計算機代數系統的優越性主要在於它能夠進行大規模的代數運算。通常我們用筆和紙進行代數運算只能處理符號較少的算式，當算式的符號上升到百位數後，手工計算就很困難了，這時用計算機代數系統進行運算就可以做到準確，快捷，有效。
現在符號計算軟件有一些共同的特點就是在可以進行符號運算、數值計算和圖形顯示等同時，還具有高效的可編程功能。在操作界面上一般都支持交互式處理，人們通過鍵盤輸入命令，計算機處理後即顯示結果。並且人機界面友好，命令輸入方便靈活，很容易尋求幫助。
儘管計算機代數系統在代替人繁瑣的符號運算上有著無比的優越性，但是，計算機畢竟是機器，它只能執行人們給它的指令，有一定的侷限性。首先，多數計算機代數系統對計算機硬件有較高的要求，在進行符號運算時，通常需要很大的內存和較長的計算時間，而精確的代數運算以時間和空間為代價的。
第二個問題是用計算機代數系統進行數值計算，雖然計算精度可以到任意位，但由於計算機代數系統是用軟件本身浮點運算代替硬件算術運算，所以在速度要比用Fortran語言算同樣的問題慢百倍甚至千倍。另外，雖然計算機代數系統包含大量的數學知識，但這僅僅是數學中的一小部分，目前仍有許多數學領域未能被計算機代數系統涉及。計算機代數系統仍在不斷地發展、完善之中。
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