在池塘底部及中下層水體，處於塘底有毒有害物質向上浮升、水體中有毒有害物質向下沉積，從而在水底的交匯處形成一個特殊的層面。高密度養殖投餌多、排洩量大、藻類死亡、濫用絮凝性底改等因素導致該特殊層面發熱、發臭、泛酸，腐敗菌（弧菌或嗜水氣單胞菌）大量繁殖，生物和化學耗氧量大，亞硝酸鹽、氨氮等有毒物質嚴重超標，成為原生動物、細菌、病毒的滋生地，成為名副其實的“聚毒層”，又恰恰是對蝦的核心生活區。“聚毒層”如不及時消除，黑鰓、黃鰓、甲殼潰瘍、白濁偷死等各種對蝦病害則隨之而生。下面就造成蝦池水質、底質變壞的原因及改良底質的方法提出一些見解，供參考與交流。
造成底質變壞的原因
1．在高密度、高投餌量、低透明度養蝦模式下，大量的飼料殘餌、排洩物、浮游生物屍體等有機物不斷沉入池底，是造成水質、底質變壞最重要的原因；大量有機質的存在為池底厭氧性微生物大量繁殖提供了充足培養基。
2．養殖水深與增氧能力脫節造成底層溶氧不足，底泥發臭。水深1.5米以上的池塘僅有水車式增氧機，池塘底層溶氧會經常不足，有機物在厭氧狀態下分解增加了氨氮、亞硝酸鹽的釋放量。
3．增氧機安裝位置不當，未能與池壁形成合理的角度，導致大量有機物被帶到池邊死角，久了容易發臭。
4．砂質池塘因砂質顆粒較大，吸附氨等有害物質的能力較差，易發臭。
5．水較瘦或藻類老化的池塘，藻類光合作用差，溶氧低，導致有害物質降解速度緩慢，底泥容易發臭。
6．藻類含量高、透明度低、水色濃的池塘，會減弱中下層水體的光合作用，中下層水體產氧能力下降，同時藻類的新陳代謝導致死藻量較大，也會造成底質惡化加快。
判斷不良底質
1．池邊的角落有大量黃褐色泡沫，有異味，不易散開；黃褐色泡沫是水質變壞的表現，有異味證明已出現壞底。
2．料臺髒、底部附著膠著物或黑泥。
3．池底在光照強時升起大量氣泡或氣霧。
4．水質變得濃稠，風吹過水麵出現細密的水紋，證明水體的表面張力。
5．亞硝酸鹽含量顯著增高、藻類老化或水濃後突然倒藻。
如何改良底質
1．合理安裝增氧機安裝增氧機時應該使水流通過池塘的各個角落，儘可能將汙物帶到中間排汙口排出。有效促進排汙的增氧機排列方法是：將增氧機與池壁形成350角，沿池壁安裝，所造成的水流能將角落的汙物一起帶走，不留死角。
2．生物分解有機質、淨化水質和底質：通過對有機質的分解，可起到抑制致病菌繁殖，減少有機質的不可控耗氧，明顯改善底質和水質。
3．選擇合適時機對底部消毒：在底部有機質較多的水體，即使通過活菌分解也仍然有較多的有機質作為病源的培養基，故在中後期，根據池塘條件可7~15天對底部進行消毒，抑制致病源的繁殖。
4．合理改善塘底聚毒層，控制底質腐敗及亞硝酸鹽、氨氮等有害物質的超標。
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