目前，牽扯事業單位前途和命運和改革有兩項，一項是2019年3月前全國省市縣要求全面完成的新一輪機構改革中，涉及到職能劃轉的事業單位，這主要是和政府機構改革相關，是隨著政府行政機關職能劃轉，而隨之改變。
一、事業單位分類改革：事業單位分類改革中，許多試點地方事業單位改革已經完成，其它地區分類方案和分類目錄已經確定、核准，部分改製為企業的事業單位也基本改到位，包括大部分自收自支類事業編制類型從2014年開始陸續取消。但事業單位改革進展不平衡，大多數地區只是完成了分類，具體改革也只是部分公益二類和生產經營類基本確定，其它事業單位基本沒什麼變化。
1、行政類事業單位：是指行政監管類和行政輔助類，以及部分行政委託類事業單位，按照政策規定，其職能劃歸機關，今後不再設立行政類事業單位，但從目前實際情況來看，由於基層行政機關單位數額限制較死，行政編制只減不增，本來行政編制就少，這幾年還因為機構改革和控編減編取消了不少，因而這類事業單位改革的最終去向，是基本保持不變，只是今後不再增批該類事業單位。
2、公益一類事業單位：是指由國家設立的醫療衛生、教育、科研等承擔基礎性公共服務職能、沒有收費職權的事業單位，這類事業單位改革的去向是基本保持不變，是事業單位改革過程中影響最小的類型。公益一類事業單位，也是參公事業單位集中分佈的類型，除過黨群團機關之外，所有的參公事業單位，基本上都屬於公益一類事業單位，但並非所有的公益一類事業單位都能夠參公。除鄉鎮衛生院外，公益一類事業單位基本上都是全額供給的地方財政撥款單位。當然全額、差額是事業單位分類的另一種方式，和是否公益一類還是公益二類聯繫不大，也沒有什麼可比較的地方。
3、公益二類事業單位：是指有收費職能的公益類事業單位，其改革方向是：其職能如果能被社會或者市場所代替，將會被推向市場，參與公平競爭，如果職能不能被社會或者市場代替，將保留職能及單位，或者剝離後部分推向市場，不能或者不宜由市場配置資源的，其職能部分轉由其它公益類事業單位或者行政機關承擔。這部分事業單位主要是差額或者自收自支類事業單位集中的類型，改革力度較大，改革方式多樣，要區別具體情況具體對待。其人員編制，該取消的取消，該改制的改制，但對於正式職工來講，不會簡單推向社會，一般都會按照“編隨事走、人隨編走”的原則，隨職能調整到新的單位，年齡或者工齡符合條件的，可提前由社保部門接管。公益二類是事業單位分類改革過程中影響最大，也最難確定最終歸屬的單位，有保留的，有合併的，有整合的，有剝離的，有直接改企的。
4、生產經營類事業單位：是指由國家設立的從事生產經營性活動的事業單位，這類單位的改革去向是全面改製為企業，推向市場，自主經營，自負盈虧。這類事業單位的人員，在改革過程中，除部分管理人員因身份問題，會調整到其它事業單位任職外，其他人員會隨單位改革全面推向市場。生產經營類事業單位改革基本結束，只剩下一部分長期由地方財政供養的行政輔助、後勤管理類單位。生產經營類事業單位多使用自收自支類事業編制，對於自收自支類編制，有兩種理解，一種是正規的事業編制分類，由同級地方政府確定，報上級機構編制部門備案，這類從2014年開始要求全部核減，用其它事業編制置換，一些省份已經完全取消。另一種理解是因為由地方政府確定，因而隨意擴大規模，不備案，屬於自我消化類型，不被上級機構編制部門承認，人員也多以臨時人員或者比較複雜不正規的來源為主。《機構編制法》即將出臺，今後不再設立事業編制新類型，事業編制也由省統籌，自收自支類事業編制全面取消，不再被承認。要麼置換，要麼核減人員，沒有第三條出路。
二、新一輪機構改革過程中，事業單位職能合併到行政機關的，由於基層行政編制緊缺，大部分還是會保留事業編制及事業身份不變。一種是臨時性質，在改革過程和緩衝期內想辦法解決，國家規定，機構改革中出現的臨時性超編和混編現象，允許存在3年的緩衝期，主要利用自然減員予以解決。另一種是安置到機關下屬事業單位，繼續使用事業編制，保留事業身份，具體看各地實際情況而定。第一階段部委改革已經完成，6月份部委“三定方案”全面出臺實施，部委改革全面完成。下一步開始省級機構改革，中編辦明確在省市縣改革過程中，既要堅持原則，又要根據各地實際情況靈活處理，不搞一刀切。
省級改革要堅持原則為先，同時體現地方特性。部委改革已經為省級改革劃定了框架，省級政府機構改革，首先以部委改革為樣板，設置政府部門和機關機構，劃轉職能，新增、瘦身、整合，人員編制按照“編隨事走、人隨編走”的大原則，不增加機構，不增加編制，不增加人員，不增加財政負擔。但同時，各省也要根據實際情況，在機構改革過程中進行微調，以最有效率的方式體現機構改革的本意，尤其是在市縣改革過程中，更要體現各地的特性，在不突破原則的情況下，靈活處理。省級改革是年底前完成，市縣改革2019年3月前完成，具體方案要根據各地實際情況制定。
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