自波斯戰爭以後，希臘形成了雅典和斯巴達對立的局面。公元前431年，雅典與斯巴達之間發生了長達二十七年的伯羅奔尼撒戰爭。在此期間，雅典為了對抗斯巴達，曾實施堅壁清野政策。不幸，公元前430年，雅典發生了瘟症，僅兩年工夫，雅典人口便被病魔奪去了三分之一，將軍伯里克利也被這次瘟疫奪去了生命。
自此以後，雅典便陷入黨派之爭，產生了一些煽動政治家，有的借鼓吹戰爭取得大權，有的靠呼籲和平掌握政權，雅典政治極為混亂。此外，雅典時常向提洛同盟國課徵賦稅，使得提洛同盟國逐漸叛離了雅典，雅典的勢力日漸下降。
公元前415年，雅典市民在亞西比德（Alcibiades）的煽動下，居然答應出兵遠征西西里。載著六千步兵的艦隊要出發時，發生了一件奇異的事，一夜之間，雅典街道上赫爾墨斯神像的頭部都不見了。市民們懷疑是亞西比德所為，因此，遠征軍到達西西里後不久，亞西比德就被召還，要被處以死刑。他逃亡到斯巴達，勸斯巴達出兵援助西西里的敘拉古。斯巴達聽從他的建議，出兵援助敘拉古。公元前413年，雅典遠征軍全軍覆沒。
這次戰爭失敗後，雅典政治由民主政治逐漸走向寡頭政治，亞西比德再度掌握雅典政權。這時，波斯也有意恢復在伊奧尼亞的統治權，意圖利用斯巴達來打擊雅典。公元前408年，斯巴達在波斯的經濟援助下，成立了一支大艦隊。斯巴達與雅典的艦隊首先在伊奧尼亞發生海戰，亞西比德率領的雅典海軍吃了大敗仗。
公元前405年秋天，雅典從黑海沿岸輸入穀類的糧道被斯巴達海軍切斷，雅典城被包圍。雅典終於在公元前404年向斯巴達無條件投降。戰後，雅典在斯巴達的武力干涉下，於公元前404年成立了三十人的寡頭政治。公元前403年，雅典雖然又恢復民主政治，但此後已無法再現伯里克利時代的光榮。伊奧尼亞也落入波斯的統治之中，希臘已無法恢復對這個地方的主權。
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