作者 萬瑜
基督教在公元1世紀中葉就已經傳播到了埃及。到了2世紀末，它已經到達了迦太基城周圍的地區。到公元4世紀，阿克蘇姆帝國（Aksumite，今厄立特里亞及埃塞俄比亞地區）被基督教化，努比亞的諾巴蒂亞、馬庫里亞和阿羅迪亞王國在兩個世紀後相繼建立。
伊斯蘭教在北非的傳播減少了基督教的規模和數量，只有亞歷山大東正教、亞歷山大科普特東正教和埃塞俄比亞東正教特瓦希多教會留存了下來。埃塞俄比亞教會有其獨特的宗教習俗和獨特的聖經教規，他們並不是歐洲傳教士工作的產物，而是在更古老的年代裡早期傳教士傳播的。（因為埃塞俄比亞的基督教關係，使得他們沒有被殖民，現在還是非洲最窮的國家之一，不知道是幸與不幸。）
相比在歐洲的緩慢傳播，早期基督教在北非的傳播快的讓人驚訝。由於在文化上受到羅馬的影響較小，當地仍然有自己崇拜的神。早期基督教發現了傳統宗教的影響，通過復活、來世、童貞女的出生，以及神可以被殺死後又復活的可能性。加上一個對羅馬帝國的統治心懷不滿的埃及，所有這些都與更古老的埃及宗教活動產生了共鳴。
在早期，基督教被羅馬政府視為異端，於是在抵抗者中迅速流行和傳播開來。羅馬帝國察覺後，進行了更加殘酷的鎮壓，但是這起到了相反的作用，基督徒皈依者活動變的更加隱秘了。
大體而言，羅馬人對其它宗教持寬容態度。他們允許乃至歡迎將埃及諸神迎至萬神廟。儘管他們覺得信奉一神論的猶太人另類，但仍多少給予了猶太人履行信仰的自由。所以公元66年前後的猶太人起義並非是宗教戰爭，而是為了反抗羅馬帝國不合理的稅收。
因為抗稅的原因，羅馬軍隊羅馬軍隊洗劫一座神廟，並屠殺6000名市民後。這次屠殺激起了整個地區的叛亂，駐守耶路撒冷的3萬羅馬士兵遭到偷襲，被迫撤離該地區。數千羅馬士兵被殺，他們的盔甲和武器被猶太起義軍奪取。隨後羅馬名將維斯帕西安率領軍隊圍困了耶路撒冷，並摧毀了它。在那之後，埃及的亞歷山大城成為基督教發展的重要中心。
大約在43年，福音傳道者馬克成為亞歷山大東正教的第一位主教。到2世紀末，聖經和禮拜儀式已經被翻譯成三種當地語言。蘇丹的基督教也在1世紀早期傳播，在6世紀建立在諾巴蒂亞、馬庫里亞和阿羅迪亞王國內的努比亞教會，並與埃及的教會聯繫在一起。
在3世紀初，亞歷山大的教會迅速擴張，有五位新的薩福利亞主教。亞歷山大的主教開始被稱為教皇，是埃及的高級主教。3世紀中葉，埃及教會在德西烏斯皇帝的迫害下遭受了嚴重的損失。許多基督徒從城裡逃到沙漠，當迫害平息後，一些人仍留在沙漠中作為隱士祈禱。
在穆斯林征服東羅馬帝國並統治北非之後，盛行了幾個世紀的天主教信仰在北非被終止了。但是直到14世紀前後，科普特教會仍然是埃及的主要信仰。這主要因為努比亞基督教王國的存在，這會有助於埃及基督教的生存。
羅馬天主教信仰在阿拉伯征服700年後，還從的黎波里到現在的摩洛哥地區持續了幾個世紀。也有證據表明，公元850年後，迦太基城外的天主教聖人墳墓還存在有宗教朝聖，當時在歐洲採用的歷法改革在突尼斯的土著基督徒中傳播，如果沒有與歐洲基督教接觸，是不可能的做到的。
當阿爾摩哈德和阿爾莫拉維德的穆斯林政權掌權時，當地的天主教教會受到了很大壓力，當權者要求突尼斯當地基督徒皈依伊斯蘭教。14世紀天主教檔案館的一封信顯示，北非仍有四位主教，到1830年，當法國作為殖民地征服者來到阿爾及利亞和突尼斯時，當地的天主教已經被消滅。
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