辛亥革命後，在安徽原本有一所高等學堂，名江淮大學，但自從北洋軍閥倪嗣沖當上安徽督軍後，仇恨該校有傾向革命黨之嫌，遂下令停辦。此後，安徽省境內再無一所大學。所以到了1927年，北伐勝利後，政府當局就急於籌建安徽大學。校舍、經費及教職員工都還好辦，唯獨校長人選成為一時之難題。經過多方磋商，最後由於右任舉薦劉叔雅，獲得當局通過。
於先生為何要舉薦劉叔雅呢？原來劉叔雅早年加入反清秘密團體嶽王會(會長陳獨秀)，繼而加入同盟會。辛亥革命成功後，他從日本回國到上海，經皖人範鴻仙的介紹，進入由於右任當社長的《民主報》館，做翻譯工作兼寫政論文章，頗得於的賞識。“二次革命”爆發後，範鴻仙棄文從軍，返歸淮上組建“鐵血軍”，自任總司令；劉叔雅毫無畏懼，隨範同往前線，任範的秘書。革命失敗後，他又隨範亡命日本，毅然加入中華革命黨，在中山先生身旁做文書工作。所以於先生對劉叔雅是很瞭解的，認為這樣的人才應該重用。
劉叔雅雖然名份上當了校長，但仍把學術研究作為自己的主業，勤奮鑽研，以至與友人漸疏，對與官場應酬更是索然寡味。1928年11月26日早晨，劉叔雅忽接省政府通知，說蔣介石總司令南巡路過安慶，要到安徽大學來看看，請做好迎接準備。他本是以“不事王候，高高其志”的態度，謝絕各方面的交際應酬，是出了名的。所以當他接到通知後，不以為然，悄悄地安排了一位庶務員去辦理此事。
大約在十點多鐘，蔣介石在安徽省政務廳長等一群官員的簇擁下，漫步走進校園。但見四處靜悄悄，並無一點歡迎的氣氛。蔣介石那時正是大紅大紫的時候，遇到這種冷淡的場面，確實也是一種很難堪的事，但他還是壓住火，在校園內匆匆轉了一圈，登車而去。
然而就在這一天的夜晚，發生了安徽大學部分學生與隔壁女子師範學校職工打鬥的事，後來雙方人員越聚越多，秩序大亂，影響了兩校的開課。此事很快傳到蔣介石耳中，他立召省府、省黨部委員，兩校校長及學生代表開會。這種指名道姓的會議，劉叔雅自然是無詞推卸，只好按時出席。這一天，他穿著一件破舊的灰鼠皮襖，叼著一支香菸，昂首步入會議廳，對在座的官員毫不理會。
蔣介石當時盛怒之下，大罵安大學生代表們，罵了又坐下，稍停一下，站起來又開罵，訓了學生一頓之後，轉過來便責備兩校的校長。女師校長程勉旃，是安微教育界老軍程筱蘇的兒子，他坐在那裡恭聽責備，一言不發。蔣又轉向安大校長劉叔雅大加責難，說他對學生管教無方。劉叔雅和蔣對話間發生衝突，在座的都為之色變。
蔣介石指著劉怒斥：“看你這個樣子，簡直象個土豪劣紳！”劉也大聲反罵：“看你這個樣子，簡直就是一個新軍閥！”蔣介石立時火氣沖天，大聲地喊叫：“看我能不能槍斃你！”此時劉站起來一頓腳：“你就不敢！憑什麼？”蔣大吼：“來人，把他扣押起來！”立即衝進來兩個衛兵，把劉拖下。
劉叔雅被拘押後，安徽大學的學生集會遊行，對此，蔣介石採取了鎮壓行動，逮捕了一批學生。隨後宣佈安大校長一職暫由程天放兼任。當他離開安慶之前，留下手示：將劉叔雅交張亞威看管，聽候發落。張亞威=與劉叔雅有私交，他把劉軟禁在省府內，實則待如賓客。過了一陣子，安徽省府接到南京政府釋放劉叔雅的函示，據說，是于右任、蔡元培出面為之說情。
劉叔雅出來後，又去了北平，由羅家份推薦，到清華大學擔任國文系主任。盧溝橋事變後不久，北平淪陷，劉叔雅攜家眷逃離虎口，取道香港，輾轉抵達昆明，在西南聯大任教。抗戰勝利後，他留戀昆明生活，不願再回北，為雲南大學聘去，1958年7月15日在昆明病逝，享年69歲。
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