用PPT做頂級科研圖片,美呆了

大家讀論文或者聽報告的時候,經常會發現,論文裡或者大牛的 PPT 裡的圖,不僅看起來賞心悅目,而且還能明確地說明科學問題。反觀自己平時的作圖,發現,差距不是一點點。

於是很多同學都吐槽 PPT 不夠高級,畫不了高級的圖。應該是用別的軟件,比如 Illustrator,Graphic 等。但我不這麼覺得,PPT 是一款非常實用且功能強大的軟件,即使用 PPT 也能畫出一張賞心悅目,且明確反應科學問題的圖。

那麼,作為一個科研汪,如何用這款強大的軟件畫一張能放在 paper 裡、比較高大上的圖呢?

古人云:不積跬步無以至千里,不積小流無以成江海。說的是一點一滴的堅持,終會成就大業。我想說的是,再高大上的圖,也都是由最基本的圖形,一點點累積起來的。

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有時候你需要的可能只是一些耐心

PPT 中插入的圖形只是一些標準圖形。比如,三角形,正方形等等。這些圖形可以滿足一些基本需求。但有時候,我們需要的不僅僅是基本圖形。

比如,我需要一篇葉子,一顆植物,一個形狀怪異的蛋白質亞基。這時候,標準圖形就顯得很無力。

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我們可以利用這項功能,去畫一片葉子,一株植物,一個形狀奇特的蛋白亞基。於是,我畫了幾片葉子,用這幾片葉子組裝成一株擬南芥。

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PPT 作圖之畫擬南芥

這是比較簡單的應用。如果能把通過繪圖把實驗數據可視化,那麼,這個方法做出來的圖,將會顯得更高級。

比如,有一段時間,我得到一批 RNA-seq 數據,裡面有許多差異化表達的基因,通過分析發現許多差異化表達的基因編碼的蛋白都用來組裝光系統蛋白。常用的 RNA-seq 數據可視化的方法是 Heatmap(熱圖)。於是,我做了一個熱圖。

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Heatmap(熱圖)表示的基因差異化表達

我需要:

1. 在這張圖裡面先分別標註哪些蛋白質是葉綠體基因編碼的,哪些蛋白是細胞核基因編碼的;

2. 標註出實驗中觀察到的,葉綠體基因和細胞核基因的差異化表達。

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磷脂雙分子層

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接著,你可以把這些組裝起來(綠色的部分,就是由葉綠體基因編碼的蛋白亞基)

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植物葉綠體中的光系統,綠色為光合作用相關的葉綠體基因。

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從一個亞基到光合作用系統的繪製過程 GIF 圖

最後,把這些圖精修一下,加上自己的實驗數據(每個編碼每個亞基的基因表達水平)就可以了。

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有時候,你可能需要一點技術

上述操作,可以說是一個非常龐大的工程了。但,其實可以不用那麼麻煩。

這時候,你就需要一些運氣和技巧。

需要的運氣就是,如果你上網搜,剛好能搜到某些蛋白或者細胞結構的「矢量圖」(後綴為「.eps」)。學植物分子生物學的我,運氣並不好,並沒有搜到光系統的矢量圖。不過,學動物分子生物學的運氣就好一些。比如,你可能需要畫一顆心(髒)。於是,我在網上找到了這樣一張完美的心臟。

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下載這個圖像,用 Adobe Illustrator 打開,然後點擊 File export As (Enhanced Metafile (emf)) 格式的文件。

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移開那些暫時不需要的圖標(也可以存一個備份,以備不時之需),留下一個完美的心臟。為了表示,這個方法確實可行,我把下面一些血管的顏色變成了亮粉色。

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