變壓器差動保護在正常運行和外部短路時，理想情況下流入差動繼電器的電流為零，保護裝置不動作。但實際上變壓器差動保護與發電機差動保護相比，在正常運行和外部短路時的工作行為有很大的不同。因為變壓器差動繼電器在保護區外短路時，受到一些可能引起誤動作因素的影響，而這些影響因素在發電機差動保護中一般不會出現，具體表現有以下幾個特點：
(1) 變壓器差動保護所用的各側電流互感器的電壓等級不同，變比、容量以及鐵芯飽和特性不一致。即使採用平衡線圈或自耦變流器的方法進行補償，各側電流互感器之間的變比仍可能不匹配。在正常運行和外部短路時，差動迴路中流過的不平衡電流仍可能比較大。
(2)變壓器調節分接頭改變了變壓器的變比，使已選定的電流互感器之間不匹配，也使不平衡電流增大。
(3)由於變壓器繞組Y∕△連接，使各側電流相位不一致，因此，電流互感器的接線組別應與其相適應。但電流互感器變比的選擇，由於受到標準變比的選擇，仍可能不匹配併產生不平衡電流。
(4) 變壓器在空載合閘或切除外部故障時的電壓恢復過程中產生勵磁湧流。
由於這些特殊因素的影響，使得變壓器差動保護的不平衡電流遠比發電機差動保護的大。不平衡電流或勵磁湧流如同在內部故障時一樣，全部流入差動迴路，可能會使差動保護誤動作。為了保證差動保護的選擇性，繼電器的動作電流必須避越外部故障時的最大不平衡電流。因此，不平衡電流越大，繼電器整定的動作電流也越大，將使內部故障時保護的靈敏度降低。為了提高差動保護的靈敏度，就必須設法減小不平衡電流。所以，減小不平衡電流及其影響，是實現差動保護的關鍵問題。
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