公益一類、二類的劃分依據主要是事業單位的職責任務、服務對象和資源配置方式等因素，二者的區別其實還挺明顯的。
區分公益一類還是公益二類，我們可以從以下幾點來看：
一、在資源配置方式上是否可以由市場進行配置。公益一類單位的性質決定，此類單位不適合由市場配置資源。比如基礎的科教文衛公益服務和基層公共衛生和醫療，都屬於此類。而公益二類則可以由市場部分配置資源，當然不能是全部，例如高校、環衛等部門。
二、在財政經費撥付方式上是全供還是差供。一般來說，財政全供的就是公益一類，財政差供的就是公益二類。因為公益一類是完全由財政投資舉辦的，沒有收費項目和生產經驗，自身也就沒有盈利能力，只能靠財政全額撥款來實現運轉。而公益二類則可以由靠自身的收費或者經驗活動獲得部分資金，剩餘部分由財政給予保障。
三、今後的改革方向不同。事業單位改革將“去掉兩端，保留中間”，兩端指行政類和經驗類事業單位，保留的則是公益服務類事業單位。今後事業單位僅保留公益服務職能，逐步強化公益屬性。在公益屬性上，公益一類更強，是重點強化的單位，因此下步的改革幾乎不受影響。公益二類則受影響較大，部分職能可能會進行剝離，部分機構可能進行優化整合。
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