《遊戲王GX》主角從原作的武藤遊戲更換為遊城十代，一些基礎設定也煥然一新。與《遊戲王－怪獸之決鬥》是同一個世界，前作的登場人物也有數名登場，但是本作與前作劇情上並不銜接，而是創新。標題中GX是“Generation Next（下一代）”的縮寫。整部動畫分為七星篇、破滅之光篇、異次元篇、Darkness篇，全180集。
元素英雄新宇俠【主角卡】
元素英雄 新宇俠是遊戲王卡片中的一張通常怪獸卡，卡名帶有“英雄/HERO”、“元素英雄/E·HERO”、“新宇/ネオス”三個字段。新宇宙俠卡組的核心怪獸，跟不同種的新宇宙俠進行接觸而融合出不同能力的融合怪獸。也能跟其他怪獸（如於貝爾、虹龍）合體成為強力的怪獸。是主角遊城十代的後期卡組主力。被認為是日本特攝劇《奧特曼》系列中的奧特曼。
究極寶玉神虹龍
約翰所使用的寶玉獸卡組的王牌怪獸，也是我最喜歡的卡牌之一。約翰被于貝爾附身後，「究極寶玉神 虹龍」變成了黑暗形態。在原作中能和高等寶玉獸進行配合，收錄後效果變更為與暗屬性主題配合，一般情況下不能被寶玉獸卡組使用，但得到高等暗黑結界的強化後則能使用。因為「寶玉的守護者」和「寶玉的先導者」是收錄於OCG卡包SECE(903)中的10張WP卡之一，使得寶玉獸系列進入靈擺召喚系統。
特殊召喚/效果：這張卡不能通常召喚。自己的場上·墓地有「寶玉獸」卡7種類存在的場合才能特殊召喚。這張卡特殊召喚的回合，這張卡的①②的效果不能發動。
①：把自己場上的表側表示的「寶玉獸」怪獸全部送去墓地才能發動。這張卡的攻擊力上升送去墓地的怪獸數量×1000。這個效果在對方回合也能發動。
②：從自己墓地把「寶玉獸」怪獸全部除外才能發動。場上的卡全部回到持有者卡組。
神炎皇 烏利亞
三幻魔之一，對應三幻神誕生出的神級怪獸卡，但由於其強大的黑暗力量無法駕馭，分別被設置了七條鑰匙將其封印於決鬥學園的七精門內。跟三幻神和三邪神一樣，召喚條件都是使用場上3張表側表示的卡作為代價，但三幻魔並非與前兩者一樣全部使用怪獸卡作為代價。
特殊召喚/效果：這張卡不能通常召喚。把自己場上3張表側表示的陷阱卡送去墓地的場合才能特殊召喚。
①：這張卡的攻擊力上升自己墓地的永續陷阱卡數量×1000。
②：1回合1次，以對方場上蓋放的1張魔法·陷阱卡為對象才能發動。蓋放的那張卡破壞。不能對應這個效果的發動讓魔法·陷阱卡發動。
降雷皇 哈蒙
三幻魔之一，對應三幻神誕生出的神級怪獸卡，但由於其強大的黑暗力量無法駕馭，分別被設置了七條鑰匙將其封印於決鬥學園的七精門內。跟三幻神和三邪神一樣，召喚條件都是使用場上3張表側表示的卡作為代價，但三幻魔並非與前兩者一樣全部使用怪獸卡作為代價。
特殊召喚/效果：這張卡不能通常召喚。把自己場上3張表側表示的永續魔法卡送去墓地的場合才能特殊召喚。
①：只要這張卡在怪獸區域守備表示存在，對方不能選擇其他怪獸作為攻擊對象。
②：這張卡戰鬥破壞對方怪獸送去墓地的場合發動。給與對方1000傷害。
幻魔皇 拉比艾爾
三幻魔之一，對應三幻神誕生出的神級怪獸卡，但由於其強大的黑暗力量無法駕馭，分別被設置了七條鑰匙將其封印於決鬥學園的七精門內。跟三幻神和三邪神一樣，召喚條件都是使用場上3張表側表示的卡作為代價，但三幻魔並非與前兩者一樣全部使用怪獸卡作為代價。
特殊召喚/效果：這張卡不能通常召喚。把自己場上存在的3只惡魔族怪獸作為祭品的場合才能特殊召喚。每次對方召喚怪獸，在自己場上特殊召喚1只「幻魔衍生物」（惡魔族·暗·1星·攻/守1000）。這些衍生物(TOKEN)不能進行攻擊宣言。1回合1次，可以把自己場上的1只怪獸作為祭品，這個回合的結束流程前這張卡的攻擊力上升祭品怪獸的原本攻擊力的數值。
暗黑之召喚神
“三幻魔”的輔助卡，極其變態.....三幻神都沒有這麼強的輔助
效果：可以將這張卡做祭品，從自己墓地無視召喚條件特殊召喚「神炎皇 烏利亞」「降雷皇 哈蒙」「幻魔皇 拉比艾爾」。使用了這個效果的回合，自己不能攻擊宣言。
混沌幻魔 阿米泰爾
由三幻魔融合召喚而來，真的是毫無顏值可言....
融合/效果：「神炎皇 烏利亞」+「降雷皇 哈蒙」+「幻魔皇 拉比艾爾」
把自己場上的上記卡除外的場合才能從額外卡組特殊召喚（不需要「融合」）。
①：這張卡的攻擊力在自己回合的期間上升10000。
②：這張卡不會被戰鬥破壞。
尤貝爾 尤貝爾-被憎惡的騎士 尤貝爾-極度悲傷的魔龍
尤貝爾（NW翻譯為「于貝爾」），前世原本是為了保護遊城十代而主動接受改造的人類，後來幻化為決鬥精靈偽裝成卡片暗中保護十代。但年幼的十代察覺到尤貝爾的存在並因為其保護自己而詛咒別人的力量所以藉助特殊的機會將其送入了太空，卻使其受到了宇宙中邪惡的光之波動影響，變成了邪惡的決鬥精靈。 後來與十代融合為一體，成為十代的背後靈。與十代融合後的尤貝爾個性與之前已截然不同，能感受十代的真實感受和情緒，充當著十代背後的支持者並給予他力量，從心裡相信十代會戰勝黑暗。
尤貝爾效果：
- 這張卡不會被戰鬥破壞
- 對方的怪獸攻擊這張卡的話，攻擊會反彈回去
- 回合結束需要把1只自己的怪獸解放，否則他會破壞
- 這張卡被不是這張卡的效果破壞的場合，可以從手牌墓地卡組特殊召喚「尤貝爾-被憎惡的騎士」
尤貝爾-被憎惡的騎士效果：
- 這張卡不能通常召喚。「尤貝爾」的效果才能特殊召喚
- 這張卡不會被戰鬥破壞，這張卡的戰鬥發生的對自己的戰鬥傷害變成0
- 場上表側攻擊表示存在的這張卡被對方怪獸攻擊的場合，那次傷害計算前給與對方基本分攻擊怪獸的攻擊力數值的傷害
- 自己的結束階段時，這張卡以外的場上的怪獸全部破壞
- 這張卡從場上離開時，可以從自己的手卡·卡組·墓地把1只「于貝爾-極度悲傷的魔龍」特殊召喚
尤貝爾-極度悲傷的魔龍效果：
- 這張卡不能通常召喚。「尤貝爾-被憎惡的騎士」的效果才能特殊召喚
- 這張卡不會被戰鬥破壞
- 這張卡的戰鬥發生的對自己的戰鬥傷害變成0
- 場上表側攻擊表示存在的這張卡和對方怪獸進行戰鬥的傷害步驟結束時，給與對方基本分對方怪獸的攻擊力數值的傷害，那隻怪獸破壞。
虹光新宇俠
虹光新宇俠是「元素英雄新宇俠」和「究極寶玉神虹龍」或「究極寶玉神虹暗龍」的融合體，擁有把對方場上的怪獸、魔陷或墓地的卡片返回卡組的強大效果。各種讓對面的卡回家的效果，求對面心理陰影面積...
效果·融合：「元素英雄新宇俠」+名字帶有「究極寶玉神」的怪獸。這張卡用以上記的卡為融合素材的融合召喚才能特殊召喚。1回合1次，可以從以下效果選擇1個發動。
- 通過把自己場上1只怪獸送去墓地，對方場上的怪獸全部回到卡組。
- 通過把自己場上1張魔法·陷阱卡送去墓地，對方場上的魔法·陷阱卡全部回到卡組。
- 通過從自己卡組上面把1張卡送去墓地，對方墓地的卡全部回到卡組。
元素英雄神·新宇俠
這張卡是遊城十代用「元素英雄新宇俠」和6只「新宇宙俠」進行接觸融合而來的最終王牌怪獸。
動畫中的效果：把自己場上的1只「元素英雄 新宇俠」和自己的場上·墓地的6只卡名不同的名字帶有「新宇宙俠」的怪獸回到卡組才能從融合卡組特殊召喚（不需要「融合」魔法卡）。選擇自己的卡組的1只名字帶有「新宇宙俠」的怪獸從遊戲中除外，這個回合中得到除外的卡的怪獸效果。這個效果每把1張卡從遊戲中除外，這張卡的攻擊力上升500。
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