公元200年，也就是建安五年，這一年東漢發生了翻天覆地的改變。正月，衣帶詔事發，董承等身死，劉備投奔袁紹；二月，曹袁之戰開始；三月，關羽解白馬之圍；四月，孫策遇襲身死，孫權繼位；七月，劉備投奔劉表；六月-十月，官渡之戰曹操大破袁紹軍。所以這一年也是三國的開端，也在這一年，諸葛亮兄長因中原大亂而避亂江東，遇見了孫權姐夫弘諮，弘諮識才，向孫權推薦，遂為東吳貴賓。
諸葛瑾做事圓滑，因為是諸葛亮兄長，在東吳很小心，和諸葛亮劃清界限，不過因為諸葛亮沒有兒子，把兒子諸葛喬過繼給了諸葛亮，不過他到死也沒有想到諸葛喬這一脈是他僅存唯一的血脈。公元219年，跟隨呂蒙討伐關羽，白衣過江，功成被封宣城侯，領南郡太守。公元221年劉備伐吳，因諸葛瑾在南郡，遂謠言四起，稱他與諸葛亮方通私信。陸遜力保諸葛瑾，卻不想孫權心胸更開闊，自稱與諸葛瑾是神交，不可能背叛自己，於是成語“生死不易”流傳後世。有如此的君，有如此的友，諸葛瑾想必很欣慰。
公元229年，孫權稱帝，封諸葛瑾為大將軍。此後為東吳盡心盡力，老百姓都佩服他的高雅氣質，孫權甚是看中，又在東吳效力十餘載，在公元241年去世，享年68歲。
不過他的兒子就不這麼低調了，少時就以神通著稱，平步升雲，在丞相陸遜病逝後，被升為大將軍。公元252年孫權病危時在孫峻的力薦下諸葛恪被任命為託孤大臣之首，開始掌握吳國軍政大權，並因功加封丞相，便開始了專權的日子，於是他就要倒黴了，公元253年十月，同為託孤大臣的孫峻暗中聯合吳主孫亮，在宴會上將諸葛恪殺害，並滅其三族，就連諸葛瑾都有預言，諸葛瑾說自己兒子："恪不大興吾家，將大赤吾族也。
因此諸葛瑾無後了，不過前文說了，諸葛瑾向諸葛亮過繼了一個兒子，叫諸葛喬，諸葛喬死的早，不過有一個兒子。在東吳孫休繼位以後，除掉了孫峻，為諸葛恪平反。由於蜀漢和東吳同盟，諸葛喬的兒子諸葛攀就回到了東吳，繼承了諸葛瑾以前的爵位。
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