納蘭談史
首先，這個提問本身就有問題，什麼叫南京在安徽腹地？
事實上安徽是安徽，江蘇是江蘇，你不能因為南京市與安徽省相毗鄰就就把江蘇省會劃分到別人家裡去，這是不科學的。因此，我猜你應該想問的是為什麼江蘇省會南京離安徽那麼近吧？
如果這麼問是有歷史原因的，要知道在古代，我國地方的行政劃分遠沒有現在那麼細，比如在元朝，湖南湖北就是以湖廣行省的身份出現的，直到清朝才出現了拆分，同理安徽江蘇也一樣，在明朝的時候，安徽、江蘇、上海以及其他一些地方是以江南省的身份出現的，明成祖把國都遷往北京，這裡也稱為南直隸，於是明朝就出現了兩個國都，一個是順天府北京，一個應天府南京。
通過以上，我們就不難發現，當時的南京不存在位於安徽腹地一說，因為本身就是一個整體。出現改變是到了清朝初期，由於明朝剛滅，江南省作為中國最繁華的地方，力量很強。為了削弱實力就把江南省作出了拆分，才有了現在安徽省和江蘇省的大致輪廓，並演變到了現在版圖。
美家手記
眾所周知，古代安徽與江蘇在明朝是同一省，稱作南直隸，也是明朝最繁榮富庶最發達的地區。直到清朝初期仍舊連在一起，稱作江南省。南京素有“徽京”之稱，一來是因為歷史淵源，二來因為地理原因；第三也是因為南京對安徽的影響力非常大。
歷史淵源，影響深遠
明太祖朱元璋建立明帝國之後，將鳳陽府等組合成“直隸”，後來明成祖遷都北京，這裡稱作南直隸，也就是如今的江蘇、安徽與上海兩省一市。當時的南京不僅是南直隸的中心，更加是整個明帝國的都城。
直到清朝初期，江南省仍舊是整個帝國版圖內最富有繁榮的地方。由於明滅未久，江南省富有強大，而且人文底蘊深厚，一個強大的江南省讓滿清非常害怕。最終，康熙帝玄燁將江南省縱向劃開，東部取江寧府、蘇州府首字組建江蘇省，西部取安慶府、徽州府首字組建安徽省。
1955年，為了方便洪澤湖的管理，安徽與江蘇兩個省互相交換了轄區，安徽讓出了盱眙、泗洪兩個縣，而江湖將北方的蕭縣、碭山讓給了安徽。這麼一來，南京在地圖上，感覺就相當深入安徽了。
南京被稱作“徽京”不無道理
安徽與江蘇經濟發展差距很大，而安徽內部的南北差距也非常巨大，相對於合肥，安徽人尤其皖南六市更加親近南京。
的確如此，當年安徽江蘇分家之後，江蘇巡撫的駐地其實位於蘇州而並非江寧（南京），反而將近一百年的時間內，安徽布政使司都長期駐在江寧，安徽首府安慶府長期有名無實，安徽境內的才子參加科舉也都是前往江寧。
澹奕
對於江蘇省會南京緊貼安徽省境的原因，地理知識與旅行資訊專家——地理答啦，簡要進行解答。
這個問題還得從明朝說起，朱元璋建立明朝以後，定都南京，將“京師”南京周圍以及他的老家鳳陽等地區設為“直隸”，直屬中央管理，下轄應天府、蘇州府、松江府、鳳陽府、安慶府、徽州府、廬州府、池州府、太平府、寧國府、揚州府、鎮江府、常州府、淮安府、徐州、滁州、和州、廣德州等府州，其範圍大概包括今天的安徽、江蘇兩省及上海市。此時的“京師”南京，位置處於“直隸”中部偏南。
後來明朝遷都北平作為“京師”，將於原北平布政使所轄地區也歸中央管理，稱為“北直隸”，以區別於原來的“直隸”，範圍大概相當於今天的北京市、天津市、河北省範圍。原來的“京師”改稱南京，原直隸稱南直隸，以區別於北京周圍的北直隸。
清朝入關以後，將南直隸改為“江南省”。江南省的範圍大致相當於今天的江蘇省、安徽省、和上海市。江南省是當時中國最發達的省份，經濟、人口、賦稅等體量巨大，清政府為了加強對這一地區的管理，於是將江南省一分為二，劃分為兩個省進行管理。
由於江南省總體上是長江以南地區發達，長江以北的江淮地區相對落後，為了使兩個省的體量相當，在劃分的時候採取了“縱切”的劃分方式，這樣東西兩個新的省份均管轄長江以南和江淮地區的一部分。西邊的省份分得了安慶、徽州、廬州、鳳陽府、池州等地，取安慶和徽州的首字做省名，即安徽省。東邊的省份分得了江寧、蘇州、松江、揚州、鎮江、常州、淮安、徐州等地，取江寧和蘇州的首字做省名，即江蘇省。
安徽、江蘇分省之後，原來處於江南省中南部的南京，就處在了安徽和江蘇交界的位置，因為兩省省界犬牙交錯，後來省界略有微調，最終形成了如今南京市被安徽省三面環繞的格局。
以上！
地理答啦
主要是因為江蘇安徽之前本為一省——江南省的原因。
清初考慮到江南省勢大，恐生意外。順治年間為方便統治，將江南省拆分為安徽和江蘇。取安慶府徽州府首字為安徽，取江寧府蘇州府首字為蘇州。安徽首府為安慶，江蘇首府為南京，江蘇首府在南京蘇州之間反覆易轍（鎮江也去坐了會凳子）。
乾隆年間，江蘇又分為江蘇布政使和江寧布政使
一省轄兩布政使，全國唯江蘇一例。
這也造成了南京和蘇州的割裂。直到今天，南京、馬鞍山等城市組成的南京經濟圈與蘇錫常經濟圈仍相對應。南京的經濟輻射主要向西，深入安徽。這也就是為什麼戲稱南京為徽京的原因了。
山水客
南京位於江蘇西南部，距安徽省非常近，南京的浦口區距蘇皖兩省的邊界直線距離不超過25Km。南京經濟發達，服務範圍廣，近水樓臺先得月，使安徽受益匪淺!
海闊天空218505852
明明很簡單的問題，為什麼都要去充字數。
就是歷史原因，清朝安徽和江蘇都屬於江南省，後來被拆分為安徽和江蘇兩省。
而南京自拆分後和蘇州一起都做過江蘇的省會，安徽省會則為安慶。
就是由於當時拆分時兩省的區劃分界，導致南京偏向安徽一側，並無其它原因。而先人拆分劃界時的主觀原因和隨機性，後人也不會知道。不知那些長篇大論在分析什麼，還有什麼別的原因嗎。
歷史遺留問題，作為後人在那如此主觀地分析，可以說是意淫了。那我問你為什麼清朝安徽省會安慶，卻靠近江西和湖北，又該如何解釋？本來就是歷史區劃遺留問題。
說句題外話，寫問答不要那麼功利，現在很多回答都是百度複製粘貼，為了充字數。明明簡單的道理，最後越扯越離譜。
堅果旅行
廢話真多！明清以來南京的地位都是國都，應天府，南直隸，江南省首府，兩江總督府，首都，特別市，幾百年來一直是，因此南京的眼光從來都以這個框架，從不侷限於某一小塊區域。如果你不是鼠目寸光，小肚雞腸，用明清以來的區域來看南京，就會發現南京的位置不左不右正在中心！南京的東南第一府的位置存在好幾百年了，作為江蘇省會才65年，已是數百年來地位最低的時段，以後會怎樣？只會升級不會降級。
畫影352
江蘇省會南京的地理位置為什麼會在安徽腹地？專研華東城市發展的白頁說來回答。
簡單提要：明清時候，江蘇、安徽和上海統統屬於江南省，而行政中心就是南京。後來清朝覺得江南省實力太大，於是沿著南京劃了一條三八線。南京以西的分為安徽，南京以東分為江蘇。南京自古以來就是安徽的省會
安徽獨立成省不過是近三多百年曆史事件，在漫長的歷史中安徽和江蘇合併管理，直到康熙年間才因為張廷玉的建議才從江南省從形式上分離出來。之所以說形式上是因為彼時安徽部分行政權在分家以後竟被南京託管長達百年，直到1760年所有的省會職能才齊聚安慶。
明代以前，安徽部分地區（尤以長江以南居多）就已經經常和江蘇部分抱團形成“省級”行政區，而從那時起省會城市就是南京（在南京不當首都的時候）。
有明一代，真正開啟安徽全境集體歸南京管轄的歷史。
按照明清時代的行政地圖，南京恰好在差不多中心位置，管理現在兩省一市面積大小的地方几乎沒毛病。
明朝，朱元璋在打下江山後，立刻做了自古帝王鍾愛的一件事：統一。在調整行政區劃的過程中，江南行省正式建立，大致就是今天的安徽、上海和江蘇共屬於一個大片區了。
大家都應該知道朱元璋是安徽鳳陽人。天子誕生地鳳陽其實距離南京不過180公里，至於後人常發天問為何朱元璋不好好發展龍興之地的問題：其實，看到明朝把安徽、江蘇打包交給曾經的首都南京管理，是不是有點好好照料我老家人的意味。（正是這一心思才正式開啟了南京與安徽的近700年糾葛）
知道你江蘇幹得不錯，朕把龍興之地的安徽也一併交給你南京管理，好好帶一把。所以就有網友調侃發展安徽自明以來就是南京神聖的歷史責任。
洪武元年，江南行省被撤，南京正式建立，也就是後來的南直隸。
清朝建立之初，地方管理基本沿用明朝的行政劃分體系，南直隸改名為江南省：在傳統觀念上的江南，在古代就是江蘇、安徽所組成的核心區域。
所以安徽、江蘇以及上海，繼續被劃在一個行政區域內，統稱為江南省，是當時最富裕的地區，而且後面沒有之一！要知道清初時近江南一省就貢獻了全國三分之一的賦稅，而每期科考上榜人少幾乎佔一半，故民間流傳“天下英才，半數盡出江南”。但正因為實在太富裕實力太強，也為未來的分家埋下了隱患。
到了清朝，南京成了故都，順治皇帝眼看著故都統領著這麼大塊的地盤，地處長江天塹，佔了全國十分之三的田賦，可以說想不謀反都難。清廷便有了削弱江南省的意圖，實施的第一招就是分而治之。
江南省行政區域的劃分在順治年間還屬於霧裡看花的狀態。公元1661年 （清順治十八年），順治皇帝直接把江南布政使劈成了左右布政使兩個人。在清朝，省級主要官員有四個：巡撫、按察使、布政使、學政。大致相當於今天的省長、政法委書記、兩個副省長（分管經濟和教育）。
官員一分為二了，土地自然也是一樣。左布政使在江寧，也就是現在的南京坐鎮，手下管今天的蘇北和安徽省大部分區域。右布政使司在蘇州，管著現在的蘇南地區。換句話說，直到清朝順治年間，安徽的省會毫無疑問一直是南京。
而安徽真正建省，已經是康熙時期的事了。因鳳陽巡撫被撤，原屬於鳳陽巡撫管轄的廬州（合肥）、鳳陽、滁州、和州被打包給了安徽巡撫，淮安和鹽城則加入了江寧巡撫。安徽巡撫和江寧巡撫的格局也就基本成了後來的安徽省和江蘇省。
但即便安徽設省之後，前兩位的府衙都遷到了當時安徽公認的中心安慶，但布政使司還是留在了江蘇省的省府江寧（南京），學政則由江蘇省代管。
儘管清代的布政使作用已經比明代減弱很多，但仍然是掌管一方稅賦的大員。學政更是掌管教育和科舉的重要官員。用現在的話來說，就相當於安徽的省長和政法委書記已經到位，但常務副省長卻常駐南京，主管教育和人事的副省長更是江蘇副省長兼任。
分省之後遺禍300年
安徽網友直呼被坑了300年，也正是源於這樣簡簡單單稀裡糊塗的分家。安徽簡直就像淨身出戶一般，另搭爐灶過日子，沒火沒炭還得南京幫忙過度。誰讓家當都留在南京了呢。如果說前面是愛和情，後面大概只有糾葛不清啦。
在清政府在對江南進行分割時，完全是出於政治考慮，只是簡單的一個劃分，壓根就沒有考慮過分家之後安徽怎麼發展。再加上當時都是出自一個省份，大家起初也沒有注意到，都以為只是簡單的一個地域劃分，但真正的後果卻並沒有想的那麼簡單。
下圖就可以看出當時分家是多麼地變來變去。
白頁說
所謂的“徽京”豈是浪得虛名，板子要打到滿清入關。在這之前，江蘇安徽實為一地，是明朝朱元璋的龍興之地。尤其是皖南地區與吳語區山水相連，人文相通，可惜滿清入關之後，江南百姓反抗最為激烈，為了便於分而治之，劃為二省至今。南京作為古都，若不為省會，其它城市也難以取而代之的，也只能如此這般存在著吧。
夜風拂面
按照和提問者一樣的智商人認為，作為江蘇省，應該把南京挪個地方，放在省的中心位置。作為國家，應該把新疆沙漠地區移到太平洋中間，這樣沒有沙漠了。
看題目就知道，提問者並不知道他爸爸為什麼和他的媽媽會生下他，不應該啊！！
