～初～
我是薩沙，我來回答。
很簡單，當時只有劉建明知道陳永仁的真實身份，也就是陳永仁唯一的保護人。
但是，陳永仁卻突然發現，原來劉建明就是韓琛派到警方的臥底。
那麼，此時陳永仁就有極大的危險。
他並不知道，劉建明打著什麼點子。
正常來說，無論陳永仁是不是知道劉建明的底，劉為了穩妥考慮，一定會殺掉他滅口。
如果劉建明想整死他滅口，有一萬種方法。
畢竟陳永仁現在的身份是黑社會，又出賣了韓琛，無論黑道白道都想幹掉他。
其實別說陳永仁，即便是厲害很多的韓琛，最終還不是死在劉建明的槍下，被劉殺了滅口。
以劉建明現在的地位，陳永仁根本就玩不過他，幾乎是必死無疑。
事實上，即便陳永仁被殺後，劉建明又殺死另一個臥底滅口，最終劉仍然沒事，一樣回去做他的督查警長。
薩沙
我不同意有很多人說是因為導演或編劇的安排，其實細想想電影中已經給出暗示。
1.韓琛意識到自己人裡面可能有臥底的時候讓手下人填資料，傻強不會寫“保鏢”的鏢字所以永仁寫給他看，那麼這個事其實在永仁的腦海裡是由畫面記憶的，所以看到那個檔案袋一瞬間就意識到是自己寫字的那個。
2.資料收集好以後，韓琛約劉建明在電影院見面，把資料給了劉，之後永仁其實跟住了劉建明，電影中這段戲刻畫的也很精彩，只是永仁沒有看到劉建明的正臉，但永仁知道那個檔案袋就在警方的內鬼手裡，也就是說誰拿著這個檔案袋誰就是內鬼。這段情節裡還特意刻畫了劉建明走路時用檔案袋拍腿的細節。
3.黃SIR死後，劉建明嘗試用手機聯繫永仁，並在永仁的幫助下把韓琛殺了是想洗白自己，把自己的內鬼身份完全清理掉。這時候永仁則認為幫助破案後，這個聯繫他的警察會幫他恢復身份，也是即黃警官死後唯一知道他警察身份的人。
4.而在破案後，永仁來找劉建明恢復身份，起初兩人並無疑心，直到永仁在劉建明的辦公室看到那個檔案袋，至於為什麼一定要跑而不能假裝不知道，等恢復了身份再說，這裡麵包含著表面原因和心理層面兩層。
案子破了後，永仁肯定知道韓琛已經死了，這裡知不知道是被劉建明擊斃的電影沒有交代，但別忘了永仁雖然是臥底但也是個警察，他應該知道警察抓人如非必要或面對劇烈的暴力反抗是不會擊斃嫌犯的。韓琛的死本身就有問題，只是之前因為並不知道劉建明就是內鬼，所以沒有把兩件事必然聯繫起來，現在看到檔案袋，證明劉建明是內鬼同時擊斃韓琛的行動也是他指揮的，自然一瞬間就明白了劉建明是在滅口。
那此時滅口對象包不包括自己其實是不確定的，雖然永仁不知道劉建明的內鬼身份，但劉建明會不會也認為永仁不知道就不一定了。如果劉建明一心想洗白自己，就會把擁有這麼大不確定性的永仁除掉。那麼，等劉建明再回來完全可能帶回來一群CID，把他直接抓了，說是韓琛集團的主要人物，那麼在沒有任何其他人能夠證明永仁臥底身份的情況下，永仁的話肯定沒人相信，他將會入獄。甚至劉建明可能在他還沒入獄前就動手滅口然後把髒水潑到其它韓琛集團的成員身上。
所以永仁跑是必然的結果，保命的同時只有找到劉建明是內鬼的證據才能翻盤，他說的話才可能有人相信，而後續的劇情也確實是這麼發展的，只是還是沒有逃脫被滅口的命運。
未泯雙瞳
為什麼很多人覺得不該跑？
陳的跑恰恰就是整個電影的核心價值觀！出來混，遲早要還！
整個結局的反轉就是在那個公文袋，本來陳可以復職，當回警察，而劉則乾乾淨淨，知道身份的都死光了！兩個警察說不定成為好兄弟一起欣賞音樂！！這是我們以為的結局！！
反轉來了，檔案袋的出現，讓陳知道劉是那個黑警，然後二話不說馬上逃離警局！很多人回答說陳的跑是怕劉報復，我覺得不可能，這個時候劉是乾乾淨淨，相安無事，沒必要冒著風險去害陳而暴露自己，沒這必要！
也有人說陳為何不忍著，等恢復身份了慢慢搞死劉，問題就出在這裡，我認為陳等不了了，黃秋生的死讓他有點對生命沒那麼在意了！而且當時陳還不知道錄音帶的證據，凡事要快！出於正義，身份算什麼？
那陳為何走掉？其實答案在天台的對話就知道了！"因為我是警察"，整部電影的核心價值觀出來了！陳是一名警察，陳的最終目的不是為了當警察而當警察，而是為了揪出黑警，哪怕玉石俱焚！這個時候身份已經不重要了。黑就是黑，無法變白，這也是劉懇求陳未果的原因！陳不怕報復，他跑的目的就是蒐集證據揪出劉
電腦裡有酷狗
記得早年在看這部電影的時候，這個話題就不斷的被人提及，即便現在這個話題仍然持續，這個話題就是：當陳永仁發現那個公文袋，意識到劉建明可能是那個內鬼！他為什麼不留下來直接向其他警察指認劉建明是鬼，而是選擇立刻逃跑，最後還間接的導致劉建明刪掉了陳永仁的電腦資料，使他有口難辯！有這種想法的人，其實都存在一個問題，就是以果推因，或者說是。。。事後諸葛亮！
因為在這之前還有一個細節，劉建明殺死了韓琛，目的就是為了洗清自己的身份，所以一開始沒打算刪掉陳永仁的資料，而是計劃自己仍然以警察的身份存在，只不過中途發現陳永仁突然離開，以及自己的公文袋被人動過，這才動了誣陷陳永仁的想法，所以有些觀眾的看法就是，陳永仁根本沒有必要逃跑，他如果留下來，說不定自己的身份就直接澄清了！
但是要請大家記住，陳永仁並不是電影觀眾，而是一個臥底，他不可能提前預料事情的最終結果，更不可能遭遇任何事都非要以最樂觀的想法來對待，以他的特殊身份，在遭遇險情的時候，他要做的必須就是在第一時間內保護自己。
陳永仁把密碼告訴劉建明之後，劉建明起身到另一個辦公室去開電腦，這時候，陳永仁發現了劉建明的身份，這個時候他還會天真的認為劉建明會幫助他恢復身份嗎？也許存在這個可能，但如果不是呢？陳永仁必須也要考慮這個結果！假設說當時劉建明打開電腦後在第一時間刪除所有資料，然後回到辦公室，直接開槍打死陳永仁，回頭再跟外面的警察說他打開電腦後發現什麼資料也沒有。回去詢問陳永仁的時候，陳永仁拒捕，劉建明開槍自衛，請問事後警察是相信劉建明還是相信一個沒有身份的死人？前面說過陳永仁的身份是一個臥底，這個特殊職業也註定了陳永仁在遭遇險情的時候，首先必須要想到最壞的打算，而不是樂觀的認為事情最好的打算是什麼，如果陳永仁的是這樣的辦事邏輯，他根本堅持不了十年！
那也請大家不要忽略另外一個細節，就是之前兩個人在辦公室談話時，陳永仁很遺憾地對劉建明說，自己沒有找到那個內鬼，如果有一天找到絕對不會放過他，但是他沒有注意，這個時候劉建明的臉色已經開始變了，也許他的心裡仍然有幫助陳永仁恢復身份的想法，但同時置陳永仁於死地的想法也出現了，所以當隨後陳永仁發現劉建明的身份時，他會天真的認為劉建明是去幫助恢復他的身份了嗎？他必須要做最壞的想法！所以立刻離開也是最好的做法！
遼寧資深球迷
這是個反動的情節，說明陳永仁心中沒有黨和組織，沒有堅定的革命信念，憑一己之力想私下解決事情。
開玩笑的啦，說說正經的，如果我是陳永仁，更合理的做法應該等待劉建明回辦公室，然後引他到有其他警察的地方，突然發難用槍或者利器控制住劉，並大叫：“我是臥底，他是內奸！” 在雙方對峙的同時，大聲報出自己的警號及與黃Sir的關係，並公開劉是內奸的證據，即那個帶有他字跡的信封。如果警察做事足夠理智的話，就會將兩人同時控制起來開啟詢問和調查。這對陳其實是一個保護，可以給他機會去引導警方找出韓琛留下的錄音帶並作為進一步的證據。另外對劉也是一種牽制，使其無法採取行動擦屁股。謊言說再多還是謊言，只要警方刨根問底下去，加上證據的補充，其內奸身份一定會暴露。
當然，這樣的爛情節導演是不會拍的，一點懸念也沒有，梁朝偉的悲情角色被削弱了，劉德華的內心掙扎也沒得玩了，第三部也別拍了。所以梁朝偉必須跑，劉德華必須發現信封被動過，兩人必須跑天台上去耍帥，梁朝偉必須在電梯裡被爆頭。。。
江南漁夫
很多人都認為陳永仁當時不應該跑，也包括我。因為一旦跑了，陳永仁就等於捅破了與劉建明這層窗戶紙，接下來很可能會陷入被動，畢竟黃警官死了之後，只有劉建明知道自己的警察身份。 也正因“如此”，陳永仁必須跑。
因為唯一知道他警察身份的劉建明根本不會繼續做好事、做好人，他接下來一定會把陳永仁滅口，韓琛就是例子。所以，看到檔案袋上劉建明暴露目標的“簽名”後，陳永仁第一時間選擇跑掉，這裡面有兩層原因。
首先，沒有黃警官“保護”的陳永仁作為黑幫一員在警局並不會受到任何信任，劉建明很可能會“玩死”自己。在看到檔案袋的一瞬間，近十年的幫會經驗告訴陳永仁：此地不宜久留，先走為上再說，不走很可能被抓，且百口難辨。
第二個跑掉的原因則體現了陳永仁作為金牌臥底的專業素養。陳永仁知道韓琛與臥底的錄音帶放在哪，那裡面一定有韓琛與劉建明對話的錄音。所以，陳永仁從警局跑掉其實是第一時間去找錄音帶，找他唯一可以翻盤的機會。
南瓜報告
我來詳細和大家分析一下，當陳永仁發現劉建明是臥底時，陳永仁的思緒是焦慮的，他在考慮劉建明會不會給自己恢復身份，因為在陳永仁看來目前世界上只有劉建明知道他的身份，而此時劉建明得知檔案密碼就站在電腦前，萬一劉建明刪除自己的檔案，不恢復自己的身份，然後反咬自己一口，那陳永仁豈不是就命喪於警局！雖然劉建明當時是想給陳永仁恢復身份的，但是站在陳永仁的角度去思考，陳永仁不得不有這些顧慮！
同時，陳永仁也在思考如何將劉建明申之以法，於是綜合考慮還是先離開為好，先去搜尋證據，有一個細節不知道大家注沒注意到，就是韓琛在找陳永仁談話那次，就是問陳永仁跟了自己多久了那次談話，韓琛當著陳永仁的面把一個錄音帶放到了抽屜裡，機智的陳永仁注意到了，於是在他想要找到劉建明是臥底的證據時，他第一反應就是韓琛的辦公室裡的抽屜，陳永仁在韓琛的辦公室找到了錄音帶，於是陳永仁有了取勝的信心，他有了將劉建明申之以法的證據，同時，也可以用這個證據要挾劉建明將其身份恢復，就算要挾無法成功，至少可以將劉建明逮捕歸案，完成自己警察的使命!
於是，拿到證據的陳永仁給劉建明寄去了拷貝的錄音，並打電話將其約出來，要求劉建明恢復其身份，並準備逮捕劉建明！此時拿到證據的陳永仁要求劉建明幫自己恢復身份說明了之前我們的推測是對的，那就是之前陳永仁認為劉建明作為他心目裡的壞人不會輕易把自己恢復身份，而陳永仁目前有了資本，終於可以要挾劉建明幫其恢復身份，這就是陳永仁的整個心路歷程！
而我們作為觀眾，擁有天神視角，總會以天神視角考慮事情，因為我們得知劉建明起初是想幫陳永仁恢復身份的，此時陳永仁只要故作淡定，然後等到劉建明恢復自己的身份，自己恢復身份後以警察身份拿到證據，然後逮捕劉建明，這只是我們的一廂情願，試想，身為一個臥底警察的陳永仁，在得知劉建明就是臥底，並且在陳永仁主觀意識裡這個劉建明是個壞人，他怎麼能夠輕易相信劉建明幫他恢復身份呢？
再補充一些，陳永仁之所以將劉建明定義為壞人，因為陳永仁瞭解很多細節，第一，他知道是劉建明暴露了黃志誠的行蹤，導致黃志誠被韓琛團隊殺死，也是劉建明和自己合作幹掉了韓琛，這樣劉建明就穩住了自己在警局的地位以及守住了自己的臥底信息，這一切陳永仁在得知劉建明是臥底時腦海中是能夠想到的!
綜上，陳永仁離開是個合情合理的事情，以上純屬個人觀點，歡迎評論和點贊，覺得不錯的關注我啊！
草根說電影
個人認為陳永仁跑是對的，邏輯上說的通。
很多人說不該跑是因為站在上帝視角知道劉建明想做好人，但陳永仁不知道，兩人在辦公室裡的對話，陳永仁說:如果讓我找到那個臥底，我一定不會放過他。然後劉建明出去了，緊接著陳永仁就發現劉建明是那個臥底，試問換成是誰心理不慌？
陳永仁有足夠的理由可以認為:他去解鎖我的資料，他是臥底，而且我剛才威脅了他，他要是刪了我的資料回頭來抓我，我怎麼解釋？跑吧，去拿韓琛的錄音回來我才能翻盤，而且要為黃志誠報仇。
所以陳永仁站在自己的角度，選擇跑是沒毛病的。
而且劉建明這人是真的想做好人嗎？縱觀無間道1和2，劉建明這人心黑手狠，自己得不到的不惜毀滅，比如瑪麗姐。他之所以要做好人，是因為他最開始一無所有，可是後面卻在“好人陣營”裡得到了自己想要的一切，事業有成，升職加薪，還要結婚，為了鞏固這一切，他迫不及待的要成為一個“好人”，所以他殺韓琛，殺那個同門臥底，都是為了徹底洗白自己而不是因為他想做好人。
無間道說的無間地獄，其實是劉建明一個人的無間地獄，因為他的“惡”，才墮入這個地獄，他做不成好人不是陳永仁不給他機會，而是他就是惡人。
短夢無憑
必須要跑，不跑就可能永遠沒人知道真相，那時，陳永仁不死也會生不如死。
沒看見檔案袋的時候，面對唯一知道他臥底身份的劉建明，最初陳永仁是非常開心的，因為三年又三年的日子他已經厭倦了。
這個文件袋，陳永仁記得很清楚，所以他在第一眼看見字跡的時候就馬上明白了，當時韓琛是在查臥底。
韓琛身邊有臥底的消息必然是韓琛在警局的臥底透漏的，也就是說如果這個檔案袋在警局被發現，那擁有這個檔案袋的警察，必然就是韓琛身邊的臥底。
那麼可不可以不跑呢，反正陳永仁也知道真相，也知道對方劉建明是韓琛臥底。
答案是不行，不跑自己肯定死。陳永仁作為警校當年最聰明的學生，又有多年臥底生涯，對危險的警惕性不是一般的高。
看見檔案袋的時候他就明白了。這是劉建明故意想把他引出來。為什麼一定是引出來，而不是想把他找出來繼續臥底行動或者恢復他的身份？
別忘了黃sir啊！黃sir是怎麼死的，陳永仁最清楚。那是韓琛和劉建明聯手想要把陳永仁引出來殺掉！
要是沒有傻強，自己早就被韓琛解決掉了。陳永仁要想活命，只能選擇跑！
另外還有一個原因是韓琛那裡一定還有錄音帶，必須馬上找到，這是陳永仁恢復警察身份的唯一機會，他必須跑。
陳永仁明白一切，找到錄音帶直接交給警方是不行的，所以他們約定在天台見面。約在天台見面，那是因為阿仁還想為黃sir報仇。
這就是無間地獄啊……
原創不易，請支持原創，私信或者關注我，我將為你提供一個不一樣的角度……
電影基本法
在《無間道1》裡面，韓琛被劉建明殺死在停車場之後，警察局對韓琛手下小弟進行了例行的登記和資料管理，陳永仁在登記過程裡發覺之前韓琛和他在警方臥底的人員串通，調查黑幫內部人員的文件袋出現在警察局劉建明的桌子上，察覺韓琛與劉建明一定有私下的聯繫。再聯繫到最近一段時間他追查韓琛在警察內部安插臥底的事實，陳永仁斷定劉建明就是韓琛在警察局內部的黑幫臥底。
反應過來以後，陳永仁迅速脫身，退出警察局。雖然陳永仁暗中身份是警察，但是當時知曉他真實身份的黃SIR已經被韓琛害死，警察系統裡留存的信息又掌控在機密辦公室裡，所以，明面上陳永仁一直是黑幫小馬仔。而劉建明雖然一直是韓琛的人，但是明面上身份卻是警察局督察。一旦雙方有所衝突，警察局內部其他人在不明真相的情況下，會本能的選擇相信劉建明的證詞。所以當時，在明面身份上，劉建明佔據了形勢優勢。陳永仁察覺韓琛其實控制不住自己安插的臥底，甚至陳永仁已經懷疑韓琛其實是因為臥底要掩蓋自己身份而反噬被殺的。
所以，知道臥底為了掩蓋身份已經開始殺人滅口。自己追查臥底身份已久，只差最後一步。而且對手已經察覺被人追查，所以，雙方一旦暴露本來面目，必然是不死不休的一次交鋒。而陳永仁碰巧看見文件袋上自己寫的錯別字，聯繫前因後果，在瞬間確定劉建明就是韓琛安插在警察局內部的臥底。
但是當時，兩個人的身份使得陳永仁不能直接揭露劉建明，為了保存自己，他必須首先脫離當時劉建明形勢佔優的警察局，免得被劉建明藉口其他事件困在警察局裡，喪失以後為自己辯白，以及證明兩個人真實身份的機會！而後，陳永仁將證據郵寄給劉建明妻子MARY，逼迫劉建明到天台與自己相見，完成了最後天台見的經典情節！
