一名小镇里的女高中生宫水三叶和东京四谷的男高中生立花泷从某天开始发现自己在睡后感到身体疲累却没记忆，而身边的人都说他们的行为不正常。他们两个很快发现了自己和另一个人会灵魂互换。两人靠手机互相留言，告诉对方今天自己做了什么。三叶因是女生，促成奥寺和泷的约会。而泷帮助柔弱的三叶在学校更好的成长。
一次，三叶的外婆带着三叶和妹妹四叶一起到宫水神社位的山上祭祀。一路上外婆告诉他们宫水家族的女巫都会编结绳，所做的口嚼酒也可以变成连接。她们三个在一个洼地的中心献祭。在回程时外婆对三叶说：“你是不是在做梦？”。三叶听完画面突转，原来刚刚是泷附在了三叶的身体上。泷听到这句话从梦中惊醒。
随后泷在和奥寺约会时想起了一些事，三叶的信息告诉泷可看彗星。泷觉得奇怪就打电话给三叶却不通。从那天起，泷就再也没跟三叶互换身体。泷决定去找三叶。他画下曾经看到的景，和同学藤井司和奥寺一起去找。他们找了很多地方都没有人知道。最后在一家拉面店的老板回忆起自己的家乡，曾叫系守町。泷让老板带路，去到时发现这里真的成了被陨石击中后的一个巨大的坑。村民也因这场灾难全部遇难，包括三叶。泷难受的打开手机却发现三叶的留言消失。晚上泷和奥寺聊天，无意聊到结绳。泷想起外婆的话，决定回到过去帮三叶躲过灾难。
在老板的帮助下他去到以前和外婆祭祀的地方。找到神社后喝掉里面放的口嚼酒。喝完后龙发现自己又和三叶互换身体。泷利用三叶的身体在镇里准备解救大家却被外婆识破。泷和三叶的朋友策划避难行动，用炸药造成骚动来疏散镇民。泷在曾经祭祀山坡上有异样，与在泷身体里醒来的三叶在黄昏时相见。泷在三叶手中写了“喜欢你”，三叶还没写完名字两人再次分离。回到真身的三叶继续完成计划，却被父亲阻止。
随后是泷已经在社会工作，对以前的事很模糊。在看到新闻后突然很想找一个已经想不起来的人。偶然之下两人在不同的电车里见到了彼此，于是下车狂奔寻找对方。最终在阶梯相会。泷开口问：“我是不是在哪见过你？”三叶回：“我也是。”最后一起问：“你的名字是？”
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