天才物理学家汤川学（福山雅治 饰）此次又受内海薰（柴崎幸 饰）所托，调查一件不可思议命案。受害人富樫慎二被发现死在河边，面目指纹尽毁。最大的嫌疑人是他的前妻花冈靖子（松雪泰子 饰），然而靖子却有着完美的不在场证明。一个人能够同一时间出现在不同地方吗？当汤川发现住在靖子隔壁的是当年的大学同学、同为天才的数学家石神哲哉（堤真一 饰）时引起兴趣。
毕业后因要照顾父母没有留校反而去高中教数学、一直生活得很落魄的石神每晚利用公用电话教靖子如何应对警察追查，靖子渐渐感到被束缚，但是由于给出的口供毫无可疑之处，警察决定放弃对靖子的调查，这时汤川却指出石神是关键人物。
案件的真相如何？世界上真有一个人同时出现在两个地方的事情吗？本片改编自日本人气推理小说家东野圭吾06年的直木奖获奖作品。
东野圭吾，日本著名作家。1958年生于大阪。1985年，以第31届江户川乱步奖获奖作品《放学后》出道，开始扬名立万。20年作品逾60部，几乎囊括了日本所有大奖，1998年，《秘密》获第52届日本推理作家协会奖，入围第120届直木奖；1999年，《白夜行》入围第122届直木奖；2001年，《暗恋》入围第125届直木奖；2003年，《信》入围第129届直木奖。2006年，《嫌疑人X的献身》终于捧得日本文学最高荣誉直木奖。
《嫌疑人X的献身》讲述了百年一遇的数学天才石神，每天唯一的乐趣，便是去固定的便当店买午餐，只为看一眼在便当店做事的邻居靖子。
靖子与女儿相依为命，失手杀了前来纠缠的前夫。石神提出由他料理善后。石神设了一个匪夷所思的局，令警方始终只能在外围敲敲打打，根本无法与案子沾边。石神究竟使用了什么手法？
故事从靖子母女失控杀人说起。
被杀者是靖子的前夫，一个十足的混混。游手好闲、挥霍度日，没钱的时候向靖子伸手，若是不给，自然少不得一顿狠揍。忍无可忍的靖子与其离婚，为躲避他的纠缠更是几番搬家。我想平静度日应该是这对母女最大的心愿，但这样的心愿竟也是无法被满足的。那个混混再一次找上了母女二人。而这一次，愤怒的母女冲动之下将他杀了。坦白说这样的人被杀我并不同情，我同情的是这对母女必须为此而承担的后果。在她们惊惶无措之下，隔壁邻居，一直暗恋着靖子的石神伸出了援手。他用自己过人的天资设了一个局，让警方无论如何抓不准案子的关键。我以为如果没有汤川，石神的计谋应该是会成功的。但显然让有罪之人逍遥法外这样的情节不会出现在东野圭吾的书里，哪怕那个罪人多么值得同情。
我们所知的真相是靖子母女杀了富樫慎二，石神哲哉帮其掩盖真相。而当故事一步步推进，真相之后的真相被一点点揭开，内心的震撼实难言表。我可以想象一个人会因为爱另一个人而去撒谎、去欺骗、去顶罪甚至去杀人……但我不曾想到的是石神会因为想要帮靖子掩盖杀人真相而去杀害另一个无辜人……
爱情是什么？是索取还是付出？而石神的爱情应该像徐志摩说的那样“不求有结果 ，不求同行，不求曾经拥有，甚至不求你爱我”，因为他说“一个人只要好好活着 就足以拯救某人”。
故事的最后，真相大白于天下，靖子崩溃了，石神也崩溃了。
在《犯罪嫌疑人X的献身》里，看到了最丑陋的人性、最无私的奉献、最深情的爱意以及最绝望的结局。
在小说行将结束的地方，靖子接到学校老师打来的电话，听到女儿美里割腕自杀的消息，当即心理防线全面崩溃，并觉悟自己照此下去将终生良心不安，最终向警方自首。
将美里的割腕解释为促使靖子自首的最终推动力，未尝不可；但是假如说美里的自杀也暗示着靖子内心同样不可能平静地享受石神以自身牺牲换来的幸福生活，也就是说，即使没有汤川学的来访和美里的自杀，在自己良知的谴责下，靖子也完全可能自行感化、投案自首，那么，对这部小说的解读会呈现出另一种面貌，一些被认为枝蔓的细节，也就可以被重新解读为必不可少了。
石神和这对母女的初次相见，被人认为是画蛇添足。然而，这一段的语言却是解读石神之爱的重要资料。“怎么会有眼睛如此美丽的母女？”“但是想象母女俩的生活就令人开心，在世界这个坐标上，竟有靖子和美里这两个点，”“星期天最幸福，只要打开窗子，就能听到她们说话。”“他压根儿没有要和她们发生关联的欲望，他们不是他该触碰的对象。”在这两页的篇幅里，东野可曾将靖子一人单独提出来？石神的“爱恋”对象究竟是一个靖子还是那一对母女？
日本文化中有一个重要的主题，那就是守护。在这部小说里，石神守护的“崇高的东西”，并不是靖子一个人，而是靖子和美里两个人的幸福。
所以，靖子和美里从来不是可以分开来看待的两个人，她们有着相同的情感、相同的良知，也就会有相同或者相似的命运。美里的割腕，也就暗示着，即使真相未被汤川学揭露，靖子也将承受不了良知的巨大压力，走向投案自首的道路。书中P243最后一段似乎是反证：“得知他去自首时，她以为他只是替她们母女顶罪。听了汤川的叙述，蕴藏在这段文字中的深情，才真正强烈地朝她心头涌来。”汤川学的叙述确实起着十分重要的作用，但是毕竟只是催化剂，而非必要的化学成分。必要的化学成分已经准备好了，那就是石神的顶罪替死。而催化剂可能是靖子独处时良心的责问，也可能是反复阅读石神最后告白时感动的缓慢积累和猛烈喷发。
从某种意义上来说，美里是另一个靖子，美里在内心的煎熬下选择了割腕，靖子也就会在良知的逼问下选择自首。
更进一步说，因为这种情感的因素的存在，石神的骗局从一开始就注定了失败。这一失败并不表现为他自己身陷囚牢，因为这恰恰是他骗局中最关键的一步。他的失败是未能保护靖子和美里的幸福。他每一步都算得很好，但是他没有把靖子和美里的情感算进来，所以，从一开始他的骗局就有致命的缺陷。直到小说的倒数第二页，一切仍然在石神的掌控之中，即使他的骗局本身被识破，他也能够利用警察和起诉制度上的固有缺憾实现他的目标——靖子和美里将不会受到起诉，她们的生活将像童话的结尾一样，从此永远幸福下去。但是，临到最后一页，这个看似完美的布局却受到致命的一击，顷刻间，石神的一切谋划都灰飞烟灭，而导致这一后果的，正是连本人也无法控制的感情因素——靖子良心上的谴责和对石神之爱的感动。这是东野的高明之处。
也许“只要抛尸就好了”这种指责在寻常的推理小说中可以畅行无阻，另杀一人反而显得拖沓累赘。但是，感情这一因素的介入，却让这种指责寸步难行。石神煞费苦心切断命案和靖子母女的一切联系，就必须制造另一桩命案。这样的构思不可谓不绝妙。作案时间和杀人现场既是伪造，也非伪造。如果不制造另一具尸体，警察势必能够通过各种高科技手段查出死者的实际死亡时间是三月九日。美国那些食之无味的高科技破案片就是明证。石神必须制造另一具尸体，让一切无懈可击。他唯一要做的就是混淆身份。两桩看似稀松平常的杀人案，巧妙地混为一谈，警察被耍得团团转，却始终碰不到一点儿边。石神分配给靖子母女的任务只是实话实说。这是最轻松的任务，对任何演技都没有要求。
但是石神忽略了最重要的一点：靖子和美里是有感情、有良知的人，不是听任他操纵的木偶，能够抱愧一生却又幸福一生。这又是压在靖子和美里身上最沉重的任务，不，是不可能完成的任务：在感情和良知的双重重压下，美里选择了割腕，靖子选择了自首。
另一面，石神却任凭自己宣泄感情。这个在数学上堪称百年难遇的天才，在感情上却是个白痴。他以为不吐露一个爱字，对方就感受不到自己的爱意。试想如果他最终不仅在警察面前，也在靖子和美里面前打扮成一个变态跟踪狂，或者以其他的方法将他所作的一切归因于他自私的变态爱恋，靖子和美里还会承受那么重的压力吗？靖子之前就萌生过这样的念头：要是逃脱了前夫的纠缠，又落入了石神的魔掌，自己这一生将永无出头之日。如果石神按照这一思路，把自己塑造成一个自私的杀人狂，他的投案自首，在靖子和美里看来，不啻是彻底的解脱。那时，她们奔向新生活，也就不再有任何良心上的阻碍了。
可是，石神偏偏要写下那最后的告白，一遍一遍地敲击靖子那脆弱的情感和良知，以至于“她从未遇到过这么深的爱情。不，她连这世上有这种深情都一无所知。石神面无表情的背后。竟藏着常人难以理解的爱。”
让石神构思出这个精美骗局的是他的爱，让这个骗局彻底破产的也是他的爱。真是成也萧何，败也萧何。
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