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1 溫度偏低
孵化溫度偏低，將延長種蛋的孵化時間，胚胎髮育遲緩，氣室偏小，胚胎死亡率相應增加，初生雛雞質量下降。解剖死胚主要特徵為全身貧血、胚膜和內殼膜粘連、尿囊充血、心臟肥大、卵黃呈綠色，殘留膠狀蛋白等，與一般條件下相比，溫度偏低會較多和較明顯地見到頭部皮下和頸部肌肉水腫，在許多情況下，有類似血腫的明顯出血，在切開皮膚時，可見皮下有粘液的集聚。小雞表現為：臍帶癒合不好，體弱、站不穩腹部膨大，在蛋殼中常見有殘留未被利用的蛋白和胎糞。
在孵化的任何日齡對胚蛋長久和強烈低溫時，胚胎會進入特殊的假死狀態，最終死亡。低溫時對胚胎髮育的影響與胚齡、持續時間和溫度降低的程度密切相關，胚齡越小影響越大，持續時間越長影響越大。
2 溫度偏高
在尿囊合擾之前的孵化溫度偏高能促進胚胎的生長和發育，但在尿囊合擾之後的高溫會抑制胚胎的生長和發育。當孵化溫度超過42~C，胚胎在2~3小時死亡，如頭兩天孵化溫度過高，在第5~6天出現粘殼胚蛋較多，畸形增多；在第3—5天孵化溫度過高，尿囊“合攏”提前；在長久的過熱條件下，幼雛的啄殼和出殼提前開始，有時可提前到第18天，但出殼不整齊，出雛時間要拖長；若短期強烈溫度偏高，尿囊合擾提前，尿囊血液呈暗黑色，解剖19天后的胚蛋可見皮膚、肝、腦和腎有點狀出血，胚胎的錯位增多，多為頭彎在左翅下或兩腿間。在孵化後期長時間溫度偏高時，將使幼雛收臍未完全已出殼，出雛較早但出雛持續時間延長，破殼後死亡多，解剖可見卵黃囊大而未被吸入腹腔，剩餘尚未被利用的粘稠的蛋白，色淺黃，頭和足位置不正，皮膚、卵黃囊、心臟、腎臟和腸充血，肝多呈暗紅色，充滿血液。
•溫度偏高所孵出的雛雞一般表現為：體型瘦小，許多雛雞臍環擴大，卵黃 囊收縮不完全(釘臍)的比例增大。
3 溼度過高
溼度過高時，胚胎髮育遲緩，胚蛋失重不足(1-18天正常失重率為10．3~13．5％)常見現象有胚蛋氣室小、尿囊合攏遲緩、雛雞精神不振，腹部膨脹、絨毛較長、臍部癒合不良，很多雛禽陸續死亡於出殼後一週之內。悶死在蛋殼裡的幼雛，粘液包裹著幼雛的喙或從啄殼部位溢出，並迅速乾涸，從而使胚胎窒息死亡，或啄和頭部絨毛與蛋殼粘連，使雛禽頭部不能活動。啄殼時洞口粘液多、喙粘在殼上，解剖常見蛋中仍留有羊水、尿囊液和未被利用的蛋白，卵黃呈綠色，胃、腸充滿粘性的液體。
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4 溼度偏低
溼度過低時，胚胎生長髮育稍加快，出殼時間提前，胚胎死亡率與相對溼度偏低的程度呈負相關，相對溼度越低，胚胎死亡率越高。蛋內水分蒸發過快，氣室增大，啄殼部往往在靠近禽蛋的中央處(正常為1／3處)，雛雞表現為：體型瘦小，絨毛較短且乾燥無光澤、發黃、有時粘殼，這些症狀和過熱的結果相似。剖解死胚可見羊水完全消失，絨毛乾燥，卵黃粘滯。此外，由於缺少羊水的潤滑作用，雛禽難於圍繞蛋的縱軸翻轉，小雛難於破殼出來，以使助產增多，在這樣的情況下啄殼會導致尚未萎縮的尿囊血管機械性損傷而出血，常見蛋殼乾燥，有出血的痕跡。
5 通風不良
在孵化過程中，胚胎髮育要不斷進行氣體交換，吸人氧氣和排出二氧化碳氣體。當孵化機內含氧量低於21％時，每降低1％的含氧量，孵化率將降低5％左右。含氧量高於21％，也會降低孵化率。若出現機內二氧化碳含量高於0．5％時(應保持在0．2％左右)，將對孵化率產生影響，高於2％，孵化率急劇下降，超過5％時，孵化率為零。
通風換氣，溫度和溼度三者有密切的關係。通風換氣增大時，對溫度、溼度均為降低；通風換氣不良時，機內外空氣不流通，溼度增高，當環境溫度增高時，易出現超溫，冷卻頻繁，對溫度均勻性有影響。通風換氣與胚胎二者之間也有密切的關係，在孵化過程中，胚胎除了與外界不斷進行氣體交換外，還不斷與外界進行熱能交換。尤其孵化後期，胚胎代謝熱隨胚齡不斷增大，如果熱量散不出去，機內集溫過高，將嚴重影響胚胎正常發育，以至引起胚胎死亡率加大。例如，人孵第19天產生的熱量是第四天的230倍左右。因此，在孵化過程中，一定要做好室內和孵化器的通風換氣。
通風不良主要導致胚胎發生氧飢餓，當胚胎在嚴重氧飢餓條件下呼吸停止C02在體內積聚。低濃度氧氣對胚胎死亡率的影響：作用時的胚齡越大，死亡率越高，作用時間越久，死亡率越高。解剖常見胎位異常增多，足盤在頭頸部上面，啄殼部位多在中腰線或小頭啄殼，羊水中有血液，內臟充血、尿囊血管充滿血液，皮膚和其它器官充血、出血與急性過熱相似。雛雞出殼不集中，雛雞不能站立，蛋殼易粘絨毛。
6 翻蛋不正常和翻蛋不夠
翻蛋不正常和翻蛋不夠的結果：蛋黃粘於殼膜上，合擾時尿囊不能包圍蛋白，到後期影響蛋白的吸收。如翻蛋不夠多表現為：產生更多的缺陷雞如：跛腳、蛋白吸收不良等，早期的死亡增多；如後期翻蛋過多，同時出增加胚蛋的死亡。
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