石臼坨，位居樂亭縣濱海，總面積3133畝。植物覆蓋面積98%。共有植物56科、158屬、236種，具有三個特點：一是生有山區、平原、沿海的植物，均生長旺盛。二是草本和木本植物各佔一定的比重。其中木本46種，佔總數的20%。這裡只有古老的大樹，沒有參天的高樹，最高的樹沒超過8米。三是種群重點突出。佔優勢的有禾本科、菊科、豆科、薔薇科、藜科、蓼科6科、70屬、114種。佔總科數的10.7%，但種數卻佔49.6%，特別是禾本科有24屬、30種，種群優勢非常突出。由於有植被覆蓋，將這個華北第一大島、渤海明珠點綴得五彩繽紛，聲名遠播，成為河北省著名的風景旅遊區。
石臼坨的植被因其生長習性分為疏林區、荒草區和鹽生植物區。疏林區分為高燥沙丘疏林和疏林草地兩個地帶，總面積890畝。生長著喬、灌、藤本等樹木。
高燥沙丘疏林地以潮音寺為中心，面積較大，佔地519畝。有大樹、有小樹，最大的樹有8株。其一是絨花樹，在潮音寺內，基直徑55.7公分，扁圓形處64公分。在主幹不高處分兩幹，東干直徑粗39.5公分，西幹直徑34公分，高7.35米，樹冠非常大，佔地149.6平方米。其二是潮音寺東南方的大桑樹，基直徑粗61.4公分，在距地不高的主幹上分為兩幹，西幹直徑粗36.4公分，東干直徑粗33.4公分。樹高7.5米，樹冠佔地90.6平方米。兩幹似摟抱狀相併生長，人稱“鴛鴦樹”。其三是潮音寺以東的大杏樹，基直徑粗45.2公分，高6.35米，佔地54.6平方米，春花夏實，現生長依然旺盛。其四是潮音寺西邊的大榆樹，基直徑粗62.1公分，高6.9米，樹冠佔地63.9平方米。因其與周邊洋槐競爭失敗，大部分枝條死亡，僅活一個小樹枝。其五是旅遊餐廳前的小葉朴樹，基直徑粗48.4公分，高6米，樹冠佔地38.5平方米。小葉樸是石臼坨的珍貴樹種，現在人們又把它稱為“菩提樹”，就有神化的味道了。菩提樹在此甚多，成為石臼坨的一大特點，因而此島又名曰“菩提島”。其六是大杜樹，在大黃土崗（石臼坨的一地名）的東北側，基直徑粗40.7公分，早已死亡，僅有90公分高主幹矗立在原地，遺憾的是，原來的長像已無法考證了。其七是衛矛樹，基直徑21公分，高4.9米。此處衛矛科的樹木較多，其原因目前還沒有人能解釋清楚。其八是洋槐，直徑粗41.4公分，高8米。樹冠佔地52.8平方米。洋槐是後期所植，樹體高大，株數多，在喬木中佔重要位置。其它喬木還有柳樹、國槐、構樹、臭椿、白臘、銀杏、火炬，以及果樹中的梨、桃、李子等。
疏林草地佔369畝，分佈在海邊沙丘之處，以灌木較多，生長有酸棗、杜林、紫穗槐、毛櫻桃、白杜、多花胡枝子、歐李以及後期栽的月季、木槿、紫薇等。歐李最小，樹高只有30多公分，粗度3毫米左右，多數獨枝，生長在較矮的草叢中。
在兩個疏林地帶生有大量的藤本植物。有南蛇藤、粉背南坨藤，野葡萄、蛇葡萄、掌裂葉蛇葡萄、槓柳、多花薔薇、爬山虎、紫藤、木防己、凌霄、枸杞等。以朝陽庵舊址藤本生長最旺盛。在其它樹木中，藤本與其相互纏繞，雜草叢生，遊人難以步入。在朝陽庵遺址的酸棗灌叢中，有一株酸棗樹王，高4.5米，基直徑20.5公分，樹冠佔地13.8平方米。果熟季節，鮮紅的酸棗長滿樹，而連年豐收。在這貧瘠的沙地上長這麼大的酸棗樹需年代較久，若是栽於建朝陽庵時，那就太古老了，可謂“古樹結古棗，古味香全島”。
過去的石臼坨，人稱“上坨不見天，下島不見寺”，近年來由於種種原因，樹木逐漸減少，特別是大樹，破壞後在短期內難以彌補損失，雖建國後長期在這裡栽樹，但成效不大。仍是小樹多，大樹少；灌木多，喬木少；樹栽的多，成活的少，如1999年栽旱柳、火炬、柿子、合歡、桃、梨、李子、檉柳樹等4413株，當年成活率高，以後保存率少。2000年又栽垂柳、洋槐、合歡、銀杏、香椿、木槿、紫薇、爬山虎、凌霄、紫藤和各種抗寒葡萄等7477株，栽後發芽率很高，但保活率甚少。
在疏林地帶，林下共生多種雜草，其中碣石山上的一些草種在這裡廣佈，如粟草、黃背草、白羊草、結縷草、北京隱子草等。這裡也有在樂亭內地生長的草種，如畫眉草、牛筋草、馬唐、止血馬唐、狗尾草、稗草、鵝冠草、馬齒莧、莧菜、藜、濱藜、紅心藜、尖頭葉藜、獨行菜、雞眼子草、地錦、豬毛菜、地膚、牽牛花、風花菜、薺菜、刺菜、鐵莧菜等。特別是一些生長較弱的種群，如茴茴蒜、天門冬、石竹、細葉韭、麥瓶草、向荊、野大麻、假苜蓿、紫花地丁、車前、列當等等，大大豐富了疏林地帶的植被內容。
荒草區面積共有2324畝，佔石臼坨總面積的74%，處於疏林草地和鹽生植物之間，地勢平坦，間有部分呈沼澤狀態。這裡野草密集、生長旺盛。主要有白茅，面積最大，約佔草地的30%以上。此種草單獨生長，種性強、生長勢旺，密度極大，最高超過1米，比樂亭內地要高出很多，不用說人在其內行走困難，就是蛇也很難爬行，野兔也只能按它們事先踩出的道路行走。不知為何白茅在此處長這麼高，這麼旺。來到草叢，頓覺天蒼蒼，野茫茫，與海浪遙相呼應，如臨仙境。白茅稀疏處，混生各種野草。如苔草，株最高達1.46米，與白茅競爭生長。有的地方也與山野菀豆、海邊香菀豆、草木樨等共生。在含鹽量較高的地方，與賴草、鹼蓬混交生長。在較高燥的地方分佈有黃花蒿、濱蒿、茵陳蒿、冷蒿、白蓮蒿、野艾蒿、沙蓬、艾蒿等。荻草多分佈在沙丘之間的低窪處，株高達2米以上，密度較稀，穗子較大，成片的白穗迎風飄揚，構成石臼坨獨特景觀。野古草的分佈面也較廣，多集中在沙丘與海水交界的沙質土壤上，草質差，莖稈堅硬，根系發達，對保護沙丘、防止海水沖刷有巨大的作用。蘆葦集中生長在碼頭廣場以南、中坨以北的低窪地上，經常有積水，面積83畝，密集之處很少有其它野草共生，只有較稀的地方與扁杆簏草、兩歧飄拂草、細燈心草，碎米莎草、異形莎草、水莎草、球穗扁莎草、湖瓜草等混雜生長。
在草場之中還有多種野草，如小白酒草、雅蔥、各種苦蕒菜、播娘蒿、米口袋、委陵菜、朝天委陵菜、鵝絨委陵菜、翻白草、益母草、並頭黃芩、香蒲、馬藺等，花色鮮豔，萬紫千紅。
石臼坨還有鹽生植物區，佔地196畝，生長的植物有檉柳、鹽蓿（鹽地鹼蓬）、鹼蓬、獐茅、白刺、大米草、二色補血草、枸杞等。大米草是唯一能在海水中生長的禾本植物，二十世紀八十年代引入，栽在石臼坨南邊潮起潮落的沙灘上，對綠化、美化石臼坨周邊有重要作用，但繁殖較慢。檉柳是灌木，植株較矮，抗鹽鹼能力極強，粉紅色的花開在枝頭，在地上白鹼的襯托下鮮豔奪目。在石臼坨南蝦池旁有一株大檉柳，基直徑16.2公分，高3.2米，樹冠佔地11.9平方米，長這麼大樹需多少年仍是個謎。在白色的鹽鹼灘上，生長大量的鹽蓿，有的地方集中連片，紅綠相間，像毛毯一樣平鋪在大地上，幼嫩的枝葉可以食用，成為遊客的野味佳餚。
石臼坨上草本植物種類繁多，有的形狀非常相似，使人難以辨認。如菟絲子和無根藤都是黃色寄生型植物，區別很難，實際上，菟絲子是旋花科，菟絲子屬植物，植株矮小，黃色較淡。而無根藤是樟科，無根藤屬，植株粗壯，杏黃色。狼尾花和地膚的株形、葉形都不易區分，只有開花後，狼尾花是總狀花序，花大，白色，很美觀，屬報春花科；地膚屬藜科，一年生，穗狀圓椎花序，花小、外觀沒花的感覺，不美觀。濱麥和白茅都是禾本科植物，葉形難區別，人們誤認為是一種野草，但吐穗時，濱麥的穗像小麥就容易區別。狗哇花和阿爾泰狗哇花之別是：狗哇花舌狀花瓣多，阿爾泰狗哇花的舌狀花瓣少。豆茶決明和田皂角都是豆科野草，形狀相似，豆茶決明生長在高燥處，木質程度高，莖略帶紅色。而田皂角多生長在低窪潮溼處，莖綠色，木質化程度低。大刺菜和泥胡菜也很相似，只是大刺菜葉上有刺，泥胡菜葉無刺。蘿和鵝絨藤都是纏繞莖，葉形難區別，莖葉內都有乳汁，只是果形不同，蘿果卵圓形（老婆子針線包），鵝絨藤果羊角狀（俗稱羊犄角）。蒙山萵苣和鹼菀都開藍色花，株形非常相似，只是鹼菀有一輪舌狀花，藍色，而中央管狀花黃色就有區別了。山野菀豆和海邊香菀豆都是野菀豆，而山野菀豆植株高，多年生，海邊香菀豆植株矮。許多相似的野草，需仔細觀察，才能區分開來。
石臼坨是樂亭植物的寶貴倉庫，有多種植物由於人為和自然等種種原因，在樂亭內地很少發現或根本找不到了，但在石臼坨卻幸運的保存下來，如白頭翁，過去多分佈在坑邊、墳地，荒草崗等地，現在民戶墳頭都平掉了，荒地變了良田，白頭翁也不見了。其它如茜草、牛兒苗、北京隱子草、杭子稍、貓眼、合掌消、天門冬等在樂亭大地很少找到，但在石臼坨分佈廣，有的地方生長還很旺盛。在樂亭大地廣佈而石臼坨少見的野草也是存在的。如鴨拓草已成為田間重要雜草，野生性特強，連根拔起，暴曬數日，很難死亡，抗曬力僅次於馬齒莧，但在石臼坨只發現了幾棵。蒼耳在石臼坨也較少。應該指出的是有些植物在樂亭大地沒有發現，而石臼坨也很少，如苦地丁只發現1株，祁州漏蘆只發現兩株，彎曲碎米薺1株，徐長卿由多到少已不到10株。
石臼坨植被是藥材基地，但從藥用價值分析，有109種是比較有名的藥材。其中防風、補血草、槓柳、玉竹、黃精、列當、地黃、米口袋、野大豆、天藍苜蓿、獨行菜、旋復花、酸模等，藥用價值極高。槓柳根皮入藥，稱五加皮，治關節炎。玉竹治口燥咽乾、熱病傷陰、肺結核、糖尿病、心臟病。黃精治高血壓、腳癬。旋復花治平喘、鎮咳、化痰。列當補腎、壯陽、強筋骨。地黃滋陰、補腎、壯陽、強筋骨。補血調經。巴天酸模清熱解毒，活血散瘀。野大豆清肝火，解痘毒。彎曲碎米薺健胃止瀉。徐長卿治毒蛇咬傷、跌打損傷、蕁麻疹、帶狀皰疹、痛經。二色補血草治月經不調、功能性子宮出血、痔瘡出血、脾虛浮腫。鶴蝨能驅蟲等。
石臼坨植被中有101種顯花植物分佈各個角落。從早春到封凍都有鮮花開放，紅、黃、藍、紫、綠等五光十色，把整個海島打扮得繁花似錦。其中紫色的花最多，有千屈菜、紫花地丁、圓葉牽牛、附地菜等36種。千屈菜即能在水中生長，也能在地裡生長，株高50至70公分，最高可達1米以上。葉對生或輪生，有人稱它為水柳或對葉蓮。總狀花序頂生，花數朵簇生於葉狀苞葉內，花瓣6片，紫紅色，在微風中輕輕搖擺，給人以綠色叢中一點紅的感覺，十分美麗。開黃花的29種，有旋復花、鵝絨委陵菜、天藍苜蓿、黃香草木樨等。旋復花多集中連片分佈在草地上，形成大片的黃色圖案。蒲公英和苣蕒菜的花朵是黃色舌狀花，集中到花朵上使花瓣密集，豐滿、大方。柳穿魚的花更為奇特，秋季開花，總狀花序頂生，花冠淡黃色，長約1.5釐米，花管長，上唇矗立二裂，下唇平展，先端三裂，基部有橘黃色的附屬物伸出，整個花形好似怪獸，朝天張口，看起來又引人，又驚人，顏色搭配合理，造型獨特。陰行草是一年生草本植物，高30至80釐米，莖直立多分支，夏季開花，花集中在枝梢，成帶葉的總狀花序，花冠二唇形，鮮黃色，造型別致，美觀大方，巧奪天工。第三是開白花的有20種，有多花薔薇、地稍瓜、砂引草等。砂引草俗稱“禿老婆頂”，有“禿老婆頂，開白花，婆婆死了媳婦就當家”的農諺。此花芬芳味濃，揮發性強，老遠就聞到杏花氣味。第四是開紅花的有野百合、合歡、木槿、蘿布麻、濱旋花等11種。其中蘿布麻集中連片分佈在潮音寺的西南方向，多年生半灌木，株高近1米，聚傘花序頂生，花多數，粉紅色，花冠圓桶形，鍾狀，兩面具有顆粒狀突起，夏季開花，花枝招展。更奇特的是濱旋花，生長在海水中與海岸交界的沙土地上，植株矮小，花朵很大。米紅色喇叭狀的花朵，直徑足有5至6公分，約佔株高的四至五分之一，千百萬朵花集中到一起，與大海的波濤相互映襯，好似海水中盛開的鮮花，是石臼坨生態旅遊的一大景觀。野百合生長在沙丘上，數量不多，分佈零散，花紅葉綠，十分動人。花1至數朵頂生，下垂，6片花瓣反捲，雄蕊較長，突出花外，花葯紅色，造型好似蝴蝶飛舞，栩栩如生。開綠色花的有黃精、玉竹、合掌消、衛矛等，有的淺綠、有的深綠。
石臼坨另一大景觀還有野果。一是南蛇藤，在樂亭境域只有此處有，無攀著物時是灌木，叢生；有攀著物時是藤本，長可達十幾米。春季開黃色小花，聚傘花序頂生，秋結果黃綠色，特點是果實冬季開裂，包殼內杏黃色，有花的形狀。一蔟蔟密集生長在枝頭，長期不脫落，冬季在茫茫白雪襯托下，黃白鮮明，色彩動人。二是衛矛，夏季開白綠色花，常三朵花成聚傘花序生長於葉腋，果綠色，深四裂，成熟後紫紅色從基部裂開，種子外包橙紅色假種皮，非常好看。在無花季節，果實的色彩代替花的鮮豔，給人留下深刻的印象。第三是沙鑽苔草，植株很小，但果實很大，果球有乒乓球大小，與植株極不相稱，以大頭小身為奇花異草。四是天門冬，多年生草本，全身光滑無毛，葉退化成鱗片變為下彎的短刺。莖細長，有很多分枝，葉狀枝2至4個簇生，代替葉的功能，所以天門冬是無葉植物。漿果球形，成熟時紅色，佈滿在無葉的枝條上，在空中搖擺，遠遠望去，好像無柄之果懸掛在空間，分散在枝條周圍。
石臼坨還有很多觀賞與食用兼備的野果，六月中旬上島，看到的內容之一就是桑樹，果實有黑有白有紫，果軟、味美，吃在嘴裡，甜在心間。和尚栽的杏樹，個頭小，酸度大。酸棗佈滿全島，有很高的營養價值。“棗味甘無毒，安中養脾，補五臟，治虛損，除腸胃癖氣。”日啖一粒，紅顏常駐，吃酸棗野果是旅遊者獨特的享受。杜梨果實雖小，但吃起來入嘴很綿，口味中有酸有甜，有一種其它梨都不能代替的風土香醇味道。特別是歐李，樂亭原來只產於石臼坨，果實形狀像李子，個頭像大櫻桃，8月份成熟，鮮紅色，含鈣量很高，又稱鈣果。其它如野葡萄，白刺、龍葵、地稍瓜、茜草等，其野果味苦辣酸甜澀樣樣俱全。
石臼坨也有的雜草很討厭，如斑種草、鶴蝨、律草、鬼針刺、蒺藜等。鶴蝨的小堅果卵形，具有瘤狀突起，沿稜有兩三行錨狀刺，刺先端有鉤。鬼針草的瘦果線形，頂端具3至4枚生有倒刺的芒狀冠毛。律草的莖和葉柄密生倒鉤刺，人誤入這些草叢中，野果掛滿全身，刺的人疼痛發癢，受律草之害，患處紅腫多日不愈。
石臼坨的植被，豐富了島上生態內容，在這個環境裡，有利於大量野兔、野雞、野鴨等多種動物、鳥類、獸類，在這裡繁衍生息，在生物群落中既有沿海的特徵，又有高山平原的生物特點，是華北海域少有的景觀。
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