- 一級學科國家重點學科
武漢大學（5個）：理論經濟學、生物學、水利工程、測繪科學與技術、圖書館、情報與檔案管理。
華中科技大學（7個）：機械工程、光學工程、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、控制科學與工程、生物醫學工程。
- 二級學科國家重點學科
武漢大學（17個）：馬克思主義哲學、中國哲學、金融學、環境與資源保護法學、國際法學、馬克思主義基本原理、中國現當代文學、中國古代史、世界史、基礎數學、凝聚態物理、無線電物理、分析化學、地圖學與地理信息系統、計算機軟件與理論、口腔基礎醫學、社會保障。
華中科技大學（15個）：西方經濟學、高等教育學、生物物理學、微電子學與固體電子學、計算機系統結構、水利水電工程、病理學與病理生理學、內科學（心血管病）、內科學（血液病）、內科學（呼吸系病）、外科學（普外、）外科學（泌尿外）、婦產科學、麻醉學、勞動衛生與環境衛生學。
- 國家重點（培育）學科
武漢大學（6個）：憲法學與行政法學、思想政治教育、中國古代文學、法語語言文學、空間物理學、內科學（心血管病）。
華中科技大學（7個）：通信與信息系統、內科學（傳染病）、影像醫學與核醫學、兒少衛生與婦幼保健學、中西醫結合、基礎藥理學、管理科學與工程。
- 世界一流學科建設學科
武漢大學（10個）：理論經濟學、法學、馬克思主義理論、化學、地球物理學、生物學、測繪科學與技術、礦業工程、口腔醫學、圖書情報與檔案管理。
華中科技大學（8個）：機械工程、光學工程、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、計算機科學與技術、基礎醫學、公共衛生與預防醫學。
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