據考古學家發現，遠在幾十萬年前的“大窯文化”遺址，已有原始人類的生活足跡。經考證，國家文化部於1979年正式命名為“大窯文化遺址”，並確認為已知的世界最大的古人類石器製造場。證明今呼和浩特地區是中華民族古老文化的發祥地之一。
舜時，今回民區與呼和浩特其他地區稱“幷州徼外”，當時為葷粥族所居地。
夏、商、周時，今呼和浩特地區或稱“幷州徼外”、或稱“冀州徼外”。從公元前21世紀起，今回民區及呼和浩特其他地區就是中國北方少數民族的遊牧地。
約公元前300年，戰國時期趙國的趙武靈王征服居於今呼和浩特地區的少數民族“林胡”和“樓煩”,在陰山(大青山)山脈南麓設置雲中郡(今托克托縣古城村)，今回民區屬雲中郡領地。趙武靈王為防禦北方遊牧民族南下，沿陰山南麓築長城。今回民區沿大青山部分鄉村仍有趙長城遺蹟。
秦始皇統一六國後，在其疆域內設36個郡，原趙國的雲中郡仍為一郡，管理今呼和浩特大部地區，今回民區屬雲中郡轄地。
西漢初承襲秦制，今呼和浩特部分地區仍稱雲中郡，今回民區屬之。
秦漢之時，居於漠北的匈奴族發展壯大起來，今呼和浩特地區(含今回民區)成為漢王朝與匈奴政權必爭之地。
東漢末年，鮮卑的拓拔部佔據今呼和浩特地區，後拓拔部建立北魏，又建盛樂都城(今和林格爾縣土城子村)，今回民區屬盛樂城管轄。後，魏遷都平城(今山西大同)，將盛樂都城安置歸順於魏的敕勒族，故今呼和浩特地區有“敕勒川”之稱，今回民區就在敕勒川地界內。
到公元6世紀中期，今呼和浩特地區曾是突厥族居地，因北有白道口(今回民區境內),故今呼和浩特地區在隋朝時稱“白道川”。隋朝建立初，打敗突厥，在今呼和浩特地區設榆林關總管府，不久又改為雲州總管府。隋大業元年(公元605年)，改雲州為定襄郡，今回民區為定襄郡所轄地。
唐代，唐王朝先後在今呼和浩特地區設雲中都護府，又稱單于都護府，後又改置為東受降城，今回民區為其屬地。
五代十國時期，契丹族強盛後佔據今呼和浩特地區，於遼天祿元年(公元947年)改國號為遼，設置豐州(城址今白塔村北)，今回民區為豐州屬地，屬雲中州西京道(治所在今山西大同)管轄。
金太祖收國元年(公元1115年)，女真族建立金國，金代沿襲遼制，改西京道為西京路，今呼和浩特地區仍稱豐州，後，金國將豐州改稱天德總管府，今回民區屬之。
元王朝建立後，沿用金制，今呼和浩特地區仍稱西京路豐州，隸屬中書省大同路管轄，今回民區為豐州轄區。
明王朝建立初，為防北元政權，改郡州縣制，在長城以北設置五衛，今回民區屬豐州衛屬地。明朝永水樂年間，其統治勢力南遷。明正統年間，放棄長城以北軍事設置，使當時稱為“豐州灘”的今呼和浩特地區成為蒙古土默特部駐牧地，所以今呼和浩特地區就有“土默川”之稱，今國民區為士默川之中的一部分。 後來土默特部的阿勒坦汗王於明隆慶五年(公元1571年)被封為順義王。隆慶六年(公元1572年)，阿勒坦汗之妻三娘子在今呼和浩特玉泉區修建城池，時稱“庫和屯”(即呼和浩特)。明萬曆三年(公元1575年)，城垣建成，明王朝賜名“歸 化城”。今回民區為歸化城屬地。
明末清初，今呼和浩特 特地區成為女真部建立的後金和居於漠南蒙古頭領察爾部林丹汗爭 奪的西北部戰略要地。明思宗崇禎七年、後金太宗天聰八年(公元 1634年)，後金統一內蒙古各部，林丹汗死，為加強對今呼和浩特地區的管理，把居於今呼和浩特地區的土默特部分為左右兩翼，設左右翼都統管理，今回民區為左翼轄地。清世祖順治元年(公元1644年)，清順治帝取代明朝的統治。為加強對歸化城的管理，清康熙三十二年(公元1693年)，清王朝命費揚古為安北將軍，駐歸化城，專管歸化城都統、副都統及訓練官民等事。康熙三十六年(公元1697年)，康熙將第六女(大排行為六，實為四公主)和碩恪靖公主下嫁給蒙古喀爾喀部土謝圖汗之子敦多布多爾濟，公主初居於清水河，後移住歸化城，此後又移居歸化城北5公里建的一座仿皇宅御花園格局建築的公主府內。清雍正元年(公元1723年)，清王朝將歸化城軍政、民政分設，歸化城土默特副都統只管蒙古族民政和軍事，設歸化城理事同知專管民政，對漢、回等民族進行管理，隸山西大同府。雍正七年(公元1729年)，歸化城理事同知改屬山西朔平府管轄。
雍正十三年(公元1735年)，清王朝為加固北方防務，議定在原歸化城東北5裡許築一座新城，作為八旗兵駐防之所。乾隆四年(公元1739年)六月初八，綏遠城竣工。歷時2年零4個月。綏遠城建成後，被稱為“新城”或“滿洲城”，歸化城被稱為“舊城”。綏遠城建成後，為保證滿洲八旗兵之軍餉，增設綏遠城理事同知，又稱綏遠城理事同知廳、綏遠城糧餉同知廳、糧餉府(又稱二府衙門)、綏遠城廳。乾隆六年(公元1741年)，在歸化城設歸綏道，初稱山西總理旗民蒙古事務分巡歸綏兵備道，後改稱山西分巡歸綏兵備道。其職權為總理旗民蒙古事務，隸屬山西巡撫，管轄歸化、綏遠、托克托、和林格爾、清水河、薩拉齊六廳(除綏遠城廳外，歸、託、和、清、薩各廳又稱口外五廳)，監督各廳稅務，處理旗(滿族)、民(漢族)、蒙古族之間的交涉，刑訟事務，這是今呼和浩特地區旗、道、廳並立之始，今回民區屬歸化廳管轄範圍。
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