農村生活垃圾可隨降雨進入河流湖泊，或被風颳進水體，從而將有毒有害物質帶入水中，危害水中生物，汙染人類飲用水水源，危害人體健康。農村生活垃圾中含有某些持續性有機物，其在環境中難以降解，當進入水體或滲入土壤中，將會嚴重影響當代人和後代人的健康，對生態環境也會造成長期的不可低估的影響。農村生活垃圾堆積產生的滲濾液危害更大，它可進入土壤使地下水受到汙染。
在北方地區，由於冬季時間長，三格化糞池的容積要足夠大；化糞池的建造深度要超過凍土層，如在吉林等高寒地區，化糞池底部深度應達1.5米以上。人尿中的養分以易於植物吸收形式存在。氮是以尿素的形式存在，它很容易降解成易於植物吸收的氨和硝酸鹽。磷主要以磷酸鹽的形式存在，鉀以鉀離子、硫以硫酸鹽的形式存在。這意味著它們都是以有利作物吸收的形式存在，這使尿成為很好的生物肥料。
人尿的收集與貯存需要低溫、避光、密閉，故貯尿池或尿收集器要建造（放置）在日光不能直射的地方，桶需加蓋或密閉。
三格化糞池衛生廁所，具有糞便就地無害化，殺滅糞源性病原體，流行病學安全可靠；沒有臭味以及蒼蠅等對周圍環境的汙染；糞、尿可以資源化，有利於生態農業建設；節約能源和水資源，減少生活汙水的排放與處理量；造價適度並可調節，也可建造在室內與室外衛生間，可塑性強。
三格化糞池改造完成後廁所不會會產生臭味和蒼蠅，不會滋生細菌，可達到糞便無害化處理的要求。因此，三格化糞池旱廁改水廁在農村容易被人們接受，也很認同國家推行的廁所革命。經三格化糞池處理後的汙水沉澱過濾後，到第三格的便是可利用的灰水，迴歸到耕地作為肥料，節約資源、人力和財力。為新農村建設打頭陣。
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