五朵山是久负盛名的中原道教圣地；二十世纪初，旅游开发者在五朵山东麓重修庙宇道场和建造并完善旅游设施 ，成为今天的4A级旅游景点。
旦凡圣地名胜，人们都爱好考究它的历史成因；五朵山及其道观，南阳也有许许多多不同的说法；有的说它始于西汉，有的说始于东汉，更有的说是老子修炼的场所……。只有传说，而缺乏依据。
据文献记载，《山海经》称五朵山为依帝山，但这部先秦古典著作中看不到有类似“道观”方面的只言片语；北魏郦道元称五朵山为岐棘山（见《水经注》，）；北宋乐史《太平寰宇记》称五朵山为骑立山；明代开始才称此山为五朵山，据《明嘉靖南阳府志》记载，五朵山五峰并歭，圣朵、禅庵朵、摩云朵、娇女朵、哑女朵摩肩而立，故称五朵山，自此五朵山名沿袭至今。
唐贞观年间，太宗李世民崇奉道教，著名道人吴筠隐居五朵山，后被太宗召见，始在此山建庙，民间以此庙为祈雨之地，颇为灵验，渐有名声；这也只是传说，不过，太宗崇奉道教，吴筠隐居此山倒是真的。
宋朝乾德四年（公元966年）有碑记：称此山庙为骑立山龙堂；元朝泰定三年（公元1326年）有碑记：称此山庙为嘉显候庙；明代《英烈传》中有朱允炆避难五朵山的说法；说建文帝朱允炆下野后辗转至五朵山圣朵，在南召太山庙天宝观出家的著名道人张三丰慕名主动到五朵山相救，共同弘扬道场，自此，称五朵山为“北顶”，又称祖师顶、金顶。朱允炆与张三丰后又南下武当山，创建庙宇，被称南顶；南顶与北顶遥相咉晖，两地香火一样，民间有祖师爷“日不离武当，月不离五朵”的说法。
清乾隆《南召县志》收录了明成祖朱棣的《访张三丰书》，这道御书是想通过张三丰探寻建文帝朱允炆的下落，可以奉为信史。
清代统治者重佛轻道，但南阳民间仍尊奉道教；“朝奉北顶”成为民间重要的祭祀活动。
清光绪九年（1883年），地方人士主持扩修五朵山祖师庙，将真武行宫改大规制，修建圣公圣母殿，均为铜梁铁瓦，周围围以石墙，构成城中之城；其下部建有清牛宫、玉皇殿、老母殿等殿堂，并有道房数十间。民国时期，五朵山道观均有续建。
1958年大跃进时期，道观的铜梁铁瓦被拆，用于炼钢铁杆；文革时期，五朵山道观遭到进一步毀坏。
1978年改革开放以来，宗教政策得以落实，道教活动恢复，五朵山道观成为河南省重点道观之一。1993年，南召县人民政府颁发聘书，礼聘全国政协常委、中国道教协会会长、中国道教学院院长、著名道人闵智亭任五朵山道观名誉道长，（闵智亭，南召县城关镇人，）
从此，五朵山以道观名胜和名山秀水为主题的旅游开发兴起，不仅为全国民众提供了旅游的好去处，同时，也给五朵山下的群众脱贫致富带来了极大的帮助。
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