1942年1月,升任第1裝甲軍軍長;3月,巴頓奉命調到因迪奧訓練中心,負責坦克部隊的組織工作;7月,調回華盛頓,擔任美國西線特遣隊在北非登陸的培訓工作;11月,作為北非遠征軍西部特遣部隊司令,率部參加北非登陸戰役,11日佔領法屬摩洛哥,擔任住摩洛哥總督。後負責組建美國第7集團軍。
1943年3月,調到突尼斯,他參加整裝被隆美爾擊敗的第2軍,並接替弗雷登道爾任該軍軍長,並晉升為中將;7月,擔任美國第7集團軍司令,在英國亞歷山大將軍的指揮下,配合蒙哥馬利將軍的第8集團軍在意大利的西西里島登陸,搶在蒙哥馬利之前拿下了該島首府巴勒莫。其間曾因兩次打耳光事件引起美國軍界和國內輿論反對。