動力工程及工程熱物理、環境科學與工程、公共衛生與預防醫學獲評B-級，電子科學與技術獲評C+級，地質學、力學、電氣工程、信息與通訊工程獲評C級，口腔醫學獲評C-級。
最後，如果兩所大學對比來看，綜合實力上，目前應該還是東南大學略勝一籌，特別是工科實力上。但有一點是東南大學永遠的痛，那就是當年大學缺乏湘雅這種強勢醫學院支撐。雖然一直傳說在建醫學院，但目前還沒實際性進展。一旦東南大學擁有了類似湘雅這種醫學院的話，那東南大學將會迎來質的飛躍。
