五十個三體時後，質子的二維展開第二次進行。這一次，地面上的人們很快看到了異兆，當聚變發電站的散熱片發出紅光後，在加速器的位置上，突然出現了幾個巨大的物體，都呈很規則的幾何形狀，有球體、四面體、立方體和錐體等，它們的表面色彩很複雜，細看發現原來是根本沒有色彩，幾何體的表面都是全反射的鏡面，人們看到的只是被映照的行星表面扭曲的圖像。“這次成功嗎？”元首問。科學執政官回答：“元首，這次仍不成功，我得到加速器控制中心的報告，這次少減了一個維度，目標質子被展開成三維。”巨大的鏡面幾何體以很快的速度繼續湧現，形狀也更加多樣化，有環狀和立體十字形，甚至還出現了一個類似於莫比烏斯帶的扭環。所有幾何體從加速器的位置飄移開去。約半個三體時後，這些幾何體佈滿了大半個天空，像是一個巨人孩子在蒼穹中撒了一盒積木。幾何體反射的陽光使地面的亮度增加了一倍，且閃爍不定，巨擺的影子在這投到地而的天光中時隱時現，左右搖擺；接著，所有的幾何體開始變形，漸漸失去了規則的形狀，像受熱融化似的。這種變形愈演愈烈，變化的形狀越來越紛亂複雜，現在天空中的東西不再使人聯想到積木，更像是一個巨人被肢解後的肢體和內臟。由於形狀的不規則，它們散射到地面上的陽光均勻柔和了一些，但其本身表面的色彩卻更加怪異和變幻莫測。在佈滿天空的這些雜亂的三維體中，有一些引起了地面觀察者們的特別注意，首先是因為這些三維體極其相似，再細看時，人們辨認出了它們所表達的東西，一陣巨大的恐怖感席捲整個三體世界。那都是眼睛！（我們不知道三體人眼睛的形狀，但有一點可以肯定：任何智慧生物對眼睛的圖像都是十分敏感的。）元首是少有的真正保持著鎮靜的人，他問科學執政官：“一個微觀粒子，內部的結構能複雜到什麼程度？”“那要看從幾維視角來硯察了。從一維視角看微觀粒子，就是常人的感覺，一個點而已；從二維和三維的視角看，粒子開始呈現出內部結構；四維視角的基本粒子已經是一個宏大的世界了。”元首說：“宏大這種詞用在質子這樣的微觀物上，我總覺得不可思議。”科學執政官沒有理會元首，自顧自地說下去：“在更高維度上，粒子內部的複雜程度和結構數量急劇上升，我在下面的類比不準確，只是個形象的描述而已：七維視角的基本粒子，其複雜程度可能已經與三維空間中的三體星系相當；八維視角下，粒子是一個與銀河系一樣宏大浩渺的存在；當視角達到九維後，一個基本粒子內部結構的數量和複雜程度，己經相當於整個宇宙。至於更高的維度，我們的物理學家還無法探測，其複雜度我還想象不出來。”元首指指太空中那些巨大的眼睛，“眼前的事情是不是表明，被展開的質子所包含的微觀宇宙中，存在智慧生命？”“生命這個定義，用在高維度微觀宇宙中怕不合適，更準確些，我們只能說那個宇宙中存在智能或智慧。這樣的可能科學家們早已預測到了，那樣複雜宏大的一個世界，如果沒有演化出智慧這樣的東西反倒是不正常了。”“它們為什麼變化出眼睛來看著我們？”元首仰望天空。那些太空中的眼睛是很精美的雕塑，栩栩如生，它們都看著下面的行星，目光似乎很詭異。“也許只是想顯示自己的存在吧。““那些東西都會落到地面上來嗎？”“不會的，請元首放心。即使落下來，與上次一維展開的細絲一樣，這些巨大的物體全部質量之和也就相當於一個質子而已，不會對我們的世界產生任何影響。人們要做的，只是使自己的心理適應這種奇觀而已。”但這次，科學執政官錯了。現在，人們可以覺察到，在佈滿天空的所有二維體中，“眼睛”們的移動速度明顯地比別的幾何體快，而且它們都在向著同一點匯聚。很快，兩個眼睛相遇了，合為一體，合成後的形狀仍是眼睛，只是體積增大了。更多的“眼睛”加入合成體，後者的體積也在迅速增大。最後，所有的“眼睛”合為一體，這顆“眼睛”是如此巨大，彷彿代表著整個宇宙在盯著三體世界。它的眸子清澈明亮，中心映著一輪太陽，在廣闊的眼瞼上，繽紛的色彩如洪水般滾滾而過。時間不長，“巨眼”表面的細節開始變淡，漸漸消失了，“巨眼”變成了一隻沒有眸子的盲眼；然後，它的形狀開始改變，最後完全失去了眼睛的形狀，變成一個完美的圓。當這個巨圓開始緩緩轉動時，人們發現它並不是平面，而是一個拋物面，像從一個巨球上切下的一部分。軍事執政官盯著空中那個緩緩轉動的巨物，突然悟出了什麼，喊道：“元首，快，還有其他人，快進地下掩蔽室！”他指著上方，“它是……”“一面反射鏡，”元首冷靜地說，“命令太空防禦部隊立刻摧毀它，我們就在這裡看，哪兒也不去。”反射鏡聚焦的陽光這時己經投射到三體行星上，最初光斑的面積很大，焦點的熱量還不具殺傷力。這個光斑在大陸上移動著，尋找著目標。反射鏡顯然發現了首都這個最大的城市，光斑向這裡移來，很快將首都罩在它的範圍內。巨擺紀念碑下的人們只看到太空中出現一團巨大的光亮，這光強得掩去了空中其他的一切。與此同時，人們感到了一陣酷熱襲來。籠罩首都的大光斑在迅速收縮，這是反射鏡在進一步聚焦陽光，太空中的光團亮度繼續增強，使人們不能抬頭，光斑內的人們則感到熱度在急劇增加。就在酷熱已不可忍受之時，光斑的邊界掃過了巨擺紀念碑，一切都驟然停了下來。這裡的人們花了好一會兒才使眼睛適應了正常的光亮。他們抬頭首先看到的是一根頂天立地的光柱，呈倒錐形，太空中的反射鏡就是光錐的底部，光錐的頭部正刺中首都的中心，使那裡的一切都在短時間內變成白熾狀態，滾滾的煙柱從那裡騰空而起，被光錐的不均勻熱量引發的龍捲風則形成了另外幾根接天的塵柱，圍繞著光錐扭動舞蹈著……幾團耀眼的火球在反射鏡的不同部分出現了。它們的顏色與反射鏡發出的光芒不同，是藍色的，這是三體世界太空防禦部隊發射的核彈在目標上爆炸。由於爆炸是在大氣層外進行的，聽不到聲音。當這幾團火球熄滅時，反射鏡上出現了幾個大洞，然後整個鏡面開始撕裂，最後破裂成十幾塊。與此同時，死亡光錐消失了，世界重新回到正常的光亮中，人們一時間覺得一切像月夜般昏暗。那些已失去了智能的碎塊繼續變形，很快與太空中其他的幾何體混在一起不分彼此了。 《三體1：地球往事》中，三體人二維化質子失敗導致質子多增加一個維度而出現的神級文明。三維碎塊變成“眼睛”，觀察到三體星球上的首都， 打算用反射鏡聚焦太陽光來毀滅首都。最終被三體太空防禦部隊用核彈消滅。
這顆質子上的智慧文明在自己的宇宙即將被毀滅時，迅速反應，將自己的世界匯聚成一個反射鏡，並探測到外部世界上的敵人，利用太陽光來反擊，對比他們的世界大小，已經超越了一般意義上的神級文明。
對質子文明而言，三體人是他們的上帝，可以把他們的宇宙任意的搓圓捏扁，最後文明毀滅，宛如螻蟻。
在宇宙要被上帝（三體人）毀滅時，或者說他們的宇宙已經降維打擊分崩離析了，而他們的對策，竟然是動員起整個宇宙的力量，決意弒神，並且還幾乎成功了。而弒神的方式是擒賊擒王，打算直接燒死三體人的領袖，這說明他們甚至摸清楚了三體人的社會權力結構。
至於歸零者，終歸和人類屬於同一個層次，都在一個果殼裡苟延殘喘。而從這個角度來說，質子文明則更加強大，已經能夠觸及果殼外的世界，並彰顯其存在。
操作宇宙空間形態攻擊宇宙外的目標，這是三體人、歸零者、人類絕不可能做到的。而質子文明在認知的範圍已經跳脫“宇宙”這個黑箱了。
大自然真的是自然嗎？話說回來，我們的宇宙會死亡，會熱寂，會降維，到底是一種自然現象，還是宇宙之外一群鼻涕蟲在玩對撞機？
相比我們自己，宇宙毀滅時，只會自相殘殺，坐以待斃，搞什麼迴歸運動，還不是被聖母的“五公斤”所毀滅……
所謂文明的進步，無外乎就是探索認識世界，而質子文明已經走到了他們這個世界的盡頭，看到了殘忍的真相。
我們的宇宙亦未嘗不是一粒塵埃？如果有朝一日，宇宙轟然崩塌，人類能否注視著宇宙外的眼睛，發出怒吼？
質子文明才是真正的“日天男兒”。宇宙要毀滅了，他們說，老子不服，把上帝找出來，然後咱們一起懟死他！
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