海軍抓住了海賊王的兒子艾斯，以白鬍子（艾斯的乾爹）為首的海賊團，為了營救自己的乾兒子艾斯向世界政府發動戰爭。頂上戰爭正式打響。而這次戰爭出現了許多實力強勁的人物，主要分三個方面：世界政府、海軍、王下七武海；以白鬍子、路飛、羅為首的海賊；以龍、伊萬科夫為首的革命軍。
海軍三大將：黃猿、赤犬、青雉
路飛、小丑巴基、克洛克達爾等人在七武海甚平、女帝的幫助之下從海軍監獄裡逃了出來，開始所有海軍包括監獄獄長麥哲倫都不相信正義之門會為這些逃犯打開，由於Mr2變身成為獄長的樣子向監獄推進城下達了開門的命令，才有了路飛等人成功脫離海軍的追捕前往海軍總部去解救艾斯。
白鬍子愛德華·紐蓋特率領47支海賊團隊伍入侵海軍總部，船隻全部是經海賊王哥爾D羅傑的副船長雷利鍍的膜，從海底深處潛到海軍底部直接上浮到海軍基地。海軍打算對艾斯提早行刑，此時路飛與推進城內241名犯人即時趕到，並與白鬍子聯手拯救艾斯。路飛在一眾逃獄者、白鬍子海賊團及“海賊女帝”波雅·漢庫克等人的掩護下企圖營救哥哥艾斯，卻仍屢次受到海軍及王下七武海猛烈的攻擊和阻撓。漢庫克將艾斯手銬的鑰匙交給路飛，路飛朝著艾斯奔去，而鷹眼拿著黑刀擋在了路飛的面前，並不斷斬擊路飛。
白鬍子站在海軍總部前的圖片
世界船長史庫亞德突然襲擊白鬍子，一刀貫穿了他的身體，原因是他誤會了白鬍子，而且之前白鬍子沒有告訴他艾斯的身世。白鬍子海賊團第一隊隊長馬爾科欲飛上行刑臺救下艾斯，被路飛的爺爺蒙奇·D·卡普一拳揍下。白鬍子傷勢越來越重，又被赤犬盯上，血流不止。馬爾科手上被海軍中將鬼蜘蛛拷上海樓石手銬 路飛使用霸王色霸氣的瞬間，海軍本部大將黃猿乘機以激光貫穿馬爾科的身體。喬茲身體被青雉完全冰凍，右臂也受到重傷。
白鬍子海賊團第一隊隊長不死鳥馬爾科
革命軍這邊，以伊娃科夫、閃電等人為代表開始和七武海以及海軍展開戰鬥，伊萬科夫藉助自己超級荷爾蒙的能力幫助馬爾科恢復體力，這才使得他又重新展現出霸王色霸氣，將中將卡普（路飛的爺爺）以及海軍元帥戰國擊退，在Mr3的協助下成功解救了艾斯。
路飛與伊萬科夫
白鬍子本身年事已高外加身體狀況不好，現在受傷之後更是體力不支，白鬍子決定用盡自己最後的力量，掩護所有旗下海賊撤退。獨自一人在一個只剩半邊的島對海軍眾人，白鬍子海賊團正要逃亡之際，海軍本部大將赤犬出現並出言挑釁艾斯。艾斯憤而攻擊赤犬，卻反被赤犬的岩漿給燒傷。最後赤犬一拳襲向路飛，艾斯挺身替路飛擋住攻擊慘遭赤犬貫穿身體。艾斯靠在路飛身上，白鬍子旗下的船醫前去搶救艾斯，但艾斯拒絕了治療，因為他知道再怎麼治療也是無濟於事了，並出口感謝路飛和前來營救他的所有人，隨後在路飛懷裡含笑而逝。
艾斯替路飛擋住了赤犬的攻擊
鐵拳卡普讓戰國拉著自己，因為他怕自己控制不住將赤犬打死。此時白鬍子也特別憤怒，他眼睜睜德看著自己的乾兒子被赤犬貫穿身體卻無能為力，見到黑鬍子後，毫不留情的向他攻擊，但最後在黑鬍子海賊團的全體攻擊下，白鬍子以站著的姿態死亡，黑鬍子趁勢向前利用果實能力奪取白鬍子的震震果實能力，而成為能夠使用兩種果實能力的能力者，同時黑鬍子向世人宣佈他將取代白鬍子成為這個世界的霸主。
卡普與艾斯
這時，海水裡冒出一艘潛水艇，特羅法爾加·羅出現並要巴基將精神受到重創的路飛交給他，說他是個醫生。
羅
海軍元帥佛之戰國親自和黑鬍子交戰，而後在四皇‘紅髮’香克斯出現，在其調解下，戰國元帥決定收兵，這場自大海賊時代開始以來最大的戰役就此閉幕。
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