伊拉克戰爭期間，薩達姆政權的部分高官在戰爭期間曾經來到敘利亞邊境，試圖進入敘利亞，但都遭到了拒絕，有些人已經被美軍逮捕。本來，身為同黨執政的伊拉克和敘利亞應該親如兄弟，因何在危難時期不相互支持，反而相互攻擊呢？
原來，在20世紀五六十年代，敘利亞和伊拉克很不穩定，經常發生政變。1963年，伊拉克和敘利亞的復興黨分別發動革命，取得了成功並建立了復興黨政權。取得政權之後的復興黨曾經試圖將兩個國家合併，卻並沒有成功，反而引起兩國的敵對。
於是兩黨分家，伊拉克和敘利亞兩國的復興黨都稱對方背叛了革命。之後，雖然復興黨政權曾經出現短暫中斷，但幾十年來大部分時間裡，兩國主要的執政黨都是復興黨，執政者分別是薩達姆家庭和阿薩德家庭。
老阿薩德出身於什葉派分支阿拉維派，而敘利亞民眾大多是遜尼派。薩達姆和他的支持者都出身於遜尼派，但伊拉克民眾則大多屬於什葉派。於是，兩個國家都成了少數派統治多數派的國家。因此，敘利亞支持伊拉克境內的什葉派反對遜尼派政府，而伊拉克支持敘利亞的遜尼派反對什葉派政府。
另外，庫爾德問題是兩國共同的問題。在北部山區，敘利亞和伊拉克各有一塊庫爾德人居住地，他們不斷要求獨立，進行反抗，成了兩國政治的瘡疤。敘利亞和伊拉克不停地摳著對方的傷疤，避免癒合，支持對方境內的庫爾德人，卻鎮壓己方境內的庫爾德人。
兩伊戰爭期間，阿拉伯大部分國家都支持屬於阿拉伯人的伊拉克，反對波斯人的伊朗，只有敘利亞支持伊朗，反對伊拉克。為此，敘利亞在伊拉克最困難的時候封鎖了伊拉克通往地中海的石油管道，差點讓伊拉克財政崩潰。然而 ，隨著薩達姆政權的垮臺，阿薩德家族也被認定為獨裁統治，目前，正在遭遇著重大危機。