在離開國際米蘭之後，巴喬拒絕了一些歐洲豪門的邀請，成為了佈雷西亞的一員。雖然這支球隊在巴喬加盟之時，只不過是一支名不見經傳的球隊，但他在那裡得到了與自己才華匹配的尊重，並且也將球隊帶到了一個新的高度。thesefootballtimes作者James Kelly就講述了巴喬在佈雷西亞的那段時光。
一名球員職業生涯最重要的時刻，是他替補出場的時刻，這樣的說法可能確實對這名球員有點兒不敬。然而對於朱塞佩-科盧奇，他職業生涯最重要的時刻，還真就如此——雖然他其實也是一名靠譜的中場球員，曾為卡塔尼亞、利沃諾和維羅納出戰超過300場比賽——2004年5月，朱塞佩-科盧奇在佈雷西亞對陣米蘭的比賽中替補出場，看起來這樣的出場方式其實也沒有什麼不同尋常，但他替換下的那名球員，是非常有份量的。
作為意大利歷史上最偉大的球員之一，巴喬在全場球迷的掌聲中走出了球場。馬爾蒂尼熱淚盈眶地擁抱了他。這是巴喬作為職業生涯的最後一幕，他在這裡為自己輝煌的22年職業生涯畫上了句號。
雖然佈雷西亞只不過是倫巴第一支名不見經傳的球隊，但巴喬在這裡度過了自己職業生涯最後四年的時光。在巴喬加盟球隊之前，佈雷西亞只不過一支在意乙聯賽安安穩穩過日子的球隊，他們在意乙聯賽中游刃有餘，但想要在意甲聯賽立足，還有一些難度。不過在巴喬加盟球隊之後，佈雷西亞的情況很快發生了變化。
巴喬轉會佈雷西亞的舉動，起源於他在國際米蘭的一次爭吵之後。當時事態變得非常嚴重，以至於裡皮最終將巴喬送出了梅阿查。儘管當時巴喬還收到了一些其他歐洲國家的邀請，甚至是日本球隊的邀請，但巴喬最終還是決定留在意大利。1994年世界盃決賽中，巴喬踢飛點球，留下了無數遺憾，而他希望能夠彌補這一遺憾，希望完成一次救贖。巴喬渴望再出現在世界盃的舞臺上。
當時巴喬收到了來自巴薩、那不勒斯和烏迪內斯的報價，雖然這些轉會談判最終都因為種種原因宣告破裂，但在所有人都覺得巴喬將前往雷吉納之時，佈雷西亞的主教練卡洛-馬佐尼突然殺出，試圖截胡雷吉納。經過幾次電話，以及對巴喬的登門拜訪，最終佈雷西亞搶下了巴喬，雙方簽署了一份為期兩年的合約。
起初，人們或許會覺得佈雷西亞簽約巴喬，是一次失敗的嘗試。佈雷西亞將繼續走自己的老路，在賽季大部分時間裡為保級而奮鬥，而巴喬則會繼續忍受傷病的困擾。巴喬直到2001年2月底才收穫了自己在佈雷西亞的首粒進球——他在佈雷西亞2-2戰平佛羅倫薩的比賽中攻入兩球，產生了巨大的影響力。特別是他的第二粒進球，那正是他標誌性的任意球破門。在比賽結束前20分鐘，巴喬打球門上角，佛羅倫薩門將托爾多毫無還擊之力。
儘管如此，接下來的三連敗還是讓佈雷西亞不得不重新考慮降回意乙的問題。巴喬需要證明自己的到來，是能夠為球隊做出改變的。在佈雷西亞對陣尤文圖斯的比賽中，以租借方式迴歸佈雷西亞的皮爾洛和巴喬完成了一次精妙配合，最終幫助球隊在比賽第86分鐘攻入一球。皮爾洛長傳球找到巴喬，後者得球后順勢突破范德薩，將皮球送入空門。
接下來的5輪比賽中，巴喬則是接二連三攻破了對手大門，幫助球隊拿到了13個積分。在這5輪比賽中，巴喬不僅僅是對陣萊切上演了帽子戲法，還在對陣老東家國際米蘭之時攻入制勝進球。最終，那個賽季的佈雷西亞拿到了聯賽第8名——這是球隊歷史最佳成績。同時因為亞特蘭大拒絕參加國際託托杯的比賽，佈雷西亞還得到了參加國際託托杯的機會。此外，巴喬還帶領佈雷西亞殺入意大利杯四分之一決賽——儘管他們在四分之一決賽中輸給了最終冠軍佛羅倫薩，但巴喬的表現真的非常出色，他刷新了意大利杯的助攻紀錄（10次）。
在個人榮譽層面，巴喬贏得了2001年的金蓋蘭獎（由《體育戰報》評選出的意甲賽季最佳球員）。同時巴喬還獲得了那一年的金球獎提名——最終排在第25位，排名比巴蒂斯圖塔和內德維德還要高。
在皮爾洛迴歸國際米蘭之後，佈雷西亞簽下了瓜迪奧拉來頂替。而巴喬對瓜迪奧拉產生了極大的影響，後來瓜迪奧拉甚至將巴喬稱之為自己共事過的最好隊友。毫無疑問，瓜迪奧拉並非信口雌黃：2001/2002賽季的巴喬延續了此前出眾的狀態，在前9輪比賽中攻入8球，在佈雷西亞對陣亞特蘭大的比賽中甚至還上演了帽子戲法，幫助球隊3-3戰平對手。然而在那之後，巴喬再次遭受傷病的襲擊，11月到次年4月期間，他因為十字韌帶撕裂的問題，僅僅獲得了74分鐘的出場時間。與此同時，佈雷西亞後防大將維托里奧-梅洛因為車禍喪生，使得球隊成績一落千丈，球員狀態也低迷不振。所幸巴喬及時復出，再次扛起了球隊大旗。
在那個賽季最後幾場比賽中，巴喬以替補身份完成復出，頑強地帶領球隊前進。他首先是在佈雷西亞對陣佛羅倫薩的比賽中梅開二度，幫助球隊3-0戰勝對手，而後又在收官戰中再次幫助球隊3-0擊敗對手：在這場佈雷西亞對陣博洛尼亞的比賽中，佈雷西亞在比賽第70分鐘獲得點球，雖然巴喬主罰的點球被帕柳卡拒之門外，但他抓住了補射良機，最終幫助球隊將比分擴大為3-0。在巴喬攻破對手大門之之後，他如同解除了心魔一般，飛奔到場邊，與球迷們瘋狂慶祝。
原本巴喬想在2002年世界盃結束之後就宣佈退役，但在被特拉帕託尼排除國家隊大名單之後，巴喬決定再戰一年。此前巴喬決定繼續留在意大利，就是希望有朝一日能夠再度披上國家隊的戰袍，然而落選出徵世界盃的大名單，讓人們覺得他堅守亞平寧的決定是錯誤的，但對於佈雷西亞來說，巴喬的留守絕對是他們的幸事。巴喬並沒有因為被國家隊冷遇而一蹶不振，他在2002/2003賽季再度單賽季進球上雙，並最終幫助球隊拿到了聯賽第9名的好成績。
同時，也就是在這個賽季，巴喬攻入了他自己所認為的，整個職業生涯的最佳進球。在佈雷西亞對陣亞特蘭大的比賽中，巴喬接史蒂芬-阿皮亞在中場附近的傳球，而後傳球給盧卡-託尼。後者在對方兩名防守球員的圍堵之下成功完成突破，並傳球找到了巴喬。出人意料的是，36歲的巴喬在得球之後並沒有進行突破，而是順勢直接起腳，皮球在空中劃出一道美妙的弧線，擦著橫樑飛入亞特蘭大的大門。那真是一個美妙的時刻，只有巴喬這樣真正的球場藝術家才能夠用這樣的方式取得進球。
2003/2004賽季是巴喬效力佈雷西亞的最後一個賽季，他在這個賽季幫助球隊最終排在了積分榜的中游。在佈雷西亞2-2戰平帕爾馬的比賽中，巴喬在最後時刻為球隊扳平比分，而這粒進球也是他在意甲的第200粒進球。面對帕爾馬四名防守球員，巴喬充分展現出了自己的盤帶技巧，輕鬆突破後左腳推射破門。在巴喬破門得分之後，他的隊友們紛紛脫下球衣表示敬意，而主場球迷們也全部起立鼓掌，為這位意大利球星送上最後的祝福。
幾周之後，巴喬則是為佈雷西亞攻入了自己職業生涯最後的進球，那也是他在佈雷西亞主場的絕唱。比賽第89分鐘，巴喬接到隊友的傳球，扣球晃過拉齊奧後衛費爾南多-庫託之後，直接打球門遠角得分，幫助球隊2-1擊敗對手。取得進球之後，巴喬的慶祝動作或許會讓人們想起曼聯過往坎通納：他靜靜站在原地，張開雙臂，為過去四年間支持自己的球迷送上最後的禮物。
巴喬對於佈雷西亞這座工業城市的意義不言而喻，儘管他只在這支球隊效力四年，但他仍舊憑藉45粒進球，成為球隊在意甲聯賽中的最佳射手。而在巴喬掛靴之後，他的10號戰袍也被球隊封存，球隊以這樣的方式，紀念著巴喬對這支球隊所做出的貢獻。說起來，巴喬對於佈雷西亞的重要性，在他離開之後顯得格外突出。2004/2005賽季，缺少巴喬的佈雷西亞最終以聯賽第19名的成績降級。
或許對於巴喬來說，佈雷西亞的最後時光，足以為他的職業生涯畫上一個圓滿的句號。與效力於亞平寧豪門的時光不同，巴喬在佈雷西亞得到了與他才華相匹配的尊重。
加盟佈雷西亞之時，巴喬已然頭髮灰白，但他仍舊用出眾的實力告訴所有人，年齡，絕非他成為球隊傳奇的阻礙。
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