近日，國務院辦公廳印發《港澳臺居民居住證申領發放辦法》，自9月1日起施行。符合條件的港澳臺居民可自願申領居住證，憑證在內地（大陸）享有住房公積金繳存提取等多項權利和基本公共服務，以及乘坐公共交通工具、申領駕照等便利。
對於這一便利化舉措，臺灣民進黨盯上了申請者需要登載指紋信息，竟稱此舉為管控人身自由，甚至揚言民主”國家“的人民不太會接受此類居留的要求。此話遭到國民黨反駁，稱採用生物辨別技術的身份證是國際趨勢。事實上，臺灣地區的快速通關也採用指紋辨識技術。
19日，臺灣“聯合新聞網”報道，民進黨”立委“林靜儀聲稱，這代表大陸對人身自由管控越來越離譜，顯示出大陸掌握臺灣民眾愈多，被控制的程度也越高，“對於民主國家的人民來說，不太會接受此類居留的要求”。
林靜儀說，臺灣民眾要去大陸停留居住，要有警覺何以要被如此程度的控制，從臺胞證進入大陸要走中國人通道措施開始，就顯示大陸一直是用把臺灣看作是其一部分來看待，臺灣民眾是否感到反感、被吃豆腐，應該都會有自覺，但因這是大陸政策，他們也不方便去講什麼。
民進黨“立法院黨團書記長”鄭運鵬則說，大陸可以試試看提供相同服務給其他國家的來華人士，相信不只是會被他國拒絕，還會被抗議。“臺灣的悲哀，在於還有人和媒體會吹捧這些措施，這在國際社會上都是不可思議的事情。”
對於民進黨的說辭，國民黨”立委“曾銘宗反駁稱，在國際180多個國家中，只剩20多國仍採用傳統身份證，而生物辨識技術如指紋、聲紋、瞳孔、臉部辨識等，有英國等多個國家在推動發展，這也是國際趨勢。然而，臺灣地區目前連對身份證是否採用芯片都有不同意見，更談不上指紋等信息。
曾銘宗表示，其實美國的海關或臺灣地區的快速通關，也都有采用指紋辨識等類技術，這個世界趨勢配合大數據，有利於防恐。大陸申請居住證若有給予民眾相對等的權利義務，對臺灣民眾也較有保障，更是大陸拉攏臺灣居民重要手段，是否接受，就要民眾自己去衡量對其是否有利。
臺灣《中國時報》大陸兩岸組主任記者藍孝威因工作原因常年穿梭在臺灣和大陸之間，他對《環球時報》記者表示，在當今網絡化年代，個體信息無時不被“登錄在案”，辦理居住證時採集指紋，和臺胞個人信息被大陸掌握受到威脅無直接關聯。
藍孝威認為，這項政策的推行對於在陸工作生活的臺灣人是有利的——比如，臺灣人在大陸求職應聘時需開具一些證明，有了居住證可以減免不少麻煩。
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