金憲章被張得勝安排在部下任連長，不久，孫殿英在郟縣城接受鎮嵩軍憨玉琨師改編，所部被編為第五混成旅，孫殿英任旅長，金憲章被任命為張得勝部下營長，拉向密縣駐防。
1925年3月，胡憨之戰中憨玉琨慘敗自殺，孫殿英率隊投靠國民三軍，被第二師葉全收編為混成旅，後升任國民三軍第二師師長。金憲章在追隨孫殿英時，能相機進退，勇猛善戰，受到孫的器重，隨孫殿英東進打開亳州後，被提拔為部下團長。一年後，孫殿英又接受直魯聯軍褚玉璞的改編，任三十五師師長，金憲章仍為部下團長。
馮玉祥發動驅奉，張宗昌、褚玉璞退出關外，孫殿英被迫退到河北薊縣、遵化一帶，投奔蔣介石，任第十二軍軍長，歸屬徐源泉第六軍團指揮，金憲章率團駐紮商丘。正在此時，孫殿英卻幹出了轟動全國的“東陵盜寶案”。
“東陵盜寶案”案發之後，孫殿英把隊伍拉出來，但他卻腳踏兩隻船，暗裡又派金憲章與西北軍孫良誠聯繫，當孫良誠的交際處副處長劉曾若與金憲章正在聯絡商洽之時，唐生智出兵打敗了孫良誠，孫殿英又秘密派副官蘇勳丞和唐生智接頭。為了向唐生智靠攏，他把部隊移駐洛陽付店街，終被唐生智委以第九軍團司令。未及，孫殿英與徐源泉的第二十八師進行決鬥，金憲章率部駐守關莊、何寨、薛店、郟縣一帶，堵死去路，給孫殿英創造了戰機。戰鬥勝利，金憲章升任旅長。
孫殿英是個出爾反爾之人，儘管他接受了唐生智的番號，但他更嫻熟混水摸魚的訣竅，於是又與馮玉祥、汪精衛等不斷互派代表聯絡，並利用戰爭空隙，解決了徐源泉、張冠五等部的小股部隊，壯大了自己的實力。
1930年8月，中原混戰開始，閻錫山、馮玉祥任命孫殿英為第四方面軍第五路總指揮兼安徽省政府主席。他把隊伍拉到開封，與萬選才、鹿鍾麟、孫良誠、宋哲元、徐永昌等聚集一起狂賭，利用賭博作為交際工具，故意贖多贏少，並把孫良誠派到他那裡的劉曾若任命為安徽省民政廳長，以示友好，使孫良誠在馮玉祥面前替他說話。
馮玉祥為利用孫殿英，特邀他到洛陽見面。孫殿英帶著金憲章及其副官一幫人速速趕赴洛陽拜見馮玉祥。
一見面，馮玉祥就拉著孫殿英的手說：“殿英老弟，論革命只有咱倆！咱們是好朋友，好同志！在反清朝這一點，我革的是活人的命（指驅逐溥儀出宮），你革的是死人的命（指掘墓盜陵）。要說挖墓有罪，挖平民墓也有罪，清朝皇帝過去扒了我們多少墓？現在我們中華民國的土地上，哪能讓那些死去的皇帝蹲著？你幹得好！”
孫殿英對馮玉祥的鼓勵非常高興，他回到部隊後，不止一次地對金憲章說：“憲章啊，你聽到了吧，馮總司令多偉大，他要是叫咱賣命，孬種才會含糊!”
中原大戰開始，亳州是戰略防禦的重點，蔣介石派王均、葉開鑫、金漢鼎等部近十萬人，向孫殿英發起進攻。孫殿英放心不下，將金憲章調駐亳州，厚增力量。
在一個多月的防守戰中，金憲章周密部署，精心安排，致使蔣軍久攻不克。因無法將孫殿英繳械，蔣介石又派張鈁、王翰鳴先後到毫州實施勸降。鹿鍾麟電令孫殿英把張鈁押解開封，孫殿英心裡卻打起自己的小九九，他想在蔣介石處留條後路，因而回電稱：“解部懲辦，意有不忍，當嚴行看押，待戰爭結束再行解部。”他以張鈁為人質，向蔣介石很很地索得一筆鉅款，才將張鈁放走。
在困守亳州城一月零三天的時間裡，金憲章和其手下弟兄，吃
沒吃喝沒喝，但卻打出了威名，直到第六師師長劉月亭出兵，亳州之圍始解。（潘運明）
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