大量雨水會造成水體缺乏光合作用，池中溶氧量降低，氨氮、硫化氫超高，水體硬度低、鈣不足、PH值降低及水體惡化引起病害發生等不良影響，所以，養殖戶要切實做好雨後水產養殖的管理和病害防治措施。
一是清除池塘裡的淤泥，恢復養魚能力；過水的養魚設施如增氧機等應拆卸、烘乾、沖洗並進行檢修和維護。
二是加強池塘清池消毒，防止雨後魚病暴發，病情感染。
三是及時使用微生物等製劑改良池塘底質和水質，如有條件的將渾水及時抽出，換注新水；不能注入新水的，用淨水劑，培肥水質等。
四是及時補放魚種，如儘量補收外逃魚，選擇鱗鰭完整、跳躍有力、遊動活潑的健康魚類重新放養；就近採購、調運大規格魚種進行放養，放養密度可適當稀放，入池前用2％-3％的食鹽水或1-2克/立方米的晶體敵百蟲浸泡3-5分鐘，以防病菌的傳播等。
五是加強中後期管理，如投足飼料、施足肥料，以及注意調節水質等。
六是及時對魚苗池、魚花池每畝全池潑灑2公斤左右葡萄糖和200克維生素C，對防止魚苗的應激反應有良好作用。
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