第一世代：
1-3.傳說的鳥神奇寶貝：急凍鳥、閃電鳥和火焰鳥。它們棲息於關都地區，並分別代表一個季節（秋季除外）。
傳說的鳥最早出現在洛奇亞爆誕，居住在亞西亞島周圍。如果他們感到不安，只有海之神洛奇亞可以阻止它們，但是除非出現優秀的控制者，世界的毀滅依然無法防止。
4.夢幻&超夢
超夢有著與夢幻相似的遺傳結構，而超夢的意思則是在克隆夢幻的基礎上超越夢幻。超夢被認為是最強大的寶可夢。而是在位於七之島和橘子群島之間的新島上以及合眾地區誕生。前者由於自己的身世而迷失自我無法自拔，最終在小智一行人的幫助下悟出了生命的真諦；後者則幫助和自己有著同樣遭遇的蓋諾賽克特軍團脫離失去家鄉的痛苦，尋找新的家園，並且還在人類或其他寶可夢遇到危險時出手相救。
第二世代：
5-7.傳說的三聖獸：雷公、炎帝、水君。它們設計的原型派生於虎、獅、狼，涵蓋了陸上食肉動物。傳說很久以前，祭拜洛奇亞的鐘之塔由於電光而著起了大火，在這場火災中，有三隻普通的寶可夢被火燒死了。此時，鳳王現身，讓它們重生，並賦予它們強大的力量。當主角在燒焦塔下將它們解放後，它們將遊走於城都各地，有的還到了臨近城都地區的關都地區去。
8-9.傳說的大型鳥寶可夢：鳳王和洛奇亞。傳說中鳳王與洛奇亞分別棲息於鈴鐺塔和鍾之塔上受人朝拜，但自從鍾之塔大火後，它們因為對人類的失望而離開了圓朱市。洛奇亞從此居住於漩渦列島的深處，被當地人稱為海神。在傳說中漩渦列島便是被洛奇亞用電光將其劈成4塊的。鳳王則不知去向，它派出傳說的三聖獸來觀察人類。傳說直到一天人類重新得到它的信任時，它就會回到鈴鐺塔上。
在動畫中，鳳王出現在了動畫首作的最開頭。當時可能由於鳳王的設計尚未完善，全身都是金色，所以也有說法稱其為異色寶可夢。但是在這之後，除了引領小智前往新的地區之外，鳳王的劇情較少。
第三世代：
9-11.超古代寶可夢：烈空坐，固拉多和蓋歐卡。繼代表萬物復甦的天空之神鳳王和孕育生命的海洋之神的洛奇亞之後，第三世代出現了直接代表天空，陸地和海洋的三隻傳說的寶可夢：烈空坐，固拉多和蓋歐卡。固拉多和蓋歐卡的原型從樣貌來看，像是甲龍和虎鯨，分別代表陸地和海洋。烈空坐的原型是傳說中的生物飛龍，代表天空，也代表調和。相傳當陸地與海洋相互碰撞之時，碧綠色的光芒將從天而降，平息海洋與陸地的憤怒。憤怒被平息後，固拉多便會沉睡於火山之底，蓋歐卡會沉睡於深海之淵，而烈空坐則歇息於天空之柱。
12-14.永恆的寶可夢：雷吉洛克、雷吉艾斯和雷吉斯奇魯。傳說中它們由雷吉奇卡斯所分別用岩石、寒冰、鋼鐵模仿自己的樣子而創造。三隻寶可夢守候著雷吉奇卡斯的沉睡。 它們的原型來自希伯來傳說中的魔像，分別象徵著史前三大時代的石器時代、冰河時期和鐵器時代，身體上的不明的圓形點狀圖案或許是它們的眼睛，這可能與盲文有關。它們在電影中最早登場於夢幻與波導的勇者 路卡利歐中的世界初始之樹。
14-15.無限寶可夢：拉帝亞斯和拉帝歐斯。在電影《水都的守護神 拉帝亞斯和拉帝歐斯》中，拉帝亞斯和拉帝歐斯是水都奧多馬雷的守護神，與心之水滴有很強的連接。它們保護心之水滴避免被桑娜和莉安偷走。
第四世代：
16-18.湖中的傳說寶可夢：由克希、艾姆利多、亞克諾姆。它們分別棲息在睿智湖、心齊湖和立志湖。根據傳說，它們分別代表知識、情感和意志。
在動畫中，艾姆利多、亞克諾姆、由克希以影子出現分別出現在《出發！雙葉鎮到真砂鎮！》、《
激戰！各自的對戰！》、《由克希之影！》，分別由小光、小智、小剛看到了它。在《亞克諾姆、由克希、艾姆利多！》中，它們被銀河隊僱傭的J捕獲，小智、小光、小剛把它們釋放，阻止赤日召喚出帝牙盧卡與帕路奇亞。19-21.時空神話的寶可夢：帝牙盧卡、帕路奇亞和騎拉帝納。傳說中它們由阿爾宙斯所創造，從渾沌的蛋中誕生。帝牙盧卡據說是學會時間的寶可夢，被稱作時間之神。當帝牙盧卡的心臟跳動時，時間就會流逝。帕路奇亞據說是學會空間的寶可夢，是操控空間的神。隨著帕路奇亞的每一次呼吸，空間變得更加安定。騎拉帝納據說是掌管反物質的寶可夢，它從毀壞的世界來到精靈寶可夢世界時，會從起源形態改變為別種形態。
帝牙盧卡和帕路奇亞居住於時空的裂縫之中，而騎拉帝納則被驅逐於毀壞的世界之中，在那裡靜靜地凝視著原來的世界。傳說時間與空間相遇時將會互相殘殺，世界將會崩壞，唯有播放時空之歌奧拉席翁才能阻止它們。
22-23.新月與美夢：克雷色利亞，傳說在達克萊伊出現之時，克雷色利亞就會出現並驅散它的惡夢。人們只要帶著克雷色利亞的新月之羽就不會做噩夢。
24.席多藍恩：傳說中帝牙盧卡與帕路奇亞曾有過一次大戰，戰鬥時迸出的碎片落下來誕生了席多藍恩。在電影阿爾宙斯 超克的時空中，席多藍恩暫時被奇辛控制，後來它在希娜和達摩斯的心靈交流下反過來對抗奇辛。寶可夢巡護員！席多藍恩救援作戰!!中為救援任務的一部分。
25.雷吉奇卡斯：據說雷吉奇卡斯是拖動了大陸的寶可夢，用特殊的冰山、岩石和熔岩製作出了永恆的寶可夢們。
在電影中，雷吉奇卡斯阻止冰山摧毀天意村。雷吉奇卡斯被寶可夢獵人J強制喚醒，強制喚醒的雷吉奇卡斯氣到發狂開始暴走，之後被小智一行人和神代給阻止。
第五世代
26-28.道之三龍：捷克羅姆、萊希拉姆和酋雷姆。動畫中，酋雷姆能自如運用捷克羅姆和萊希拉姆的能力，被稱為史上最強的龍屬性寶可夢。捷克羅姆將力量借給相信理想的人；萊希拉姆將力量借給相信真實的人。捷克羅姆在電影精靈寶可夢電影中登場；萊希拉姆在電影精靈寶可夢電影中登場；酋雷姆在電影酋雷姆VS聖劍士 凱路迪歐中登場。
29-32.聖劍士：勾帕路翁、代拉基翁、畢力吉翁以及幻之寶可夢凱路迪歐。
勾帕路翁是聖劍士中的隊長，據說心是用鐵做的。它們在酋雷姆VS聖劍士 凱路迪歐登場。
33-35.傳說的三雲神： 傳說的三雲神是龍捲雲、雷電雲和土地雲的統稱。
第六世代
36-38.傳說的氣場寶可夢：哲爾尼亞斯、伊裴爾塔爾和基格爾德。
哲爾尼亞斯是生命寶可夢，當頭上的角閃著七色光時就會分享永恆的生命，所經之處將會生出花草。
伊裴爾塔爾是破壞寶可夢，閃著紅色光芒時就會吸取生物的生命，化為一個繭沉睡在隱秘的地方。它們在破壞之繭與蒂安希中登場。
基格爾德在Z爆炸誕生！卡洛斯的潛伏者!!首次登場。它能隨意轉換為五種形態：細胞、核心、10%形態、50%形態以及完全體形態。其中核心分為兩種：一種為紅色核心；另一種為藍色核心。它擁有特性氣場破壞，能夠破壞哲爾尼亞斯和伊裴爾塔爾產生的氣場。
第七世代
39.屬性空和銀伴戰獸
屬性：空是為了要對抗究極異獸，在以太樂園的秘密實驗室A以神話中流傳下來的寶可夢之力量為目標而被創造出來的。創造之初的代號是Ｂ（Beast）Ｋ（Killer），它由人工設計的生物骨骼作為骨骼原型，全屬性細胞作為遺傳基因原型，並加載了由神奧地區水脈圖書館回收的資料開發出的ＡＲ系統，此時的暫定名為屬性：滿。但在進行3次原型測試後，3只個體都與ＡＲ系統發生排斥反應，開發者為其裝上了用來緩和ＡＲ系統排斥反應的控制面罩，同時也使ＡＲ系統無法啟動。開發者凍結所有個體，並將名字更改為屬性：空。
當屬性：空遇到值得信賴的同伴後，依靠自己的意志力破壞了束縛的面具，進化成為了銀伴戰獸，這個名字是由第一個讓“屬性：空”進化成這個樣子的少年來取的。銀伴戰獸從沉重面具的束縛中得到解放，速度因此顯著提升；它還可啟動“ＡＲ系統”，通過存儲碟來改變自己的屬性
40-43.阿羅拉島嶼守護神
守護神是指阿羅拉地區的四個島嶼中被稱為守護神的四隻寶可夢：卡璞・鳴鳴、卡璞・蝶蝶、卡璞・哞哞和卡璞・鰭鰭。被守護神選中的人，被稱為島嶼之王或島嶼女王，負責管治阿羅拉地區的各個島嶼。
44-48.傳說的宇宙寶可夢
傳說的宇宙寶可夢是從究極空間裡到來的寶可夢科斯莫古、科斯莫姆、索爾迦雷歐、露奈雅拉和奈克洛茲瑪的統稱。科斯莫古在古代時被稱為星之子，由古至今只有極少數人知道它的存在，非常弱小。
科斯莫姆是科斯莫古進化後的樣子，在古代時被稱為星之繭，阿羅拉的國王出於對它的崇拜而建造了祭壇。
在祭壇上為科斯莫姆獻上太陽之笛或月亮之笛所奏響的美樂，就會啟動儀式讓它進化為索爾迦雷歐或露奈雅拉。
傳說中索爾迦雷歐和露奈雅拉從天空中的空洞裡來到阿羅拉地區，賜予島嶼守護神Ｚ力量，令守護神臣服於它們。索爾迦雷歐自遠古時代起，作為太陽之使者備受崇拜，古人以敬畏的心稱之為“吞噬太陽之獸”。露奈雅拉自遠古時代起，作為月亮之使者備受崇拜，古人以敬畏的心稱之為“邀引月亮之獸”。而奈克洛茲瑪擁有可以控制光的能力，光是他的能量源，性格非常粗暴，只要有人接近就會用激光進行攻擊。它曾經從天空上出現，奪走了索爾迦雷歐／露奈雅拉的光，致使世界被黑暗包圍。
49.創世神阿爾宙斯。阿爾宙斯是一隻白色，外形近似羊駝、麒麟或半人馬的寶可夢。據傳說，阿爾宙斯有1000隻手。
阿爾宙斯有18種不同的形態，沒有攜帶道具或攜帶其他道具時是一般屬性，在攜帶石板或屬性Ｚ純晶時會變化為道具對應屬性的形態，每種形態只有外形顏色會根據其屬性而有所不同。
古代的一些史實顯示，阿爾宙斯一直在關照並保護寶可夢星球，並從流星雨一類的浩劫中拯救過人類。阿爾宙斯也會對向其示以尊敬和感激之情的人們表示同等的善意。阿爾宙斯很討厭被欺騙，並會在被背叛和欺騙時訴諸暴力。阿爾宙斯在為被其認為是朋友之人欺騙時，會埋藏怨恨。
如果全部的神獸一起打一架，其中最強的寶可夢會是誰呢？
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